Pokročilé terapie jaterních metastáz (LiMeT)

Pozadí a zdůvodnění - CRC a PDAC jsou druhou a čtvrtou nejčastější příčinou úmrtí na rakovinu. Pacienti postižení těmito rakovinami umírají na jaterní MTS. Konvenční terapie jsou účinné buď u primárních nádorů, ale selhávají u metastatického onemocnění. Účinnost imunoterapie blokádou imunitního kontrolního bodu a adoptivní buněčnou terapií nádorově specifickými T buňkami je u MTS ze solidních nádorů pouze částečná nebo dočasná, a to kvůli lokálním imunosupresivním mechanismům. To je zvláště důležité pro jaterní MTS, ve kterém přirozené tolerogenní prostředí může dále udržovat imunosupresi indukovanou rakovinnými buňkami a infiltrujícími imunitními buňkami, jako jsou makrofágy spojené s nádorem (TAM), supresorové buňky odvozené od myeloidů (MDSC), neutrofily a regulační T nebo B buňky.

V tomto ohledu důkazy naznačují, že progrese primárního nebo metastatického CRC koreluje se špatnou imunitní infiltrací a zánětem. Navíc naše publikované výsledky v primární PDAC podporují korelaci mezi progresí nádoru a silným protizánětlivým/imunosupresivním podpisem typu 2. Je známo, že účinnost chemoterapie závisí také na reaktivaci a/nebo repolarizaci imunitních odpovědí cílených na nádor. Předoperační chemoterapie může vyvolat příznivé účinky a potenciálně cílené změny v imunitním profilu CRC nebo PDAC MTS.

Vyšetřovatelé předpokládají, že kombinace: i) přímého zabíjení rakovinných buněk adoptivně přenesenými nádorově specifickými T buňkami a ii) nepřímé kontroly progrese nádoru pomocí přeprogramování mikroprostředí nádoru by řídila jaterní MTS CRC a PDAC.

Vyšetřovatelé tedy navrhují důkladnou charakterizaci metastatického prostředí u těchto dvou typů rakoviny, aby bylo možné racionálně tvarovat na základě podobností a rozdílů inovativní ATMP.

Experimentální výsledky získané z biologických vzorků budou korelovány: i) s klinickými údaji od pacientů v době zařazení a během jejich sledování; a ii) pro podskupinu pacientů s biochemickými a imunologickými údaji ze vzorků periferní krve, které jsou běžně odebírány jako součást jejich klinického sledování, s dalším cílem identifikovat nové biologické parametry a/nebo signatury, které pomohou stratifikaci pacientů a šití ošetření na míru.

Cíle – Vyšetřovatelé chtějí studovat:

1. mutační zátěž nádoru a složení metastatického nádorového mikroprostředí v játrech;
2. inhibiční dráhy, které omezují imunitu u jaterního MTS;
3. antigenní a klonální šíře protinádorových T buněčných odpovědí;
4. prostorově-časové variace efektorových a regulačních imunitních buněk po terapii;
5. charakteristiky nádorových buněk a jejich mikroprostředí v jaterním MTS versus (vs) primární nádor;
6. longitudinální variace klinických parametrů i krevních biologických a imunologických markerů během lékařského sledování pacientů.
7. Kromě toho chtějí shromažďovat a biobankovat vzorky pacientů na podporu validace a výběru nových ATMP vyvinutých ostatními partnery translačního programu.

Primární cíle budou:

1. k identifikaci imunosupresivních/vyčerpávacích cest
2. vyvinout knihovnu nádorově specifických TCR (N≥5/typ nádoru) a identifikovat nové cíle CAR (N≥1/typ nádoru) v CRC a PDAC MTS

Design studie – Tento klinický protokol si klade za cíl hluboce charakterizovat MTS nádorové buňky a jejich mikroprostředí, včetně možných informativních dynamických modifikací od pronádorových k protinádorovým profilům, které mohou následovat po chemoterapii, která je podávána před operací (neoadjuvantně) až do značné míry zlomek pacientů. Pacienti s PDAC a CRC MTS budou proto charakterizováni buď průřezovými nebo longitudinálními vyšetřeními u pacientů bez předchozí chemoterapie vs.

Kromě toho se výzkumníci zaměřují na srovnání jaterního MTS s primárním nádorem, aby zvýraznili dynamické kvalitativní modifikace v rakovinných buňkách, imunitních infiltrátech a neimunitním mikroprostředí, které by mohly usnadnit progresi onemocnění směrem k metastatickému šíření. Tyto úpravy mohou nabídnout příležitost pro optimální aplikaci našich ATMP. Za tímto účelem budou do této studie zařazeni primární nemetastazující pacienti s PDAC podstupující chirurgickou resekci a sledováni za účelem sledování vývoje metachronního jaterního MTS, které bude, kdykoli to bude možné, charakterizováno a porovnáno s jejich odpovídajícími/neshodnými, dříve odebrané vzorky primárních nádorů. Budou také odebrány a analyzovány vzorky periferní krve v době diagnózy jaterního MTS. Také u těch pacientů s CRC MTS, kteří podstupují synchronní resekci primárního CRC a jaterního MTS, budou provedeny srovnávací analýzy nádoru z obou lokalit, což umožní profilování obou nádorových nik v rámci a mezi pacienty.

Kromě toho budou výsledky z víceúrovňových výzkumných analýz korelovány s klinickými údaji shromážděnými od všech pacientů v době zařazení do studie a během jejich klinického sledování, kdykoli to bude možné, po dobu až 2 let, s ohledem na pacienty s PDAC, a 3 roky s ohledem na CRC.

Zejména u pacientů s metastazujícím CRC bude klinické sledování spojeno se souběžným odběrem vzorků krve v sériových časových bodech, které budou prospektivně uloženy do biobanky pro další analýzy zaměřené na: i) studium biologických a imunologických korelátů klinického stavu pacienta; ii) vyhodnocení klíčových diskriminantů dříve identifikovaných ve vzorcích krve analyzovaných v době operace jaterního MTS, aby sloužily jako časné prediktory jaterní progrese nebo recidivy a případně jako indikátory terapeutické stratifikace.

Vyšetřovatelé očekávají, že shromáždí vzorky tkáně/krve a klinická data alespoň od:

• 200 pacientů s metastazujícím CRC (buď synchronní nebo metachronní);
• 150 pacientů s PDAC bez metastáz;
• 75 pacientů se synchronním PDAC MTS a asi 20 pacientů s metachronním PDAC MTS, kteří byli původně zařazeni jako primární nemetastatičtí pacienti do longitudinální studie, celkem 95 pacientů s metastazujícím PDAC;
• 30 zdravých dobrovolníků jako negativní kontroly.

V rámci standardní diagnostické a terapeutické péče o tyto pacienty budou odebrány různé biologické vzorky (periferní krev, primární a/nebo metastatická nádorová tkáň, portální krev), které budou zčásti přímo analyzovány a zčásti uloženy do biobanky pro další studie. . Paralelně se budou shromažďovat klinická data od pacientů v době zařazení do studie a kdykoli to bude možné, po dobu sledování v délce až 2 let u pacientů s PDAC a 3 let u pacientů s CRC.

Statistická analýza shromážděných dat bude prováděna v průběhu klinické studie, počínaje 6 měsíci po zařazení prvního pacienta do 6 měsíců po ukončení sledování pacientů, celkem po dobu 7 let. Studium bude trvat 7 let.

V rámci standardní diagnostické a terapeutické péče o tyto pacienty budou odebrány různé biologické vzorky (periferní krev, primární a/nebo metastatická nádorová tkáň, portální krev), které budou zčásti přímo analyzovány a zčásti uloženy do biobanky pro další studie. . Paralelně budou shromažďována klinická data od pacientů od doby zařazení do studie po dobu sledování 2 let pro pacienty s PDAC a 3 roky pro pacienty s CRC.

Statistická analýza shromážděných klinických a experimentálních dat bude prováděna po celou dobu trvání klinické studie, počínaje 6 měsíci po zařazení prvního pacienta do ukončení sledování pacientů, celkem po dobu 7 let. Studium bude trvat 7 let.

Výzkumné činnosti budou organizovány a integrovány do 6 pracovních balíčků (WP):

1. Odběr a biobankování materiálu od pacientů s CRC a PDAC MTS do jater a s primárním nemetastatickým resekabilním PDAC.
2. Definice nádorové mutační zátěže, epigenetického profilu a profilu genové exprese CRC a PDAC metastatických jater ve velkém a na úrovni jednotlivých buněk.
3. Hodnocení molekulárního a buněčného složení CRC a pokud možno PDAC jaterních MTS pomocí technologií prostorové transkriptomiky (NICHE-seq a Visium).
4. Charakterizace imunitních krajin CRC a, je-li to možné, PDAC jaterního MTS pomocí vysokorozměrné průtokové cytometrie.
5. Validace molekulárních výsledků získaných v 2) a 4).
6. Definice antigenní krajiny a TCR repertoáru CRC a PDAC jater MTS.

Výsledky získané výše uvedenými pracovními skupinami budou zkříženy s daty klinického sledování a budou sloužit ke kalibraci činností programu zaměřených na vývoj nových ATMP.