- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT03532438
NTM:n WGS NTM-keuhkosairauspotilaiden ysköksestä ja heidän ympäristöstään (NTM_HOME)
torstai 10. toukokuuta 2018 päivittänyt: Jae-Joon Yim, Seoul National University Hospital
Yhdessä elävien NTM-keuhkosairauspotilaiden yskösnäytteestä ja heidän ympäristönäytteistään peräisin olevan nontuberkuloottisen mykobakteerin (NTM) koko genomin sekvensointi
Tutkimuksen tarkoituksena on tunnistaa yhdessä asuvista potilaista ja heidän ympäröivästä ympäristöstään peräisin olevan NTM:n geneettinen läheisyys ja jäljittää niiden välinen ajallinen suhde.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tuntematon
Yksityiskohtainen kuvaus
Kun NTM-eristys on tehty viljelmän avulla, potilaiden yskös-/bronkoskooppisista näytteistä ja niiden ympäristönäytteistä suoritetaan koko genomisekvenssi (WGS) kaikille NTM-isolaateille.
Fylogeneettinen analyysi suoritetaan kunkin NTM:n yksittäisen nukleotidin polymorfismin (SNP) perusteella.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
6
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Seoul, Korean tasavalta, 110-744
- Rekrytointi
- Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
-
Ottaa yhteyttä:
- Jae-Joon Yim, MD
- Puhelinnumero: +82-2-2072-2059
- Sähköposti: yimjj@snu.ac.kr
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Soulin kansallisen yliopistosairaalan poliklinikalla vierailevien potilaiden joukossa oli pari aikuisia NTM-keuhkosairauspotilaita, jotka asuivat yhdessä diagnoosin aikaan.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Yli 18-vuotias aikuinen
- Potilas, jolla on NTM:n mukaisia hengitystieoireita, kuten krooninen yskä, yskös ja verenvuoto, joilla on NTM-positiivisia löydöksiä TT:ssä ja joilla on NTM-tunniste kahdessa tai useammassa yskösviljelmässä tai yhdessä tai useammassa bronkoskooppisessa/kudosviljelmässä . (2007 ATS/IDSA-ohjeet)
- Potilasparit, jotka asuvat samassa taloudessa NTM-keuhkosairauden diagnoosin jälkeen
- Suostumus ympäristönäytteiden keräämiseen potilaan asunnosta.
Poissulkemiskriteerit:
- Jos potilas ei suostu tai vetäytyy.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
NTM-potilasryhmä
NTM-keuhkosairauspotilaat, jotka asuvat yhdessä
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
NTM:n (ei-tuberkuloosimykobakteerin) geneettinen samankaltaisuus
Aikaikkuna: Perustaso
|
Yhden nukleotidin polymorfismien (SNP) yhteensopivuus potilaista ja heidän ympäristöstään peräisin olevista NTM:istä
|
Perustaso
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Jae-June Yim, MD, Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Bryant JM, Grogono DM, Greaves D, Foweraker J, Roddick I, Inns T, Reacher M, Haworth CS, Curran MD, Harris SR, Peacock SJ, Parkhill J, Floto RA. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet. 2013 May 4;381(9877):1551-60. doi: 10.1016/S0140-6736(13)60632-7. Epub 2013 Mar 29.
- Fournier PE, Dubourg G, Raoult D. Clinical detection and characterization of bacterial pathogens in the genomics era. Genome Med. 2014 Nov 29;6(11):114. doi: 10.1186/s13073-014-0114-2. eCollection 2014.
- Roach DJ, Burton JN, Lee C, Stackhouse B, Butler-Wu SM, Cookson BT, Shendure J, Salipante SJ. A Year of Infection in the Intensive Care Unit: Prospective Whole Genome Sequencing of Bacterial Clinical Isolates Reveals Cryptic Transmissions and Novel Microbiota. PLoS Genet. 2015 Jul 31;11(7):e1005413. doi: 10.1371/journal.pgen.1005413. eCollection 2015 Jul. Erratum In: PLoS Genet. 2017 Apr 14;13(4):e1006724.
- Bryant JM, Grogono DM, Rodriguez-Rincon D, Everall I, Brown KP, Moreno P, Verma D, Hill E, Drijkoningen J, Gilligan P, Esther CR, Noone PG, Giddings O, Bell SC, Thomson R, Wainwright CE, Coulter C, Pandey S, Wood ME, Stockwell RE, Ramsay KA, Sherrard LJ, Kidd TJ, Jabbour N, Johnson GR, Knibbs LD, Morawska L, Sly PD, Jones A, Bilton D, Laurenson I, Ruddy M, Bourke S, Bowler IC, Chapman SJ, Clayton A, Cullen M, Daniels T, Dempsey O, Denton M, Desai M, Drew RJ, Edenborough F, Evans J, Folb J, Humphrey H, Isalska B, Jensen-Fangel S, Jonsson B, Jones AM, Katzenstein TL, Lillebaek T, MacGregor G, Mayell S, Millar M, Modha D, Nash EF, O'Brien C, O'Brien D, Ohri C, Pao CS, Peckham D, Perrin F, Perry A, Pressler T, Prtak L, Qvist T, Robb A, Rodgers H, Schaffer K, Shafi N, van Ingen J, Walshaw M, Watson D, West N, Whitehouse J, Haworth CS, Harris SR, Ordway D, Parkhill J, Floto RA. Emergence and spread of a human-transmissible multidrug-resistant nontuberculous mycobacterium. Science. 2016 Nov 11;354(6313):751-757. doi: 10.1126/science.aaf8156.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Odotettu)
Tiistai 1. toukokuuta 2018
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Keskiviikko 1. toukokuuta 2019
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Keskiviikko 1. toukokuuta 2019
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Torstai 10. toukokuuta 2018
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 10. toukokuuta 2018
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tiistai 22. toukokuuta 2018
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Tiistai 22. toukokuuta 2018
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 10. toukokuuta 2018
Viimeksi vahvistettu
Tiistai 1. toukokuuta 2018
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- NTM_HOME
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .