IPGx PILOT Koko genomin sekvensointilaajennuskohortti

Tutkijat ovat huolissaan potilasturvallisuudesta ja haittavaikutuksista, koska nämä kliinisen käytännön osa-alueet edustavat merkittäviä kuolinsyitä, ennen monia paremmin tunnistettuja akuutteja ja kroonisia kuolinsyitä. Vaikka lääkkeiden määräämisellä voi olla elämää muuttavia etuja, tarkempi tapa valita lääkevalmisteen vaihtoehdoista jää jäljelle olemassa olevista tekniikoista. Henkilön lääkevaste voi vaihdella lääkkeiden tai lääkkeiden ja elintarvikkeiden yhteisvaikutusten sekä sukupuolen, iän ja sairauden tilan mukaan. Suuria, jopa 1000-kertaisia ​​ihmisten välisiä vaihteluita on vasteena samalle tietyn lääkkeen annokselle. Geneettiset polymorfismit auttavat määrittelemään farmakokineettisiä ja farmakodynaamisia profiileja, mutta näitä oivalluksia ei ole vielä johdonmukaisesti sisällytetty kliiniseen käytäntöön ja hoitostandardeihin. Useita lääkityshallintaohjelmia on ilmestynyt viime vuosina, mutta ne ovat pääasiassa suunnattu hoitoon sitoutumiseen, ja farmakogenomiikkaan perustuvaa lääkityksen hallintaa on vain rajoitetusti otettu käyttöön. Tarkkuuslääketiede suosittelee, että yksi koko ei sovi kaikkeen lääketieteelliseen hoitoon. Miten hoidon tarjoaminen voisi päästä lähemmäksi napakymppiä monikroonisten sairauksien hoidossa ja monifarmasian johtamista?

Yhdysvalloissa on moniapteekkikriisi, joka on laaja, erityisesti iäkkäiden väestöryhmien keskuudessa, joilla on usein heikentynyt munuaisten ja maksan toiminta. Mahdollisten maksan sytokromientsyymivälitteisten lääkeaineiden yhteisvaikutusten esiintyvyyden arvioitiin olevan jopa 80 % yhdessä tutkimuksessa, jossa iäkkäät aikuiset katsottiin olevan herkempiä ongelmallisille lääkeinteraktioille. Perinteisesti monifarmasialla tarkoitetaan viiden tai useamman lääkkeen samanaikaista ottamista. Haasteen on todettu kohtaavan arviolta 15 miljoonaa 65-vuotiasta tai sitä vanhempi potilasta. Moniapteekkipotilailla on usein vähintään kaksi kroonista rinnakkaissairautta, ja lähes 50 % iäkkäistä aikuisista käyttää vähintään yhtä lääkettä, joka ei ole välttämätön. Sairaalapotilaat käyttävät keskimäärin viidestä kahdeksaan lääkettä, ja määrä ylittää yhdeksän 40 prosentissa hoitokodin asukkaista. Tutkimuksessa potilailla, joilla oli kognitiivinen heikkeneminen tai lievä Alzheimerin tauti, 88 % näistä potilaista täytti polyfarmasian kriteerit, ja antikolinerginen kognitiivinen taakka, lääkkeiden yhteisvaikutukset ja lääkeaine-geenivuorovaikutukset ovat kaikki yleisiä ongelmia näissä populaatioissa. Yhä useammissa ääritapauksissa moniapteekki voi käsittää noin 20 lääkettä, jotka aiheuttavat lähes 100 prosentin riskin haittavaikutuksiin. Mitä suurempi määrä lääkkeitä hoito-ohjelmassa on, sitä suurempi riski potilasturvallisuudelle ja vaarantuneet kliiniset tulokset ovat. Joka kahdeskymmenesosa moniapteekkien avohoidosta hakeutuu lääketieteelliseen hoitoon haittavaikutusten vuoksi. Polyfarmaatia on yhdistetty myös vanhusten sairaalahoitoihin. Polyfarmaatia liittyy heikentyneeseen lääkityksen noudattamiseen, ravitsemukseen, virtsanpidätyskyvyttömyyteen, päivittäisen elämän toiminnan vähenemiseen sekä fyysisten ja kognitiivisten toimintojen menettämiseen. Lisääntynyt kaatuminen ja siihen liittyvä sairastuvuus ja kuolleisuus. Taloudellisesti monifarmasian vaikutus on liitetty 30 %:n kasvuun terveydenhuoltomenoissa, ja se on merkittävä tekijä terveydenhuollon huippukäyttäjissä. Observational Health Data Sciences and Informatics -tietojoukon analyysi osoitti, että 10 % diabetespotilaista, 24 % verenpainepotilaista ja 11 % masennuspotilaista seurasi hoitoreittiä, joka oli ainutlaatuinen 250 miljoonan tapauksen joukossa, mikä osoittaa tarvetta sähköinen päätöstuki potilaskohtaisista hoitosuunnitelmista johtuvien lääkevuorovaikutusten ilmoittamiseksi ja korjaavien toimenpiteiden toteuttamiseksi.

Sähköisten terveyskertomusten yhteentoimivuus on edelleen heikkoa, ja merkittäviä puutteita mahdollistavat hoitosuunnitelman ja lääkityksen hallinnan, jotka voivat saada tietoa ja päätöksentekotukea palveluntarjoajan jatkumosta. Tämä on epäoptimaalinen tilanne tarkan ja yksilöllisen sairaanhoidon tarjoamisessa ja jalostuksessa. Monifarmasian ja lääkityksen yhteensovittamisen kliininen taakka vaikuttaa usein perusterveydenhuollon kliinikoihin, joilla ei välttämättä ole tarvittavia tietoja palvelupisteessä, mikä on moniapteekkien johtamisongelmia. Innovatiivisia lähestymistapoja moniapteekkihaasteen hallintaan ovat lääketieteellisten klinikoiden perustaminen, joissa keskitytään vähentämään monifarmasian kustannuksia ja terveydenhuollon taakkaa sekä arvioimaan systemaattisesti lääkkeiden muutoksiin, muuttamiseen tai lopettamiseen liittyviä kliinisiä muutoksia tarvittaessa.

Lääkäreitä, apteekkeja, sairaanhoitajia, tapausten koordinaattoreita sekä telelääketieteen ja digitaalisten työkalujen avulla tutkijat voivat ottaa potilaita mukaan ja kerätä tietoa, kuten sairausprofiilien fenotyyppisiä, toiminnallisia ja sosiaalisia tekijöitä. Nämä tiedot voidaan syöttää laskennallisina toimivina tietoina ennen käyntiä, jotta voidaan paremmin seurata, mitä käyntien välillä tapahtuu (hoitosuunnitelman noudattaminen tai sen puute). Tutkijat uskovat, että tämä tieto on yhtä tärkeä kuin se, mitä tapaamisella tapahtuu, ja tämä pätee erityisesti monifarmasian kliinisissä tapauksissa. Lopulta nämä tiedot voivat tulla helpommin sekä potilaan että palveluntarjoajan saataville käyttämällä Interprofessional Pharmacogenomics (IPGx) -hoitomallia.

Tutkijat kehittävät hoitopäätösten tukiprotokollaa ja farmakogenomisia/farmakokineettisiä kojetauluja, jotka lisäävät perusterveydenhuollon kliinikon kykyä hallita lääkitystä tarkemmin yksittäistapauksissa ja mikä on minimaalisesti häiritsevää. Lisäksi yhteentoimivuus sähköisten sairauskertomusten, kliinisen päätöksentuen (CDS) ja genomitestien tietomuotojen välillä on edelleen este PGx-testien uudelleenkäytölle ja koko genomin ja kokonaisen eksomin sekvensoinnin toteuttamiselle ajan ja eri terveydenhuollon tarjoajien välillä. Nämä ponnistelut kertovat mahdollisuudesta käyttää koko genomin sekvensointia (tutkimuskäyttö vain tämän tutkimusprotokollan mukaisesti) IPGx-hoitomallissa käytetyillä tietojärjestelmillä.

Kojelaudat ovat hyödyllisiä palveluntarjoajille ja potilaille, ja ne auttavat tunnistamaan kliiniset tapaukset, joissa ennakoivasta lääkityksen hallinnasta voi olla hyötyä, jotta voidaan tunnistaa ne, jotka eivät ehkä reagoi ja joilla on lisääntynyt haittavaikutusten riski. Kojelaudat saisivat tietoa kasvavasta kliinisten tapausten kirjastosta, jossa on kliininen tietovarasto. Kojelauta luo ja tarkentaisi iteratiivisesti uusia hoitopäätöspuita (algoritmeja), jotka keskittyvät lääkityksen hallintaan. Tietorakenne ja hoitoprotokolla on suunniteltu mahdollistamaan kliinisten toimintojen samanaikainen ja pitkittäinen havainnointi (tutkimus) kohti ActX CDS:n ja kojetaulujen validointia hyödyllisenä työkaluna potilaskeskeisessä kliinisessä tutkimuksessa. Ihanteellinen tietopankki sisältää lääkeveren pitoisuudet (ei ole relevanttia tälle PILOTILLE), lääkeluettelo ja muut asiaankuuluvat modifiointitiedot, jotka voivat vaikuttaa lääkkeiden käyttöön ja tehokkuuteen. Tämä lähestymistapa tarjoaisi myös keinon oppia lisää lääkkeiden noudattamisesta ja auttaa tunnistamaan järjestelmällisesti potilaat, jotka saattavat olla ehdokkaita farmakogenomiseen arviointiin ja pitkäaikaiseen osallistumiseen lääkityshallintaohjelmaan.

Erityiskysymykset, joihin tämä YLEISTÄ lähestymistapa saattaa vastata:

Tarkoittaako lähellä nollaa oleva lääketaso kiinnittymistä vai metaboloiko potilas lääkettä laajasti niin, että veren tai virtsan tasoja ei voida havaita annon jälkeen? Fenotyyppikysely yhdistettynä lääkeveren tai virtsan tason mittauksiin vastaa tähän kysymykseen.

Tarvitaanko protokollaa sen määrittämiseksi, milloin farmakogenominen testi on tilattava? ActX-alustalla toimiva tutkijan tietoalusta voi vahvistaa näiden päätösten kliinisen ja kustannustehokkuuden.

Mikä on parasta käyttää farmakogenomista dataa? Jos potilaalle on tehty farmakogenominen testi, veren tai virtsan lääkeainetasot voivat auttaa tarkentamaan tietoa aineenvaihdunnan aktiivisuudesta asiaankuuluvien entsymaattisten reittien osalta ja auttaa laatimaan avainkysymyksiä, joiden avulla voidaan tunnistaa, mikä on ylikuormitettu CYP P450 -reitti polyfarmaatiassa.

Haittavaikutukset voidaan ehkäistä psykotrooppisten alalla soveltamalla lääkehoitokonsultaatiosta saatua tietoa. Esimerkiksi masennuslääkkeiden tapauksessa saattaa kulua viikkoja, ennen kuin kliinistä vastetta voidaan arvioida lääkityksen aloittamisen jälkeen standardiannostuksen ja yrityksen ja erehdyksen perusteella. Tarkkuuslääkityksen hallinnan skenaariossa palveluntarjoaja tietäisi heti alussa, onko potilas erittäin nopea metaboloija asiaankuuluvalle CYP P450 -entsymaattiselle reitille, ja hänellä olisi paremmat valmiudet tunnistaa valittu lääke ja optimoida annostitraus. Jos kliininen kojetaulu paljastaa potilaan, joka saa useita lääkkeitä, jotka kilpailevat yhteisestä reitistä, voidaan tarvittaessa tehdä myös oikeat lääkityssäädöt.

Tässä käytettävä ActX on kliinisen päätöksenteon tukijärjestelmä, joka sisältää miljoonia toisiinsa liittyviä vaihtoehto-lääkekonsepteja, jotka muodostavat tietoverkon toistensa kanssa. Kun tietoja syötetään, painotettuja kaaria käytetään kliinisen päätöksenteon tuen ja erotusdiagnoosien rakentamiseen. Tämä tarjoaa potentiaalisesti vahvan ympäristön farmakogenomiselle profiilille, jotta voidaan luoda täsmällinen lääke- ja annosteluohjelma, samalla kun hyödynnetään tällä hetkellä käytännössä käytössä olevia kliinisiä työnkulkuja. Farmakogenominen kojelauta on ActX-alustalla.

Vertaa ja vertaa WGS:ää ja genotyypitystä

ActX-testi on CAP/CLIA-yhteensopivassa laboratoriossa suoritettava genotyyppitesti monimutkaisille laboratoriokehitetyille testeille (LDT:t) sen varmistamiseksi, että tuloksia voidaan käyttää kliinisessä päätöksenteossa LDT:n sääntelykehyksen puitteissa. Tämäntyyppinen testi tutkii rajoitetun määrän ominaisuuksia ihmisen genomissa, erityisesti hieman alle 400 tunnettua geneettistä muunnelmaa, joilla on kliinistä merkitystä. ActX-testin tulokset palautetaan palveluntarjoajalle ja niistä keskustellaan potilaiden kanssa. Whole Genome Sequencing (WGS) tarjoaa täydellisen kattavan luettelon koko ihmisen genomista, joka koostuu noin 4 miljardista emäsparista. Vaikka WGS voidaan suorittaa CAP/CLIA-määräysten mukaisesti kliinistä päätöksentekoa varten, käyttämämme testauslaboratorio suorittaa vain tutkimuskäyttöön (RUO) -testin, eikä se ole LDT. Tämän seurauksena WGS-tuloksia ei toimiteta terveydenhuollon tarjoajille tai potilaille.