Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Prospective Analysis of Seasonal Influenza - Viral Transmission and Evolution in the City of Basel, Switzerland

11. února 2019 aktualizováno: University Hospital, Basel, Switzerland

Prospective Analysis of Seasonal Influenza - Viral Transmission and Evolution in the City of Basel, Switzerland [Prospektive Systemanalyse Der Saisonalen Influenza - Virustransmission Und Evolution in Der Stadt Basel] in German

Influenza associated illness has a global annual impact with high morbidity and mortality. Transmission mechanisms and rates are under-investigated and overall poorly understood.

This project aims to use epidemiological tools to understand the transmission and evolution of influenza viruses at an individual and population level within a small-scale city (Basel) through a combination of experimental, clinical and mathematical advances. The investigators aim to quantitatively characterize the viral transmission using novel molecular-epidemiological tools based on whole genome sequencing.

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Podmínky

Detailní popis

In this prospective observational study, paediatric and adult outpatients presenting with influenza-like illness will be enrolled at the emergency departments of the University Hospital Basel (USB), the paediatric University Hospital of both Basel (UKBB), or a network of family doctors (associated with Center of Primary Health Care).

The Clinical Trial Unit at the University Hospital Basel will coordinated the recruitment process, collect data and sample all patients during the influenza season 2016/17. Samples will be collected such as whole blood, serum and DNA, nasopharyngeal swamps to diagnose influenza by polymerase chain reaction (PCR) assay and to determine colonization rates with Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumonia. All samples except the first naso-pharyngeal swab for influenza diagnostics will be stored in a biobank and analysed in batches. Each influenza virus isolate will be sequenced using a "whole genome sequencing" approach. The viral transmission and evolution will be analysed using whole genome data for a detailed molecular and phylogenetic tree analysis, respectively. The epidemiological and geographical data will be incorporated into the phylogenetic model.

Specific aims are:

(i) to determine the impact of the most important epidemiological parameters, first focusing on the age profile, followed by children per house hold, and population density, on influenza transmission at an individual and population level, drawing on an analysis of baseline humoral immunity and whole genome sequencing data, (ii) to understand the viral evolution during seasonal epidemics, (iii) to develop dynamic mathematical models that are able to predict viral transmission and evolution based on the retrospective results from (i) and (ii) and to validate this model in future influenza seasons.

To realize the interdisciplinary approach, the investigators will rely on the expertise in mathematical modelling of viral epidemiology and evolution and established geographical expertise, next generation sequencing, clinical epidemiology, and immunologic diagnostic techniques.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

800

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

      • Basel, Švýcarsko, 4031
        • University Hospital Basel
      • Basel, Švýcarsko, 4031
        • Federal Institute of Technology Zurich
      • Basel, Švýcarsko, 4031
        • University Children's Hospital
      • Basel, Švýcarsko, 4031
        • Universitätres Zentrum für Hausarztmedizin beider Basel, University of Basel

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dítě
  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Ukázka pravděpodobnosti

Studijní populace

Paediatric or adult patients fulfilling the World Health Organization (WHO) definition of an influenza-like illness. A total number of 1000 influenza PCR-confirmed cases should be included.

Popis

Inclusion Criteria:

  • Each pediatric or adult patient, which fulfill the Worl Health Organization (WHO) definition of Influenza like illness.
  • The case definition includes an acute respiratory infection with coughing, fever ≥38°C, and start of symptoms within the last 10 days.
  • Presentation of the patient with influenza-like illness on the emergency ward of the University Hospital Basel or the University Children Hospital of both Basel or a collaborating private practise.
  • Patient has to live in the city of Basel.

Exclusion Criteria:

  • Patients who are not living in the City of Basel.
  • Case definition for influenza like illness is not fulfilled.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Investigation of the phylogenetic relation of viral isolates from participating patients using whole-genome sequencing and bioinformatics
Časové okno: Baseline
The primary microbiological endpoint is the connection of two viral isolates via comparison and phylogenetic analysis by using the genetic information
Baseline

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Spolupracovníci

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Adrian Egli, PD Dr. FAMH, Clinical Microbiology, University Hospital Basel

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia

1. ledna 2017

Primární dokončení (Aktuální)

1. května 2018

Dokončení studie (Aktuální)

1. května 2018

Termíny zápisu do studia

První předloženo

22. prosince 2016

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

2. ledna 2017

První zveřejněno (Odhad)

4. ledna 2017

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

15. února 2019

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

11. února 2019

Naposledy ověřeno

1. února 2019

Více informací

Termíny související s touto studií

Další identifikační čísla studie

  • Influenza in Basel 2016/2017

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Prohledejte podobné pokusy