ANDDI-PRENATOME – Studie proveditelnosti pro „rychlou“ pangenomickou vysoce výkonnou sekvenační analýzu v prenatální diagnostice (AnddiPrenatome)
Prenatální diagnostika genetických onemocnění je skutečnou lékařskou výzvou. Odhalení prenatálních abnormalit na ultrazvuku je časté (5 až 10 % těhotenství), a když jsou abnormality vidět na ultrazvuku, zvyšuje se možnost základní vývojové anomálie. V současné době ve Francii, když jsou abnormality objeveny ultrazvukovým vyšetřením, je etiologická diagnóza založena na dalších zobrazovacích testech (mozková MRI, 3D kostní tomografie, fetální CT, fetální CT) nebo diagnostických testech, jako je invazivní odběr choriových klků, amniocentéza nebo fetální krev pro infekční, metabolická, imunologická a genetická vyšetření (standardní karyotyp, FISH (fluorescenční in situ hybridizace) pro rychlou detekci aneuploidie, analýza chromozomů na DNA čipu (ACPA nebo CGH-array) a případné sekvenování cílených genů, pokud jsou k dispozici v časovém rámci slučitelném s těhotenstvím). NIPT (Neinvazivní prenatální testování) na bezbuněčné fetální DNA cirkulující v mateřské krvi má omezenější indikace, které umožňují od rané fáze těhotenství stanovení pohlaví plodu a fetálního rhesus faktoru a hledání aneuploidie.
Stanovení etiologické diagnózy během těhotenství má však pro rodiče mnoho výhod: objasnění příčiny, získání přesnější prognózy pro určení budoucího vedení a výsledku těhotenství a stanovení rizik recidivy.
Během posledního desetiletí prošla lékařská genetika skutečnou technologickou revolucí, která vedla k vývoji vysoce výkonného sekvenování celého genomu, exomu (ES) a genomu (GS). Jen málo zemí se však v současné době pustilo do ES/GS v prenatální péči kvůli časovému omezení a obtížnosti interpretace genomických dat, když jsou klinická data omezena na data prenatálního zobrazování.
V roce 2016 Francie zahájila plán France Medicine Genomics 2025 (PFMG2025) k nasazení GS, zejména v diagnostice vzácných onemocnění. Stává se tedy zásadní definovat způsoby předepisování tohoto testování, zejména během prenatální diagnostiky. Paralelně se od prvních publikací zdá, že aplikace genomové analýzy na cirkulující fetální DNA se mohou rozšířit na sekvenování genomu pro výzkum SNV odpovědných za vývojová onemocnění.
Zdravotní síť AnDDI-rares proto navrhuje tento pilotní projekt ANDDI-PRENATOME ke studiu proveditelnosti „rychlé“ analýzy ES v prenatální diagnostice u 61 plodů s ultrazvukovými abnormalitami jako první krok před zvažováním budoucí nákladové efektivity (PRME) nebo studie výkonu systému péče (PREPS) ve spojení s PFMG2025.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
- Biologický: Invazivní odběry plodu, odběry krve matky a otce
- Jiný: Pohovory s rodiči (nepovinné organizační studium)
- Jiný: rodičovský dotazník (nepovinné organizační studium)
- Biologický: odběr krve od matky za účelem získání cirkulující bezbuněčné fetální DNA
- Jiný: odborné pohovory (nepovinné organizační studium)
- Jiný: Focus group pro profesionály (volitelné organizační studium)
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Christel THAUVIN
- Telefonní číslo: +33 03.80.29.53.13
- E-mail: christel.thauvin@chu-dijon.fr
Studijní místa
-
-
-
Dijon, Francie, 21079
- CHU Dijon Bourgogne
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Těhotné ženy s prenatálním nálezem alespoň dvou porodnických ultrazvukových abnormalit (2 velké malformace nebo 1 velká malformace a 1 malá malformace nebo 1 izolovaná malformace s vysokou pravděpodobností genetického onemocnění): které podstoupí invazivní prenatální odběr vzorků pro diagnostiku CGH-array ; který již podstoupil invazivní prenatální odběr vzorků pro diagnostiku CGH-pole a u kterého bylo zjištěno, že fetální CGH-pole je normální (mělo by být k dispozici dostatečné množství fetální DNA nebo plodové vody, aby bylo možné provést sekvenování exomů bez další plodové vody propíchnout).
- Těhotná žena a otec ve věku 18 let a více
- Písemný souhlas poskytnutý těhotnou ženou a otcem plodu
- Možnost dostatečného množství fetálního vzorku (plodová voda nebo fetální krev) pro odběr dalšího vzorku pro pilotní projekt
- Možnost odběru těhotné ženy a otce plodu (periferní krev)
- Těhotná žena a otec plodu schopni porozumět studii
Pilotní organizační studie:
Kromě kritérií pro zařazení a vyloučení z hlavní studie:
- Těhotná žena a biologický otec plodu, který poskytl ústní souhlas s rozhovorem
- Profesionálové (porodník, porodní asistentka, genetik, biolog), kteří souhlasí s rozhovorem
Kritéria vyloučení:
- Diagnostická hypotéza považovaná za vysoce pravděpodobnou, kterou lze potvrdit dostupným molekulárním nebo cytogenetickým testem s nižší cenou než ES (např. mikrodelece 22q11) nebo vysokým podezřením na infekci plodu (např. sérokonverze toxoplamózy)
- Odmítnutí těhotné ženy nebo otce plodu zúčastnit se studie
- Těhotenství dříve než 15 týdnů amenorey nebo později než 34 týdnů amenorey
- Těhotná žena a otec plodu, který není hrazen státním systémem zdravotního pojištění
- Těhotná žena a/nebo otec plodu pod částečnou soudní ochranou
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
řízení
plod s minimálně 2 ultrazvukovými abnormalitami a oba rodiče
|
provést exomovou sekvenační analýzu ve třech
Rozhovor se sociologem nebo psychologem za účelem prozkoumání vnímání ES a dopadu výsledků, očekávání ohledně určitých typů výsledků, které nejsou v současné době k dispozici, emocionální situace a pozice ohledně pokračování těhotenství Ve 4 různých časech: při zařazení, při čas výsledků CGA pole, v čase výsledků ES a ve vzdálenosti od výsledků ES
Vyhodnotit zkušenosti, vnímání, dopad analýz na rozhodnutí, spokojenost a obavy týkající se ES a jeho výsledků, názory na určité typy výsledků, které nejsou v současné době k dispozici, stejně jako úzkost a možný psychický stres Ve 4 různých časových bodech : při zařazení, při dodání výsledků CGA-array, při dodání výsledků ES a v odstupu od dodání výsledků ES
|
|
srovnání
plod s alespoň 2 ultrazvukovými abnormalitami s diagnózou ES při invazivním odběru plodu
|
provést exomovou sekvenační analýzu ve třech
Rozhovor se sociologem nebo psychologem za účelem prozkoumání vnímání ES a dopadu výsledků, očekávání ohledně určitých typů výsledků, které nejsou v současné době k dispozici, emocionální situace a pozice ohledně pokračování těhotenství Ve 4 různých časech: při zařazení, při čas výsledků CGA pole, v čase výsledků ES a ve vzdálenosti od výsledků ES
Vyhodnotit zkušenosti, vnímání, dopad analýz na rozhodnutí, spokojenost a obavy týkající se ES a jeho výsledků, názory na určité typy výsledků, které nejsou v současné době k dispozici, stejně jako úzkost a možný psychický stres Ve 4 různých časových bodech : při zařazení, při dodání výsledků CGA-array, při dodání výsledků ES a v odstupu od dodání výsledků ES
k provedení sekvenační analýzy genomu cirkulující volné fetální DNA
|
|
profesionální
porodník, porodní asistentka, genetik, biolog
|
rozhovor, abyste pochopili, jak se rozhodnutí tvoří
rozhovor pro upřesnění, zda varianty s neznámým významem) VUS bude potenciálně vrácen lékařům nebo dokonce pacientovi prostřednictvím lékaře.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Čas potřebný k vrácení výsledků ES pacientům a jejich rodinám v kontextu prenatální diagnózy
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
|
počet nesrovnalostí mezi ES a WGS
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Dotazník k pochopení očekávání párů a jejich apriorního vnímání ES
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
Definovat pocity a lépe poznat, jak páry vnímají ES a jeho důsledky a zejména riziko objevení VUS (varianty neznámého významu) a ID (náhodné údaje).
|
Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
|
Dotazník k hodnocení organizace zdravotníků zapojených do rozhodovacího procesu
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
Po ukončení studia v průměru 12 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Tran Mau-Them F, Delanne J, Denomme-Pichon AS, Safraou H, Bruel AL, Vitobello A, Garde A, Nambot S, Bourgon N, Racine C, Sorlin A, Moutton S, Marle N, Rousseau T, Sagot P, Simon E, Vincent-Delorme C, Boute O, Colson C, Petit F, Legendre M, Naudion S, Rooryck C, Prouteau C, Colin E, Guichet A, Ziegler A, Bonneau D, Morel G, Fradin M, Lavillaureix A, Quelin C, Pasquier L, Odent S, Vera G, Goldenberg A, Guerrot AM, Brehin AC, Putoux A, Attia J, Abel C, Blanchet P, Wells CF, Deiller C, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Isidor B, Amiel J, Dard R, Godin M, Gruchy N, Jeanne M, Schaeffer E, Maillard PY, Payet F, Jacquemont ML, Francannet C, Sigaudy S, Bergot M, Tisserant E, Ascencio ML, Binquet C, Duffourd Y, Philippe C, Faivre L, Thauvin-Robinet C. Prenatal diagnosis by trio exome sequencing in fetuses with ultrasound anomalies: A powerful diagnostic tool. Front Genet. 2023 Mar 23;14:1099995. doi: 10.3389/fgene.2023.1099995. eCollection 2023.
- Thauvin-Robinet C, Garde A, Delanne J, Racine C, Rousseau T, Simon E, Francois M, Moutton S, Sylvie O, Quelin C, Morel G, Goldenberg A, Guerrot AM, Vera G, Gruchy N, Colson C, Boute O, Abel C, Putoux A, Amiel J, Guichet A, Isidor B, Deiller C, Wells C, Rooryck C, Legendre M, Francannet C, Dard R, Sigaudy S, Bruel AL, Safraou H, Denomme-Pichon AS, Nambot S, Asensio MH, Binquet C, Duffourd Y, Vitobello A, Philippe C, Faivre L, Tran-Mau-Them F, Bourgon N. Prenatal exome sequencing, a powerful tool for improving the description of prenatal features associated with genetic disorders. Prenat Diagn. 2024 Sep;44(10):1179-1197. doi: 10.1002/pd.6623. Epub 2024 Aug 13.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- THAUVIN AnDDI rares 2018
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .