IPGx PILOT 全基因组测序扩展队列
德克萨斯 A&M 跨专业药物基因组学试点全基因组测序 (WGS) 队列
研究概览
地位
条件
详细说明
研究人员关注患者安全和 ADR，因为这些临床实践领域代表了重要的死亡原因，领先于许多公认的急性和慢性死亡原因。 虽然开药可以改变生活，但在处方药中选择更精确的方法仍然落后于现有技术。 一个人的药物反应可能因药物与药物或药物与食物的相互作用以及性别、年龄和疾病状况而异。 对于相同剂量的给定药物的反应存在高达 1000 倍的巨大人际差异。 遗传多态性有助于定义药代动力学和药效学特征，但这些见解尚未一致地纳入临床实践和护理标准。 近年来出现了一些药物管理计划，但这些计划主要面向依从性，仅有限地纳入基于药物基因组学的药物管理。 精准医学主张一种方法并不适合所有医疗护理。 在多慢性病管理和多药治疗管理中，护理的提供如何更接近靶心？
美国存在范围广泛的多药危机，尤其是在肾功能和肝功能经常衰退的老年人群中。 一项针对老年人的研究估计，潜在的肝细胞色素酶介导的药物相互作用的发生率高达 80%，老年人被认为更容易受到有问题的药物相互作用的影响。 传统上，多药治疗是指同时服用五种或更多药物。 据估计，有 1500 万 65 岁或以上的患者面临着这一挑战。 多重用药患者通常患有至少两种慢性疾病，近 50% 的老年人至少使用一种不必要的药物。 住院患者平均需要服用 5 到 8 种药物，疗养院居民中 40% 的患者使用的药物数量超过 9 种。 在一项针对认知能力下降或轻度阿尔茨海默病患者的研究中，88% 的患者符合多药治疗标准，抗胆碱能认知负担、药物与药物相互作用以及药物与基因相互作用都是这些人群中普遍存在的问题。 在越来越多的极端案例中，复方用药可能会导致大约 20 种药物带来接近 100% 的不良药物结果风险。 治疗方案中的药物数量越多，患者安全和临床结果受损的风险就越高。 二十分之一的综合用药门诊患者因不良反应而寻求医疗护理。 多重用药也与老年人住院有关。 多重用药与药物依从性、营养、尿失禁、日常生活活动减少以及身体和认知功能丧失有关。 跌倒次数的增加伴随着发病率和死亡率的增加。 从财务角度来看，复方用药的影响与医疗保健支出增加 30% 相关，也是超高医疗保健利用率的一个主要因素。 对观察健康数据科学和信息学数据集的分析表明，10% 的糖尿病患者、24% 的高血压患者和 11% 的抑郁症患者遵循的治疗途径在 2.5 亿病例中是独一无二的，这说明需要电子决策支持，用于标记患者特定护理计划引起的药物相互作用并实施纠正措施。
电子健康记录在互操作性方面仍然存在不足，存在重大缺陷，无法实现可以从整个提供者连续体中获取数据和决策支持的护理计划和药物管理。 在提供和完善精准和个性化医疗服务方面，这是一个次优的情况。 多药治疗和药物协调的临床负担通常会影响初级保健临床医生，他们在服务时可能没有必要的数据，这是多药治疗管理问题的根源。 应对多药治疗挑战的创新方法包括创建医疗管理诊所，重点致力于减轻多药治疗的成本和医疗负担，并系统地评估伴随药物改变、修改或停药而产生的增量临床变化。
利用包括医生、药剂师、护士、病例协调员在内的跨专业护理团队以及远程医疗和数字工具，研究人员可以吸引患者并获取疾病概况的表型、功能和社会决定因素等信息。 这些数据可以在访问之前作为可计算的可操作数据输入，以便更好地跟踪访问之间发生的情况（遵守护理计划或缺乏护理计划）。 研究人员认为，这些信息与预约时发生的情况一样重要，在多重用药的临床病例中尤其如此。 最后，利用跨专业药物基因组学 (IPGx) 护理模式，患者和提供者都可以更容易地获得这些信息。
研究人员正在开发护理决策支持方案和药物基因组学/药代动力学仪表板，以增强初级保健临床医生更精确地针对个体病例管理药物的能力，并且破坏性最小。 此外，电子病历、临床决策支持 (CDS) 和基因组测试数据格式之间的互操作性仍然是跨时间和不同医疗保健提供者重用 PGx 测试以及实施全基因组和全外显子组测序的障碍。 这些努力将告知在 IPGx 护理模型中使用的信息学平台上使用全基因组测序（仅在本研究方案下用于研究）的可行性。
该仪表板将对提供者和患者有用，有助于识别可能从主动药物管理中受益的临床病例，以确定那些可能没有反应的人和 ADR 风险较高的人。 仪表板将通过临床数据仓库不断增长的临床病例库来获取信息。 仪表板将生成并迭代完善以药物管理为中心的新型护理决策树（算法）。 数据结构和护理协议旨在实现临床活动的伴随和纵向观察（研究），以验证 ActX CDS 和仪表板作为以患者为中心的临床研究的有用工具。 理想的数据库将包括药物血液浓度（与本试点无关）、药物清单和其他可能影响药物使用和有效性的相关修饰数据。 这种方法还将提供一种方法来更多地了解药物依从性，并帮助系统地识别可能成为药物基因组学评估和长期参与药物管理计划候选者的患者。
这种通用方法可能会提出的具体问题：
药物水平接近零是否意味着不依从，或者患者是否广泛代谢药物，以致给药后血液或尿液水平变得不可检测？ 表型调查问卷与血液或尿液药物浓度测量相结合将回答这个问题。
是否需要制定方案来确定何时进行药物基因组学测试？ 由 ActX 平台提供支持的研究者数据平台可以验证这些决策的临床和成本效益。
药物基因组数据的最佳用途是什么？ 如果患者进行了药物基因组学测试，血液或尿液药物水平可能有助于完善有关相关酶途径代谢活性的知识，并有助于提出关键问题，以确定在多药治疗环境中什么构成了超载的 CYP P450 途径。
通过应用从药物管理咨询中获得的知识，在精神科领域中的不良反应是可以预防的。 例如，就抗抑郁药而言，在根据标准剂量和反复试验开始用药后，可能需要数周时间才能评估临床反应。 在精准药物管理场景中，提供者一开始就知道患者是否是相关 CYP P450 酶途径的超快速代谢者，并能够更好地识别所选药物并优化剂量滴定。 如果临床仪表板显示患者正在接受多种药物争夺共同途径，则也可以根据需要进行适当的药物调整。
这里使用的 ActX 是一个临床决策支持系统，包含数百万个相互关联的变异药物概念，这些概念相互关联以创建知识网络。 输入数据后，加权弧用于建立临床决策支持和鉴别诊断。 这为药物基因组学概况提供了一个潜在的强大环境，以创建精确的药物和给药方案工具，同时利用当前实践中的临床工作流程。 药物基因组仪表板包含在 ActX 平台内。
比较和对比 WGS 和基因分型
ActX 测试是在符合 CAP/CLIA 标准的实验室中进行的基因分型测试，用于复杂的实验室开发测试 (LDT)，以确保结果可用于 LDT 监管框架内的临床决策。 此类测试检查人类基因组中有限数量的特征，特别是近 400 种具有临床意义的已知遗传变异。 ActX 测试的结果将返回给提供者并与患者讨论。 全基因组测序 (WGS) 提供了整个人类基因组的全面清单，其中包含约 40 亿个碱基对。 虽然 WGS 可以根据 CAP/CLIA 法规进行临床决策，但我们将使用的测试实验室将进行仅限研究用途 (RUO) 测试，而不会是 LDT。 因此，WGS 结果将不会提供给医疗保健提供者或患者。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Kenneth S Ramos,, MD
- 电话号码：7136777740
- 邮箱：kramos@tamu.edu
研究联系人备份
- 姓名：Rick Silva, PhD
- 电话号码：(713) 677-7422
- 邮箱：ricksilva@tamu.edu
学习地点
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Texas
-
Bryan、Texas、美国、77802
- 招聘中
- Texas A&M Family Care
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接触：
- Gabriel Neal, MD
- 电话号码：979-436-0399
- 邮箱：gneal@tamu.edu
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副研究员：
- Sara Rogers, PharmD
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副研究员：
- George Udeani, PharmD
-
接触：
- Sara Rogers, PharmD
- 电话号码：979 436 0286
- 邮箱：sararogers@tamu.edu
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首席研究员：
- Kenneth S Ramos, MD, PhD
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副研究员：
- Rick Silva, PhD
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副研究员：
- Fen Wang, PhD
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副研究员：
- Marcia Ory, PhD
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
描述
纳入标准：
- 服用 5 种或以上药物的个人，包括非处方药、补充剂、天然产品、大麻制品或其他娱乐性药物。
- 能够给予并理解同意过程。
- 同意捐献尿液样本、口腔拭子遗传数据和血液样本，并接受全面的病史和体检。
- 所有性别
- 年龄18-100岁
排除标准：
- 受试者在过去 5 年内已被诊断出或正在接受基底细胞癌以外的任何癌症的治疗。 过去 5 年内患有转移性黑色素瘤的患者将被排除。
- 住进临终关怀医院。
- 患者曾被诊断患有乙型或丙型肝炎。
- 患者曾被诊断患有活动性肝病、肝肿大、肝功能严重异常。 Meld 评分 >10，ALT 或 AST >100U/L 或 AST/ALT 比值 >2
- 服用咪唑类抗真菌药物的患者。
- 拒绝参与工作人员或与工作人员互动/分享他们的医疗状况。
- 病历中对阿尔茨海默病或相关痴呆症的诊断表明，这是一种进行性、使人衰弱的疾病，会损害记忆、思维过程和功能。
- 怀孕患者将被排除在外。
- 无法或不愿意提供同意的个人将被排除在外。
- 无法口头交流和理解英语。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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具有相应 ADR 表型的药物基因组基因型
大体时间：180天
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患者的初级保健医生将转介至德克萨斯 A&M 跨专业药物基因组学诊所 (IPGx)，以评估基因分型和 ADR。
临床工作人员将获得口腔拭子，根据 CLIA 实验室的样本采集套件收集 DNA，用于药物基因组学评估，这将在研究期开始时进行。
血液化学将从 EMR 中获取。
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180天
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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急诊科就诊
大体时间：180天
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试点研究的第二个目标是评估和监测急诊科就诊的频率。
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180天
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其他结果措施
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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药物-药物相互作用、药物基因相互作用、药物-药物-基因相互作用
大体时间：180天
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IPGx 的评估将从药剂师或医生进行药理学咨询开始，以评估患者目前正在使用的药物或其他药物，并确定与毒性、药物相互作用或可能与治疗相关的副作用相关的任何潜在问题。临床表现。
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180天
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纳兰霍量表中 ADR 的频率和性质
大体时间：180天
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患者将由其初级保健医生转介至德克萨斯 A&M 跨专业药物基因组学诊所 (IPGx)。
IPGx 诊所或家庭护理诊所的医生或门诊药剂师将在就诊期间在 IPGx 获取完整的病史、体检并验证患者当前的伴随药物清单。
患者医疗信息将输入 ActX 平台，该平台将在研究期间进行可计算的 EHR 病历分析、多药治疗状态评估以及使用 Naranjo 量表 (19) 监测 ADR。
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180天
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (估计的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
与本研究相关的术语
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)？
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
研究美国 FDA 监管的设备产品
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