- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT03532438
WGS af NTM fra sputum fra NTM-lungesygdomspatienter og fra deres omgivelser (NTM_HOME)
10. maj 2018 opdateret af: Jae-Joon Yim, Seoul National University Hospital
Helgenomsekventering af ikke-tuberkuløs mykobakterie (NTM) afledt af sputumprøver fra NTM-lungesygdomspatienter, der lever sammen, og fra deres miljøprøver
Formålet med undersøgelsen er at identificere den genetiske nærhed af NTM, der stammer fra patienter, der bor sammen og fra deres omgivende miljø og at spore det tidsmæssige forhold mellem dem.
Studieoversigt
Status
Ukendt
Detaljeret beskrivelse
Efter NTM-isolering er udført ved hjælp af kultur, fra patienters sputum/bronkoskopiske prøver og deres miljøprøver, vil der blive udført helgenomsekventering (WGS) for alle NTM-isolater.
Fylogenetisk analyse vil blive udført baseret på enkelt nukleotidpolymorfi (SNP) på hver NTM.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Forventet)
6
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
-
Seoul, Korea, Republikken, 110-744
- Rekruttering
- Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
-
Kontakt:
- Jae-Joon Yim, MD
- Telefonnummer: +82-2-2072-2059
- E-mail: yimjj@snu.ac.kr
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)
Tager imod sunde frivillige
Ingen
Køn, der er berettiget til at studere
Alle
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Blandt de patienter, der besøgte Seoul National University Hospitals ambulatorium, blev par af voksne NTM-lungesygdomspatienter, som boede sammen på diagnosetidspunktet, tilmeldt.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Den voksne over 18 år
- Den patient, som har luftvejssymptomer i overensstemmelse med NTM, såsom kronisk hoste, opspyt og hæmotyse, som har NTM-positive fund på CT, og som har NTM-identifikation i to eller flere opspytkulturer eller i en eller flere bronkoskopiske/vævskulturer . (2007 ATS/IDSA-retningslinje)
- Par af patienter, der bor i samme husstand siden diagnosen NTM-lungesygdom
- Samtykke til indsamling af miljøprøver fra patientens bopæl.
Ekskluderingskriterier:
- Hvis patienten ikke er enig eller trækker sig.
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
---|
NTM patientgruppe
NTM lungesygdomspatienter, der bor sammen
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Genetisk lighed mellem NTM (Non-Tuberculous Mycobacterium)
Tidsramme: Baseline
|
Overensstemmelse mellem Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) fra NTM'er afledt af patienter og deres miljøer
|
Baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Jae-June Yim, MD, Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- Bryant JM, Grogono DM, Greaves D, Foweraker J, Roddick I, Inns T, Reacher M, Haworth CS, Curran MD, Harris SR, Peacock SJ, Parkhill J, Floto RA. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet. 2013 May 4;381(9877):1551-60. doi: 10.1016/S0140-6736(13)60632-7. Epub 2013 Mar 29.
- Fournier PE, Dubourg G, Raoult D. Clinical detection and characterization of bacterial pathogens in the genomics era. Genome Med. 2014 Nov 29;6(11):114. doi: 10.1186/s13073-014-0114-2. eCollection 2014.
- Roach DJ, Burton JN, Lee C, Stackhouse B, Butler-Wu SM, Cookson BT, Shendure J, Salipante SJ. A Year of Infection in the Intensive Care Unit: Prospective Whole Genome Sequencing of Bacterial Clinical Isolates Reveals Cryptic Transmissions and Novel Microbiota. PLoS Genet. 2015 Jul 31;11(7):e1005413. doi: 10.1371/journal.pgen.1005413. eCollection 2015 Jul. Erratum In: PLoS Genet. 2017 Apr 14;13(4):e1006724.
- Bryant JM, Grogono DM, Rodriguez-Rincon D, Everall I, Brown KP, Moreno P, Verma D, Hill E, Drijkoningen J, Gilligan P, Esther CR, Noone PG, Giddings O, Bell SC, Thomson R, Wainwright CE, Coulter C, Pandey S, Wood ME, Stockwell RE, Ramsay KA, Sherrard LJ, Kidd TJ, Jabbour N, Johnson GR, Knibbs LD, Morawska L, Sly PD, Jones A, Bilton D, Laurenson I, Ruddy M, Bourke S, Bowler IC, Chapman SJ, Clayton A, Cullen M, Daniels T, Dempsey O, Denton M, Desai M, Drew RJ, Edenborough F, Evans J, Folb J, Humphrey H, Isalska B, Jensen-Fangel S, Jonsson B, Jones AM, Katzenstein TL, Lillebaek T, MacGregor G, Mayell S, Millar M, Modha D, Nash EF, O'Brien C, O'Brien D, Ohri C, Pao CS, Peckham D, Perrin F, Perry A, Pressler T, Prtak L, Qvist T, Robb A, Rodgers H, Schaffer K, Shafi N, van Ingen J, Walshaw M, Watson D, West N, Whitehouse J, Haworth CS, Harris SR, Ordway D, Parkhill J, Floto RA. Emergence and spread of a human-transmissible multidrug-resistant nontuberculous mycobacterium. Science. 2016 Nov 11;354(6313):751-757. doi: 10.1126/science.aaf8156.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Forventet)
1. maj 2018
Primær færdiggørelse (Forventet)
1. maj 2019
Studieafslutning (Forventet)
1. maj 2019
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
10. maj 2018
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
10. maj 2018
Først opslået (Faktiske)
22. maj 2018
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
22. maj 2018
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
10. maj 2018
Sidst verificeret
1. maj 2018
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- NTM_HOME
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Helgenomsekventering
-
Centre Hospitalier Universitaire DijonRekrutteringPrænatal | Genomomfattende High Throughput SequencingFrankrig
-
vghtpe userYongLin Healthcare FoundationRekrutteringBrystkræft | Next Generation Sequencing (NGS)Taiwan
-
Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli...RekrutteringGenetisk disposition for sygdom | Genomlægning | Genom ustabilitetItalien
-
Shanghai 6th People's HospitalRekrutteringLungekræft | Knoglemetastaser | Single Cell Sequencing TechnologyKina
-
ArdigenMałopolskie Centre of EntrepreneurshipUkendtIkke småcellet lungekræft | Immunterapi | Neoantigener | Neoepitoper | Next Generation Sequencing (NGS) | Personlig neoantigen kræftvaccinePolen