- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT03532438
WGS of NTM ze sputa pacientů s plicním onemocněním NTM az jejich prostředí (NTM_HOME)
10. května 2018 aktualizováno: Jae-Joon Yim, Seoul National University Hospital
Sekvenování celého genomu netuberkulózních mykobakterií (NTM) odvozených ze vzorku sputa pacientů s plicním onemocněním NTM žijících společně a z jejich vzorků z prostředí
Účelem studie je identifikovat genetickou blízkost NTM odvozenou od pacientů žijících společně az jejich okolního prostředí a vysledovat časový vztah mezi nimi.
Přehled studie
Postavení
Neznámý
Detailní popis
Poté, co se provede izolace NTM pomocí kultury, ze vzorků sputa/bronchoskopů pacientů a jejich vzorků z prostředí, bude provedeno sekvenování celého genomu (WGS) pro všechny izoláty NTM.
Fylogenetická analýza bude provedena na základě jednonukleotidového polymorfismu (SNP) na každém NTM.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Očekávaný)
6
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: Jae-June Yim, MD
- Telefonní číslo: +82-2-2072-2059
- E-mail: yimjj@snu.ac.kr
Studijní místa
-
-
-
Seoul, Korejská republika, 110-744
- Nábor
- Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
-
Kontakt:
- Jae-Joon Yim, MD
- Telefonní číslo: +82-2-2072-2059
- E-mail: yimjj@snu.ac.kr
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Mezi pacienty navštěvujícími ambulanci Národní nemocnice v Soulu byly zařazeny dvojice dospělých pacientů s plicním onemocněním NTM, kteří spolu v době diagnózy žili.
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Dospělý starší 18 let
- Pacient, který má respirační symptomy odpovídající NTM, jako je chronický kašel, sputum a hemoptýza, který má NTM-pozitivní nálezy na CT a který má NTM identifikaci ve dvou nebo více kulturách sputa nebo v jedné nebo více bronchoskopických/tkáňových kulturách . (směrnice ATS/IDSA z roku 2007)
- Páry pacientů žijících ve společné domácnosti od diagnózy plicního onemocnění NTM
- Souhlas s odběrem vzorků životního prostředí z bydliště pacienta.
Kritéria vyloučení:
- Pokud pacient nesouhlasí nebo odstoupí.
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
---|
Skupina pacientů NTM
Pacienti s plicním onemocněním NTM žijící společně
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Genetická podobnost NTM (Non-Tuberculous Mycobacterium)
Časové okno: Základní linie
|
Shoda jednonukleotidových polymorfismů (SNP) z NTM odvozených od pacientů a jejich prostředí
|
Základní linie
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Jae-June Yim, MD, Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Bryant JM, Grogono DM, Greaves D, Foweraker J, Roddick I, Inns T, Reacher M, Haworth CS, Curran MD, Harris SR, Peacock SJ, Parkhill J, Floto RA. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet. 2013 May 4;381(9877):1551-60. doi: 10.1016/S0140-6736(13)60632-7. Epub 2013 Mar 29.
- Fournier PE, Dubourg G, Raoult D. Clinical detection and characterization of bacterial pathogens in the genomics era. Genome Med. 2014 Nov 29;6(11):114. doi: 10.1186/s13073-014-0114-2. eCollection 2014.
- Roach DJ, Burton JN, Lee C, Stackhouse B, Butler-Wu SM, Cookson BT, Shendure J, Salipante SJ. A Year of Infection in the Intensive Care Unit: Prospective Whole Genome Sequencing of Bacterial Clinical Isolates Reveals Cryptic Transmissions and Novel Microbiota. PLoS Genet. 2015 Jul 31;11(7):e1005413. doi: 10.1371/journal.pgen.1005413. eCollection 2015 Jul. Erratum In: PLoS Genet. 2017 Apr 14;13(4):e1006724.
- Bryant JM, Grogono DM, Rodriguez-Rincon D, Everall I, Brown KP, Moreno P, Verma D, Hill E, Drijkoningen J, Gilligan P, Esther CR, Noone PG, Giddings O, Bell SC, Thomson R, Wainwright CE, Coulter C, Pandey S, Wood ME, Stockwell RE, Ramsay KA, Sherrard LJ, Kidd TJ, Jabbour N, Johnson GR, Knibbs LD, Morawska L, Sly PD, Jones A, Bilton D, Laurenson I, Ruddy M, Bourke S, Bowler IC, Chapman SJ, Clayton A, Cullen M, Daniels T, Dempsey O, Denton M, Desai M, Drew RJ, Edenborough F, Evans J, Folb J, Humphrey H, Isalska B, Jensen-Fangel S, Jonsson B, Jones AM, Katzenstein TL, Lillebaek T, MacGregor G, Mayell S, Millar M, Modha D, Nash EF, O'Brien C, O'Brien D, Ohri C, Pao CS, Peckham D, Perrin F, Perry A, Pressler T, Prtak L, Qvist T, Robb A, Rodgers H, Schaffer K, Shafi N, van Ingen J, Walshaw M, Watson D, West N, Whitehouse J, Haworth CS, Harris SR, Ordway D, Parkhill J, Floto RA. Emergence and spread of a human-transmissible multidrug-resistant nontuberculous mycobacterium. Science. 2016 Nov 11;354(6313):751-757. doi: 10.1126/science.aaf8156.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Očekávaný)
1. května 2018
Primární dokončení (Očekávaný)
1. května 2019
Dokončení studie (Očekávaný)
1. května 2019
Termíny zápisu do studia
První předloženo
10. května 2018
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
10. května 2018
První zveřejněno (Aktuální)
22. května 2018
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
22. května 2018
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
10. května 2018
Naposledy ověřeno
1. května 2018
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- NTM_HOME
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Sekvenování celého genomu
-
University Hospital TuebingenGerman Consortium for Translational Cancer ResearchZatím nenabírámeNext-Generation-Sequencing
-
YiYang ZhuNeznámý