Bioúložiště pro koronární srdeční chorobu v Kataru (QCBio)

ÚVOD:

Predikce příhod koronární srdeční choroby (ICHS) je založena na konvenčních rizikových faktorech aterosklerózy, jako je věk, pohlaví, krevní tlak, cukrovka, hladiny lipidů a kouření. Protože tyto rizikové faktory převládají u velké části populace, dostupné algoritmy pro predikci rizik postrádají požadovanou citlivost a specifitu. Například Cooper et al ukázali, že algoritmy správně předpověděly pouze ~ 11 % případů ICHS, ke kterým dojde během 10 let. Existuje tedy naléhavá potřeba vyvinout a ověřit nové biomarkery pro včasnou detekci onemocnění a přesnější stratifikaci rizika. Podle odhadů Světové zdravotnické organizace (WHO) budou kardiovaskulární onemocnění do roku 2020 hlavní příčinou nemocnosti a úmrtnosti. Rozvojové země včetně států Perského zálivu budou hlavním přispěvatelem k této zvýšené úmrtnosti a invaliditě. Nedávná zpráva společnosti McKinsey & Company předpovídá, že region Perského zálivu bude v průběhu příštích dvou desetiletí čelit bezpříkladnému a bezprecedentnímu nárůstu poptávky po zdravotní péči, přičemž celkové výdaje na zdravotní péči v roce 2025 odhadují na 60 miliard USD. Dnes 12 miliard USD.

Znalost nových genetických a proteomických markerů poskytne přesnější odhady rizika a zároveň definuje cesty důležité u jednotlivých pacientů, odhalí nové cíle pro intervenci a nakonec umožní individualizovaný přístup k péči. Bioúložiště vzorků deoxyribonukleové kyseliny (DNA), séra a plazmy umožní výzkum patogeneze ICHS u dospělých z Kataru a poskytne neocenitelný zdroj pro preventivní kardiovaskulární výzkum a vývoj biomarkerů pro včasnou detekci ICHS.

VÝZNAM V poslední době byl učiněn významný pokrok v identifikaci variant genetické náchylnosti a také cirkulujících proteomických markerů aterosklerotického vaskulárního onemocnění. Zobecnitelnost těchto výsledků na pacienty patřící k různým etnickým skupinám je však nejasná. Aby bylo možné převést nedávné pokroky v genomice a proteomice do klinické praxe, bude nutné tyto nově objevené biomarkery vyhodnotit u pacientů různých etnických skupin s různými charakteristikami, faktory prostředí a užíváním léků. Výzkumníci navrhují zřídit biorepozitář plazmy a DNA propojený s demografickými a klinickými proměnnými, aby se usnadnily studie biomarkerů rizika, progrese a výsledku ICHS. Zastřešujícím cílem při vývoji Qatar Cardiovascular Biorepository (QCBio) je vytvořit zdroj, který podpoří výzkum zaměřený na identifikaci nových biochemických a genetických markerů CHD.

NÁVRH A METODY VÝZKUMU:

Vyšetřovatelé využívají pro tento návrh následující zdroje:

1. Infrastruktura a vzory doporučení pacientů srdeční katetrizační laboratoře v nemocnici Hamad, Dauhá, Katar, kde je ročně vyšetřeno několik tisíc pacientů pro koronarografii a perkutánní koronární intervenci;
2. Elektronický lékařský záznam (EMR) v nemocnici Hamad, který zahrnuje rizikové faktory, lékovou terapii, relevantní laboratorní údaje a vitální stav; a
3. Multidisciplinární vyšetřovací tým s významnými zkušenostmi a odbornými znalostmi ve vědě o biorepozitářích, včetně etických, právních a sociálních důsledků (ELSI), laboratorních informačních systémů managementu, informatiky a těžby EMR k anotaci biovzorku příslušnými klinickými proměnnými.

KONKRÉTNÍ CÍLE A CÍLE:

1. Zřídit biorepozitář DNA a plazmy (QCBio) katarských případů CHD a kontroly odpovídající etnické příslušnosti, aby bylo možné zkoumat genomické a proteomické biomarkery pro včasnou detekci a prognózu, stejně jako identifikaci nových cílů pro vývoj léků.
2. Označte biorepozitář a) demografickými, laboratorními a klinickými proměnnými odvozenými z EMR pomocí elektronických fenotypizačních algoritmů ab) podrobnými informacemi týkajícími se historie kardiovaskulárních onemocnění a rizikových faktorů odvozených z průzkumů subjektů studie.
3. Vyvinout procesy na podporu využívání bioúložiště katarskými vyšetřovateli usnadněním přístupu do bioúložiště pro výzkum biomarkerů při zachování nejvyšších etických standardů s důrazem na důvěrnost pacientů a správu biovzorků.
4. Sledování náboru: Program číslování pacientů (PNP) se používá k deidentifikaci subjektů zařazených do studie a sledování náboru pacientů. Program obsahuje demografické informace a přidělené osobní identifikační číslo (PIN) pro každého účastníka.

Souhlas: Potenciální subjekty jsou identifikovány koordinátory studie po přezkoumání katetrizační laboratoře (Cath lab) a rozvrhů krevní banky. Koordinátor studie každému účastníkovi vysvětluje formulář souhlasu a studijní dotazník. Kdykoli je to možné, vyšetřovatelé se pokoušejí odebrat vzorky krve nalačno před přijetím jakékoli léčby a vyhnout se zátěži dodatečné venepunkce. U těch způsobilých poskytne koordinátor studie podrobnosti týkající se cílů studie, rizik a potenciálních přínosů z účasti, skladování, budoucího použití a soukromí vzorků. Kromě toho koordinátor studie informuje účastníky o nedostatečném okamžitém přínosu pro zdraví a jejich právu kdykoli po udělení souhlasu ze studie odstoupit.

Odběr a zpracování krevních vzorků: Při výkonu v kathské laboratoři, při příjmu na koronární jednotku (CCU) nebo při darování krve se odebírá 25 mililitrů krve. Vzorky se odebírají ze speciální studijní oblasti v blízkosti Cath Lab/CCU a krevní banky, v daném pořadí. Krev se odebírá do příslušných odběrových zkumavek, označí se identifikačním číslem vygenerovaným čárovým kódem v nemocnici a odešle se do laboratoře molekulární genetiky.

Monitorování mrazáku: Všechny teploty v mrazáku jsou nepřetržitě monitorovány kombinací zařízení pro řízení projektu a zabezpečení Hamad Medical Corporation (HMC).

Zajištění kvality: Přesné manipulace se vzorky je dosaženo dodržováním standardních operačních postupů (SOP) dodržováním obecných laboratorních standardů pro zajištění kvality a kontroly.

Sledování vzorků: Sledování vzorků bude prováděno programem Laboratory Information Management System (LIMS), který v současnosti používá výzkumná skupina vedoucího PI.

Důvěrnost pacienta: Vyšetřovatelé budou používat informatiku a funkce zabezpečení dat k zachování důvěrnosti pacienta. Program číslování pacientů (PNP) bude použit k deidentifikaci pacientů zařazených do QCBio a ke sledování pacientů po náboru.

Etické, právní a regulační problémy v biorepozitářích DNA: Formulář souhlasu obsahuje samostatná zaškrtávací políčka pro získání povolení k odběru plazmy a použití DNA při studiích různých onemocnění a předávání vzorků spolupracujícím výzkumníkům. Bankování biovzorků vyvolává nové obavy týkající se soukromí a souhlasu pacienta.

Informatika: Informatika a zabezpečení dat jsou kritickými součástmi biologického úložiště a klíčem k využití výkonu biologických úložišť. QCBio bude propojeno s několika databázemi.

Dotazník studie: Výzkumníci používají dotazník ke sběru informací týkajících se sociodemografických informací, kardiovaskulární anamnézy, fyzické aktivity, životního stylu, minulých lékařských informací a rodinné anamnézy. Data budou z dotazníku extrahována skenováním nebo ručním zadáním.

Anotace vzorků s klinickými daty: Výzkumníci používají kromě laboratorních databází také prohlížeč EMR nemocnice Hamad k anotaci biorepozitáře relevantními klinickými proměnnými.

Zjišťování rizikových faktorů: Výzkumníci zjišťují konvenční kardiovaskulární rizikové faktory, včetně hypertenze, diabetu a dyslipidémie. EMR a údaje z průzkumu budou použity ke stanovení přítomnosti následujících rizikových faktorů aterosklerózy: kouření, diabetes, hypertenze, dyslipidémie a obezita. Vyšetřovatelé používají cílenou manuální kontrolu papírových záznamů a EMR v tandemu s přístupem k elektronickým souborům dat pro laboratorní hodnoty, léky a diagnostické kódy.

Správa biovzorků a přístup do bioúložiště: Vyšetřovatelé vyvinou protokoly, které jim umožní využívat datové soubory spojené se vzorky, zajistí soulad s regulačními pokyny, podpoří spolupráci mezi vyšetřovateli z Kataru, Zálivu a Mayů a zvýší produktivitu výzkumu. Vyšetřovatelé poskytnou flexibilní, robustní, bezpečný a ověřený program pro správu informací pro správu biologických vzorků. Uložené vzorky budou k dispozici výzkumným pracovníkům, jejichž protokoly byly schváleny IRB a upřednostněny vědeckým kontrolním panelem.

Sledování použití vzorku: Pro maximalizaci využití biovzorků použije výzkumník LIMS ke sledování všech přijatých vzorků přidělením jedinečné identifikace pro všechny vstupní (zkumavky se vzorky) a výstupní (DNA/plazma/bílé krvinky) zkumavky a zaznamenává pohyb vzorku. , zpracování, tvorba a spotřeba. Určený počítačový analytik bude udržovat a spravovat systém.

Přístup k informacím: K výzkumným datům budou mít přístup pouze členové výzkumného týmu. Účastníci budou identifikováni číselnými kódy pouze v databázi a v přepisech; všechna data jsou sledována v databázích podle anonymních, ale propojitelných čísel studií. Mimo studii nebudou zveřejněny žádné identifikovatelné informace.

Strategie pro pokračování projektu: Dlouhodobým cílem výzkumného týmu je vytvořit zdroj, který umožní objevovat varianty genetické náchylnosti a nové cirkulující markery ICHS, a tím umožnit individuální posouzení rizika ICHS, hlavní příčiny úmrtí a nemocnosti v ČR. Katar. Vytvoření biorepozitáře je prvním nezbytným krokem k pochopení genomické a proteomické ICHS u katarských jedinců.