WGS de NTM de esputo de pacientes con enfermedad pulmonar por NTM y de sus entornos (NTM_HOME)
10 de mayo de 2018 actualizado por: Jae-Joon Yim, Seoul National University Hospital
Secuenciación del genoma completo de micobacterias no tuberculosas (NTM) derivadas de muestras de esputo de pacientes con enfermedad pulmonar por NTM que viven juntos y de sus muestras ambientales
El propósito del estudio es identificar la cercanía genética de las MNT derivadas de pacientes que viven juntos y de su entorno y rastrear la relación temporal entre ellos.
Descripción general del estudio
Estado
Desconocido
Descripción detallada
Después de realizar el aislamiento de NTM mediante cultivo, a partir de muestras broncoscópicas/de esputo de los pacientes y sus muestras ambientales, se realizará la secuenciación del genoma completo (WGS) para todos los aislamientos de NTM.
El análisis filogenético se realizará en función del polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) en cada NTM.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Anticipado)
6
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
-
-
-
Seoul, Corea, república de, 110-744
- Reclutamiento
- Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
-
Contacto:
- Jae-Joon Yim, MD
- Número de teléfono: +82-2-2072-2059
- Correo electrónico: yimjj@snu.ac.kr
-
-
Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años y mayores (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
No
Géneros elegibles para el estudio
Todos
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Entre los pacientes que visitaron la clínica ambulatoria del Hospital de la Universidad Nacional de Seúl, se inscribieron pares de pacientes adultos con enfermedad pulmonar por NTM que vivían juntos en el momento del diagnóstico.
Descripción
Criterios de inclusión:
- El adulto mayor de 18 años
- El paciente que tiene síntomas respiratorios consistentes con NTM, como tos crónica, esputo y hemoptisis, que tiene resultados positivos para NTM en la TC y que tiene identificación de NTM en dos o más cultivos de esputo o en uno o más cultivos broncoscópicos/tejidos. . (directriz ATS/IDSA de 2007)
- Pares de pacientes que viven en el mismo hogar desde el diagnóstico de enfermedad pulmonar por MNT
- Consentimiento para una recolección de muestras ambientales de la residencia del paciente.
Criterio de exclusión:
- Si el paciente no está de acuerdo o se retira.
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
|---|
|
Grupo de pacientes MNT
Pacientes con enfermedad pulmonar por NTM que viven juntos
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Similitud genética de NTM (Mycobacterium no tuberculoso)
Periodo de tiempo: Base
|
Concordancia de polimorfismos de nucleótido único (SNP) de NTM derivados de pacientes y sus entornos
|
Base
|
Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Jae-June Yim, MD, Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
Publicaciones y enlaces útiles
La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.
Publicaciones Generales
- Bryant JM, Grogono DM, Greaves D, Foweraker J, Roddick I, Inns T, Reacher M, Haworth CS, Curran MD, Harris SR, Peacock SJ, Parkhill J, Floto RA. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet. 2013 May 4;381(9877):1551-60. doi: 10.1016/S0140-6736(13)60632-7. Epub 2013 Mar 29.
- Fournier PE, Dubourg G, Raoult D. Clinical detection and characterization of bacterial pathogens in the genomics era. Genome Med. 2014 Nov 29;6(11):114. doi: 10.1186/s13073-014-0114-2. eCollection 2014.
- Roach DJ, Burton JN, Lee C, Stackhouse B, Butler-Wu SM, Cookson BT, Shendure J, Salipante SJ. A Year of Infection in the Intensive Care Unit: Prospective Whole Genome Sequencing of Bacterial Clinical Isolates Reveals Cryptic Transmissions and Novel Microbiota. PLoS Genet. 2015 Jul 31;11(7):e1005413. doi: 10.1371/journal.pgen.1005413. eCollection 2015 Jul. Erratum In: PLoS Genet. 2017 Apr 14;13(4):e1006724.
- Bryant JM, Grogono DM, Rodriguez-Rincon D, Everall I, Brown KP, Moreno P, Verma D, Hill E, Drijkoningen J, Gilligan P, Esther CR, Noone PG, Giddings O, Bell SC, Thomson R, Wainwright CE, Coulter C, Pandey S, Wood ME, Stockwell RE, Ramsay KA, Sherrard LJ, Kidd TJ, Jabbour N, Johnson GR, Knibbs LD, Morawska L, Sly PD, Jones A, Bilton D, Laurenson I, Ruddy M, Bourke S, Bowler IC, Chapman SJ, Clayton A, Cullen M, Daniels T, Dempsey O, Denton M, Desai M, Drew RJ, Edenborough F, Evans J, Folb J, Humphrey H, Isalska B, Jensen-Fangel S, Jonsson B, Jones AM, Katzenstein TL, Lillebaek T, MacGregor G, Mayell S, Millar M, Modha D, Nash EF, O'Brien C, O'Brien D, Ohri C, Pao CS, Peckham D, Perrin F, Perry A, Pressler T, Prtak L, Qvist T, Robb A, Rodgers H, Schaffer K, Shafi N, van Ingen J, Walshaw M, Watson D, West N, Whitehouse J, Haworth CS, Harris SR, Ordway D, Parkhill J, Floto RA. Emergence and spread of a human-transmissible multidrug-resistant nontuberculous mycobacterium. Science. 2016 Nov 11;354(6313):751-757. doi: 10.1126/science.aaf8156.
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Anticipado)
1 de mayo de 2018
Finalización primaria (Anticipado)
1 de mayo de 2019
Finalización del estudio (Anticipado)
1 de mayo de 2019
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
10 de mayo de 2018
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
10 de mayo de 2018
Publicado por primera vez (Actual)
22 de mayo de 2018
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
22 de mayo de 2018
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
10 de mayo de 2018
Última verificación
1 de mayo de 2018
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- NTM_HOME
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
NO
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .