Вирусные и эпигенетические влияния на CRSwNP

ПРЕДПОСЫЛКИ ИССЛЕДОВАНИЯ И ОБОСНОВАНИЕ

Хронический риносинусит (ХРС) может проявляться в виде Т2- и/или не-Т2-типов воспаления, независимо от наличия или отсутствия полипов носа (НП). Некоторые аспекты CRS, такие как формирование NP, связаны с эпигенетическими процессами. Многочисленные исследования подтверждают роль эпигенетики в развитии и хронизации других заболеваний T2, например. астма и аллергический ринит (North, Ann Allergy Asthma Immunol, 2011).

Понимание патогенеза заболевания T2 могло быть получено благодаря «реальному» опыту во время пандемии COVID19. Меры по сдерживанию распространения вируса, развернутые в 2020 г., предсказуемо снизили частоту наиболее распространенных респираторных вирусов, сократив инвазивные респираторные инфекции, а также обострения астмы и ХОБЛ, которые обычно вызываются вирусными респираторными инфекциями (Linden, Eur Respir Rev, 2019; Michael, Ann Allergy Asthma Иммунол, 2019). Неожиданно уменьшилось и хроническое воспаление верхних дыхательных путей. Хронический средний отит с выпотом и аденоидитом резко сократился, и более половины детей из списка ожидания на операцию были удалены исследователями из-за спонтанного улучшения. Это сопровождалось неподтвержденными наблюдениями о снижении числа обращений по поводу хронического риносинусита с полипозом носа (ХРСНН).

Таким образом, исследователи предполагают, что болезнь T2 представляет собой уникальный аспект спектра воспалительных заболеваний, при котором дисфункция развивается после взаимодействия с вирусным патогеном, поддерживающим стойкие эффекты через эпигенетические механизмы или хроническую инфекцию.

Подробный план исследования Текущее понимание патофизиологии болезни Т2 оставляет ранние этапы патогенеза в значительной степени необъясненными. Исследователи полагают, что болезнь T2 является результатом эпигенетического импринтинга, который снижает реакцию T1 на повреждение или патогены за счет нарушения компонентов передачи сигналов интерферона (IFN), что приводит к беспрепятственной передаче сигналов T2.

Кроме того, исследователи подозревают, что эта дисфункция вызвана вирусной инфекцией, которая может сохраняться в организме хозяина в латентной форме или продолжать оказывать свое влияние посредством эпигенетических модификаций генома хозяина. Следовательно, исследователи предлагают всесторонне охарактеризовать эпигенетические модуляции, присутствующие при воспалении T2, с акцентом на демонстрацию связи с вирусными инфекциями. Чтобы достичь нашей цели, исследователи будут характеризовать заболевание T2, комбинируя статус метилирования ДНК, доступность хроматина и профилирование экспрессии генов, чтобы определить гены и эпигенетические изменения, потенциально важные в патогенезе заболевания T2. Исследователи будут использовать массовые изменения в воздействии вирусов на общество, вызванные пандемическими мерами, в качестве уникального экспериментального условия, сравнивая современные результаты с биобанком допандемического материала. В дополнение к пролитию нового света на патогенез, определение эпигенетического и вирусного портрета заболевания Т2 улучшит новые диагностические и терапевтические цели и потенциально выявит вовлеченные вирусы.

Стратегия исследования Исследователи будут идентифицировать эпигенетические паттерны и вирусы, связанные с пациентами с CRSwNP T2. Воспользовавшись существующим и обширным биобанком клеток из образцов тканей и биопсии, исследователи будут сравнивать эпигенетику и вирусы, присутствующие до изоляции и во время пандемии у СВК и у здоровых пациентов. Популяция (подробно описанная в следующем разделе) включает здоровых людей, пациентов с ХРС, проходящих лечение в стадии ремиссии, и больных пациентов, перенесших эндоскопическую хирургию околоносовых пазух (ЭСС). Исследователи стремятся оценить равное количество представителей обоих биологических полов, чтобы проанализировать потенциальные различия. Размер выборки основан на предыдущем опыте транскриптомики. Это обсервационное исследование не потребует от пациентов никакого дополнительного лечения.

Экспериментальная дизайн

I) ТИП 2 И МЕТИЛИРОВАНИЕ:

Первичные эпителиальные клетки из образцов биопсии CRSwNP (N = 24) и контрольные первичные эпителиальные клетки носа от пациентов, перенесших эндоскопическую операцию на гипофизе (N = 16) Популяция: исследователи будут использовать замороженные диссоциированные клетки из нашего биобанка в самом раннем возможном формате (P0 или P1). для сохранения исходных вирусов и эпигенетических меток. Образцы полипов из T2 CRSwNP будут отобраны в соответствии с клиническим фенотипом вместе с анализом крови и гистологией.

II) ПАЦИЕНТЫ В РЕМИССИИ Методы. В экспериментах A, B и C будет использоваться следующий метод анализа образцов чистки зубов из носовой полости. (N = 36) A) Установление профиля вирома и метилирования в здоровых клетках верхних дыхательных путей. (N=12) B) Как выглядят здоровые пазухи при медикаментозном лечении (N=12) C) Работает ли уменьшение воспаления T2 с помощью дупилумаба за счет увеличения активности IFN или за счет снижения метилирования в пути IFN?

III) КАК ХИРУРГИЯ ВЛИЯЕТ НА ТИП 2? Первичный поперечный анализ, а затем сравнение с развитием через 4 месяца после операции Популяция: пациенты, перенесшие ЭСС по поводу CRSwNP, включая не менее 30% субъектов с чувствительностью к аспирину.

Фаза I: во время ЭСС (n = 24, плюс 6 для подтверждения чистки зубов) Методы: пациентам будет проведена биопсия переднего отдела решетчатой ​​пазухи. Они будут подвергаться оценке с использованием транскриптомных инструментов, включая мультиомы одиночных клеток.

Фаза II: 4 месяца после ЭСС (n=те же 24 парных субъекта. Та же группа пациентов будет оцениваться через четыре месяца. Эволюция заболевания будет оцениваться в соответствии со стандартами CSO HNS на «оптимальные», «субоптимальные» или «неприемлемые» результаты. Щетка будет использоваться для отбора проб и подвергаться тем же анализам, что и выше.