NTM 폐 질환 환자의 가래와 그 환경에서 얻은 NTM의 WGS (NTM_HOME)
2018년 5월 10일 업데이트: Jae-Joon Yim, Seoul National University Hospital
동거 중인 NTM 폐질환 환자의 가래 검체와 이들의 환경 시료에서 유래한 비결핵성 항산균(NTM)의 전체 게놈 시퀀싱
본 연구의 목적은 함께 생활하는 환자와 주변 환경에서 유래한 NTM의 유전적 근접성을 확인하고 이들 간의 시간적 관계를 추적하는 것이다.
연구 개요
상태
알려지지 않은
상세 설명
환자의 가래/기관지경 검체 및 환경 검체로부터 배양을 통해 NTM 분리를 한 후, 모든 NTM 분리주에 대해 전체 게놈 시퀀싱(WGS)을 수행합니다.
계통발생학적 분석은 각 NTM에 대한 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)를 기반으로 수행됩니다.
연구 유형
관찰
등록 (예상)
6
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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-
-
Seoul, 대한민국, 110-744
- 모병
- Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
-
연락하다:
- Jae-Joon Yim, MD
- 전화번호: +82-2-2072-2059
- 이메일: yimjj@snu.ac.kr
-
-
참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
18년 이상 (성인, 고령자)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
서울대학교병원 외래에 내원한 환자 중 진단 당시 함께 살고 있던 성인 NTM 폐질환 환자 2쌍을 등록하였다.
설명
포함 기준:
- 만 18세 이상의 성인
- 만성기침, 가래, 객혈 등 NTM과 일치하는 호흡기 증상이 있는 환자로서 CT에서 NTM 양성 소견이 있고 2회 이상의 객담배양 또는 1회 이상의 기관지경/조직배양에서 NTM이 확인된 환자 . (2007 ATS/IDSA 가이드라인)
- NTM 폐질환 진단 이후 같은 집에 사는 환자 쌍
- 환자 거주지에서 환경 샘플 수집에 동의합니다.
제외 기준:
- 환자가 동의하거나 철회하지 않는 경우.
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
|---|
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NTM 환자 그룹
함께 사는 NTM 폐질환 환자
|
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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NTM(Non-Tuberculous Mycobacterium)의 유전적 유사성
기간: 기준선
|
환자와 그 환경에서 파생된 NTM의 SNP(Single Nucleotide Polymorphisms) 일치
|
기준선
|
공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 수석 연구원: Jae-June Yim, MD, Division of Pulmonology and Critical Care Medicine, Department of Internal Medicine and Lung Institute of Medical Research Center, Seoul National University College of Medicine
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
일반 간행물
- Bryant JM, Grogono DM, Greaves D, Foweraker J, Roddick I, Inns T, Reacher M, Haworth CS, Curran MD, Harris SR, Peacock SJ, Parkhill J, Floto RA. Whole-genome sequencing to identify transmission of Mycobacterium abscessus between patients with cystic fibrosis: a retrospective cohort study. Lancet. 2013 May 4;381(9877):1551-60. doi: 10.1016/S0140-6736(13)60632-7. Epub 2013 Mar 29.
- Fournier PE, Dubourg G, Raoult D. Clinical detection and characterization of bacterial pathogens in the genomics era. Genome Med. 2014 Nov 29;6(11):114. doi: 10.1186/s13073-014-0114-2. eCollection 2014.
- Roach DJ, Burton JN, Lee C, Stackhouse B, Butler-Wu SM, Cookson BT, Shendure J, Salipante SJ. A Year of Infection in the Intensive Care Unit: Prospective Whole Genome Sequencing of Bacterial Clinical Isolates Reveals Cryptic Transmissions and Novel Microbiota. PLoS Genet. 2015 Jul 31;11(7):e1005413. doi: 10.1371/journal.pgen.1005413. eCollection 2015 Jul. Erratum In: PLoS Genet. 2017 Apr 14;13(4):e1006724.
- Bryant JM, Grogono DM, Rodriguez-Rincon D, Everall I, Brown KP, Moreno P, Verma D, Hill E, Drijkoningen J, Gilligan P, Esther CR, Noone PG, Giddings O, Bell SC, Thomson R, Wainwright CE, Coulter C, Pandey S, Wood ME, Stockwell RE, Ramsay KA, Sherrard LJ, Kidd TJ, Jabbour N, Johnson GR, Knibbs LD, Morawska L, Sly PD, Jones A, Bilton D, Laurenson I, Ruddy M, Bourke S, Bowler IC, Chapman SJ, Clayton A, Cullen M, Daniels T, Dempsey O, Denton M, Desai M, Drew RJ, Edenborough F, Evans J, Folb J, Humphrey H, Isalska B, Jensen-Fangel S, Jonsson B, Jones AM, Katzenstein TL, Lillebaek T, MacGregor G, Mayell S, Millar M, Modha D, Nash EF, O'Brien C, O'Brien D, Ohri C, Pao CS, Peckham D, Perrin F, Perry A, Pressler T, Prtak L, Qvist T, Robb A, Rodgers H, Schaffer K, Shafi N, van Ingen J, Walshaw M, Watson D, West N, Whitehouse J, Haworth CS, Harris SR, Ordway D, Parkhill J, Floto RA. Emergence and spread of a human-transmissible multidrug-resistant nontuberculous mycobacterium. Science. 2016 Nov 11;354(6313):751-757. doi: 10.1126/science.aaf8156.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (예상)
2018년 5월 1일
기본 완료 (예상)
2019년 5월 1일
연구 완료 (예상)
2019년 5월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2018년 5월 10일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2018년 5월 10일
처음 게시됨 (실제)
2018년 5월 22일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2018년 5월 22일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2018년 5월 10일
마지막으로 확인됨
2018년 5월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
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아니요
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미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
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