IPGx PILOT Whole Genome Sequencing Extension Cohort

Efterforskerne er bekymrede over patientsikkerhed og bivirkninger, da disse områder af klinisk praksis repræsenterer væsentlige dødsårsager foran mange af de bedre anerkendte akutte og kroniske dødsårsager. Mens ordination af medicin kan have livsændrende fordele, halter en mere præcis måde at vælge mellem mulighederne på en formular fortsat bagefter eksisterende teknologier. En persons lægemiddelreaktion kan variere ved hjælp af lægemiddel- eller lægemiddel-føde-interaktioner, såvel som efter køn, alder og sygdomsstatus. Store interpersonelle variationer på op til 1000 gange eksisterer som reaktion på den samme dosis af en given medicin. Genetiske polymorfier hjælper med at definere farmakokinetiske og farmakodynamiske profiler, men disse indsigter er endnu ikke konsekvent blevet indarbejdet i klinisk praksis og standarder for pleje. Adskillige medicinhåndteringsprogrammer er dukket op i de senere år, men disse er hovedsageligt rettet mod overholdelse, med kun begrænset inkorporering af farmakogenomisk-baseret medicinhåndtering. Præcisionsmedicin går ind for, at én størrelse ikke passer til al medicinsk behandling. Hvordan kan ydelsen af ​​pleje komme tættere på øjet i håndtering af polykrone sygdomme og håndtering af polyfarmaci?

Der eksisterer en polyfarmaci-krise i USA, som er stor i omfang, især blandt de ældre populationer, som ofte har aftagende nyre- og leverfunktioner. Forekomsten af ​​potentielle hepatiske cytokrom enzym-medierede lægemiddel-interaktioner blev estimeret til at være så høj som 80 % i et studie med ældre voksne, der anses for at være mere modtagelige for problematiske lægemiddelinteraktioner. Konventionelt refererer polyfarmaci til at tage fem eller flere medicin samtidigt. Anslået 15 millioner patienter 65 eller ældre er blevet identificeret som står over for udfordringen. Polyfarmacipatienter har ofte mindst to komorbide kroniske sygdomme, og næsten 50 % af ældre voksne bruger mindst én medicin, som ikke er nødvendig. Indlagte patienter i gennemsnit fem til otte medicin, og antallet overstiger ni ud af 40 % af beboerne på plejehjem. I en undersøgelse af patienter med kognitiv tilbagegang eller mild Alzheimers sygdom, opfyldte 88% af disse patienter polyfarmacikriterier, med antikolinerg kognitiv byrde, lægemiddel-lægemiddel-interaktioner og lægemiddel-gen-interaktioner alle fremherskende problemer i disse populationer. I et stigende antal ekstreme tilfælde kan polyfarmaci anslå 20 lægemidler, der udgør en risiko for uønskede lægemiddeludfald, der svarer til næsten 100 %. Jo større antal medicin, der er i en kur, desto højere er risikoen for patientsikkerheden og kompromitterede kliniske resultater. En ud af tyve ambulante polyfarmaci søger lægehjælp for bivirkninger. Polyfarmaci har også været forbundet med indlæggelser blandt ældre. Polyfarmaci er forbundet med nedsat medicinadhærens, ernæring, urininkontinens, nedsatte daglige aktiviteter og tab af fysiske og kognitive funktioner. Øget fald forekommer sammen med medfølgende sygelighed og dødelighed. Økonomisk er virkningen af ​​polyfarmaci blevet forbundet med en stigning på 30 % i sundhedsudgifter og en vigtig faktor i ultrahøje sundhedsbrugere. Analyse af datasættet Observational Health Data Sciences og Informatics viste, at 10 % af diabetespatienterne, 24 % af hypertensionspatienterne og 11 % af depressionspatienterne fulgte en behandlingsvej, der var unik blandt en befolkning på 250 millioner tilfælde, hvilket illustrerer behovet for elektronisk beslutningsstøtte til at markere lægemiddelinteraktioner som følge af patientspecifikke plejeplaner og implementere korrigerende foranstaltninger.

Elektroniske sundhedsjournaler kommer fortsat til kort med hensyn til deres interoperabilitetsniveau, med betydelige mangler, der muliggør en plejeplan og medicinhåndtering, der kan trække data og beslutningsstøtte fra hele udbyderens kontinuum. Dette er en suboptimal situation med hensyn til levering og forfining af præcision og personlig lægebehandling. Den kliniske byrde ved polyfarmaci og medicinafstemning påvirker ofte primære klinikere, som måske ikke har de nødvendige data på servicepunktet, en nidus for problemer med polyfarmaci-styring. Innovative tilgange til håndtering af polyfarmaci-udfordringen omfatter oprettelsen af ​​medicinske ledelsesklinikker med fokuseret indsats for at mindske omkostningerne og sundhedsbyrden ved polyfarmaci og for systematisk at evaluere de trinvise kliniske ændringer, der ledsager medicinændringer, modifikationer eller seponering, hvor det er indikeret.

Ved at bruge et tværprofessionelt plejeteam, der omfatter læger, farmaceuter, sygeplejersker, sagskoordinatorer, sammen med telemedicin og digitale værktøjer, kan efterforskerne engagere patienter og indsamle information såsom fænotypiske, funktionelle og sociale determinanter for sygdomsprofiler. Disse data kan indtastes som beregnelige handlingsdata før et besøg for bedre at kunne spore, hvad der sker mellem besøgene (overholdelse af plejeplanen eller mangel på samme). Efterforskerne hævder, at denne information er lige så vigtig som, hvad der sker ved en aftale, og det gælder især i kliniske tilfælde af polyfarmaci. I sidste ende kan denne information blive lettere tilgængelig for både patient og udbyder ved at bruge Interprofessional Pharmacogenomics (IPGx) plejemodel.

Efterforskerne udvikler en protokol til støtte for behandlingsbeslutninger og farmakogenomiske/farmakokinetiske dashboards, der øger kapaciteten for primære klinikere til at håndtere medicin mere præcist for individuelle tilfælde, og som er minimalt forstyrrende. Derudover forbliver interoperabilitet mellem elektroniske medicinske journaler, klinisk beslutningsstøtte (CDS) og genomiske testdataformater en barriere for genbrug af PGx-tests og implementering af hele genomet og hele exome-sekventering på tværs af tid og forskellige sundhedsudbydere. Disse bestræbelser vil informere om gennemførligheden af ​​at bruge hele genomsekventering (kun forskningsbrug under denne undersøgelsesprotokol) på tværs af de informatikplatforme, der bruges i IPGx-plejemodellen.

Dashboards vil være nyttige for udbydere og patienter og hjælpe med at identificere kliniske tilfælde, hvor der kan være fordele ved proaktiv medicinhåndtering for at identificere dem, der måske ikke reagerer, og dem med øget risiko for bivirkninger. Dashboards vil blive informeret af et voksende bibliotek af kliniske tilfælde med et klinisk datavarehus. Dashboardet ville generere og iterativt forfine nye plejebeslutningstræer (algoritmer) centreret om medicinhåndtering. Datastrukturen og plejeprotokollen er designet til at muliggøre samtidig og longitudinel observation (forskning) af de kliniske aktiviteter hen imod validering af ActX CDS og dashboards som et nyttigt værktøj til patientcentreret klinisk forskning. Den ideelle databank vil omfatte lægemiddelblodniveauer (ikke relevant for denne PILOT), lægemiddelliste og andre relevante modifikationsdata, der kan påvirke medicinbrug og effektivitet. Denne tilgang ville også give et middel til at lære mere om lægemiddeladhærens og hjælpe til systematisk at identificere patienter, der kan være kandidater til en farmakogenomisk evaluering og længerevarende deltagelse i et medicinhåndteringsprogram.

Specifikke spørgsmål, som denne GENERALISEREDE tilgang kan give anledning til:

Betyder et lægemiddelniveau tæt på nul manglende overholdelse, eller metaboliserer patienten et lægemiddel i vid udstrækning, så blod- eller urinniveauer bliver uopdagelige efter administration? Det fænotypiske spørgeskema kombineret med blod- eller urinniveaumålinger vil besvare dette spørgsmål.

Er en protokol nødvendig for at bestemme, hvornår man skal bestille en farmakogenomisk test? Investigatorens dataplatform, drevet af ActX-platformen, kan validere den kliniske og omkostningseffektive af disse beslutninger.

Hvad er de bedste farmakogenomiske data? Hvis en patient har fået foretaget en farmakogenomisk test, kan niveauer af lægemiddel i blod eller urin hjælpe med at forbedre viden om den metaboliske aktivitet for relevante enzymatiske veje og hjælpe med at formulere nøglespørgsmål for at identificere, hvad der udgør en overbelastet CYP P450-vej i polyfarmaci.

Bivirkninger kan forebygges på det psykotrope område ved at anvende den viden, der stammer fra en konsultation om medicinhåndtering. For eksempel, i tilfælde af antidepressiva, kan der gå uger, før en klinisk respons kan evalueres efter påbegyndelse af medicin baseret på standarddosering og forsøg og fejl. I et scenarie for præcisionsbehandling af medicin vil udbyderen fra starten vide, om patienten var en ultrahurtig metabolisator for en relevant CYP P450-enzymatisk vej og være bedre rustet til at identificere det valgte lægemiddel og til at optimere dosistitreringen. Hvis det kliniske dashboard afslører en patient, der modtager flere lægemidler, der konkurrerer om en fælles vej, kan der også foretages korrekte medicinjusteringer efter behov.

Det ActX, der skal bruges her, er et klinisk beslutningsstøttesystem, der indeholder millioner af indbyrdes forbundne variant-lægemiddelkoncepter, der går sammen for at skabe et vidennetværk. Efterhånden som data indtastes, bruges vægtede buer til at bygge klinisk beslutningsstøtte og differentialdiagnoser. Dette giver et potentielt stærkt miljø for en farmakogenomisk profil til at skabe et præcist lægemiddel- og doseringsværktøj, samtidig med at de drager fordel af kliniske arbejdsgange i praksis. Det farmakogenomiske dashboard er indeholdt i ActX-platformen.

Sammenlign og kontrast WGS og Genotyping

ActX-testen er en genotypetest udført i et CAP/CLIA-kompatibelt laboratorium for komplekse laboratorieudviklede tests (LDT'er) for at sikre, at resultaterne kan bruges til klinisk beslutningstagning inden for LDT-lovgivningen. Denne type test undersøger et begrænset antal træk i det menneskelige genom, specifikt lige under 400 kendte genetiske varianter med klinisk betydning. Resultaterne fra ActX-testen vil blive returneret til udbyderen og diskuteret med patienterne. Whole Genome Sequencing (WGS) giver en komplet omfattende opgørelse over hele det menneskelige genom, som består af cirka 4 milliarder basepar. Mens WGS kan udføres under CAP/CLIA-reglerne for klinisk beslutningstagning, vil det testlaboratorium, vi skal bruge, udføre en Research Use Only (RUO)-test og VIL IKKE være en LDT. Som følge heraf vil WGS-resultater ikke blive leveret til sundhedsudbydere eller patienter.