Hodnocení vzoru methylace DNA u zdravých, sarkopenických, obézních a sarkopenických obézních starších žen: Průřezová studie
30. září 2024 aktualizováno: Ellen Cristini de Freitas, University of Sao Paulo
ÚVOD: Sarkopenická obezita (SO), funkční a klinický stav, je charakterizována koexistencí obezity, která se vyznačuje nadměrnou tukovou hmotou a sarkopenií, charakterizovanou snížením síly a svalové hmoty.
SO je spojen s větším rizikem nepříznivých klinických výsledků souvisejících se zdravím než starší dospělí se samotnou obezitou a sarkopenií.
Stárnutí je doprovázeno řadou epigenetických změn.
Tyto epigenetické změny související se stárnutím zahrnují methylaci DNA, modifikaci histonů, remodelaci chromatinu, regulaci nekódující RNA (ncRNA) a modifikaci RNA.
K methylaci DNA dochází na cytosinech v CpG dinukleotidech v genomu a podléhá změnám s věkem v různých lidských tkáních.
Kromě toho může být mnoho genů hypermethylováno nebo hypomethylováno na CpG ostrovech s procesem stárnutí.
Široký průzkum kandidátních genů může brzy poskytnout pohled na patogenezi sarkopenické obezity.
Pochopení toho, jak je stárnutí, konkrétně sarkopenie, obezita a sarkopenická obezita regulováno epigenetickými faktory, podporuje vývoj nových léčebných terapií.
Cílem tedy bude zhodnocení epigenetického vlivu na sarkopenickou obezitu u starších žen.
METODY: Tato průřezová studie bude zahrnovat 32 starších žen, které budou klasifikovány jako zdravé, se sarkopenií, obezitou a sarkopenickou obezitou žijící ve městě Ribeirão Preto - SP.
Starší dospělí provedou celkový a regionální sken těla pomocí iDXA, antropometrické hodnocení, testy funkční kapacity, odběr periferní krve pro analýzu biochemických markerů a epigenetiky.
Pro statistickou analýzu bude použit t test, ANOVA, lineární regresní modely a Pearsonova korelace.
Analýzy kompletního metylomu budou provedeny pomocí bioinformatických nástrojů včetně specifického softwaru.
OČEKÁVANÉ VÝSLEDKY: Očekává se, že u analyzovaných onemocnění budou rozdíly ve vzorcích metylace a genové exprese.
Kromě toho se očekává, že objasní, jak během tohoto procesu dochází k epigenetickým změnám.
Přehled studie
Postavení
Aktivní, ne nábor
Intervence / Léčba
Detailní popis
Velikost vzorku byla vypočítána a priori s ohledem na metylaci DNA jako primární výsledek na průzkumném základě.
Analýzy byly provedeny pomocí softwaru R (https://www.r-project.org).
Pro výpočet byla použita velikost účinku 0,65, alfa 0,05 a statistická síla 0,80.
Do studie tedy bude zahrnuto celkem 32 účastníků (n = 8 v každé skupině).
Stupeň methylace bude stanoven měřením množství markeru začleněného pro každou sondu.
Intenzity obrazu budou extrahovány pomocí Illumina Genome Studio 2011.1,
Software Methylation module 1.9.0.
Skóre methylace bude reprezentováno jako hodnota beta (p) podle poměru intenzity fluorescence.
Hodnoty beta mohou nabývat jakékoli hodnoty mezi 0 (nemethylovaný) a 1 (zcela metylovaný).
Následně budou intenzity snímků extrahovány z nezpracovaných dat (IDATS) pomocí balíčku Champ pro R (Statistical Computing, VIE, Rakousko).
Všechna data o methylaci celého genomu budou analyzována t-testem (v rámci skupin), následovaným Benjamini Hochbergovým testem.
Analýza obohacení dráhy bude provedena pomocí WEBGestalt a Reactome.
Normalita distribuce dat bude ověřena Shapiro Wilkovým testem a deskriptivní statistika se bude skládat ze středních hodnot a standardních odchylek.
K porovnání skupin bude použita ANOVA.
Pearsonovy korelace budou použity k posouzení korelace vzorců metylace DNA s fenotypovými proměnnými.
Lineární regresní modely budou použity k analýze predikce metylačního vzoru a vybraných proměnných.
Ve skupinách bude použit multinomický logistický regresní model pro asociaci s délkou telomer upravenou o BMI, věk, ALST).
Statistická významnost bude nastavena na 5 % a všechny analýzy budou provedeny pomocí softwaru Statistical Package for Social Sciences (SPSS verze 17.0 Inc.
Chicago, IL).
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Odhadovaný)
32
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
Sao Paulo
-
Ribeirao Preto, Sao Paulo, Brazílie
- University of São Paulo, School of Physical Education and Sports of Ribeirão Preto
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ano
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Účastníci budou rekrutováni prostřednictvím sociálních médií a na webových stránkách USP School of Body Education and Sports (EEFERP/USP).
Zájemci se musí zaregistrovat online a výzkumník je poté telefonicky kontaktuje, aby si domluvil rozhovor.
Popis
Kritéria zahrnutí:
- tělesná hmotnost < 120 kg;
- sedavý (nejméně 3 měsíce nepraktikující fyzické cvičení);
- neužívání vitamínových nebo minerálních doplňků, anxiolytických léků, hypoglykemických látek s aktivitou na enzymy cytochromu P450 (CYP450);
- klasifikované v rámci kritérií pro sarkopenickou obezitu, sarkopenii a obezitu.
Kritéria vyloučení:
- alkoholici;
- kuřáci;
- infekční nemoci;
- koronární onemocnění;
- chronická onemocnění ledvin a
- předložení skóre ≤ 13 za kognitivní vyšetření v Mini-Mental State Examination (MMSE).
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Zdravé starší ženy
Starší ženy, které nemají sarkopenii, obezitu nebo sarkopenickou obezitu.
|
Žádné (observační studie)
|
|
Starší ženy se sarkopenií
Starší ženy se sarkopenií, tedy nízkou silou úchopu a nízkým indexem svalové hmoty.
|
Žádné (observační studie)
|
|
Starší ženy s obezitou
|
Žádné (observační studie)
|
|
Starší ženy se sarkopenickou obezitou
Starší ženy se sarkopenickou obezitou, tedy nízkou silou úchopu, nízkým indexem svalové hmoty a vysokým indexem tělesné hmotnosti.
|
Žádné (observační studie)
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Zjistěte, zda zdravotní stav (zdravý, sarkopenický, obézní nebo se sarkopenickou obezitou) podporuje změny v metylaci DNA
Časové okno: 1 den
|
Za tímto účelem budou vzorky krve odebírány ráno po 12 hodinách hladovění do zkumavek EDTA zkušenými sestrami.
Bude odebráno 5 ml krve pro analýzu biochemických markerů a genetických markerů (DNA metylace a genová exprese).
Extrakce DNA z periferní krve bude provedena pomocí AllPrepDNA/RNA/miRNA Universal kit (Qiagen) podle návodu s použitím 200 µl extrahovaného materiálu.
Kvalita extrahované DNA bude hodnocena pomocí Greends DNA Quantification Reagent (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).
Po extrakci budou vzorky uloženy v mrazáku při -80 °C pro analýzu.
DNA bude bisulfitově převedena pomocí EZ DNA Methylation-Gold Conversion Kit (Zymo Research, CA, USA) podle pokynů s konverzí nemethylovaného cytosinu na uracil.
Specifická analýza metylace DNA na bázi pole bude provedena pomocí technologie Beadchip Infinium Human Methylation 850K (EPIC).
|
1 den
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Korelujte nalezené epigenetické proměnné s biochemickými markery, složením těla a fyzickou výkonností.
Časové okno: 1 den
|
K tomu budou provedena následující hodnocení: Šestiminutový test chůze: změří se celková vzdálenost (metry) za 6 minut. Test flexe v předloktí: skóre se získá celkovým počtem správně provedených flexí během 30 sekund. Měření síly stisku ruky: test síly stisku ruky v kg bude proveden pomocí ručního dynamometru: Skóre bude získáno celkovým počtem úplných provedení během 30 sekund. Složení těla bude provedeno celkovým a regionálním skenováním těla pomocí iDXA. Vyšetření poskytne měření v gramech celkového a regionálního těla (pravá a levá dolní končetina, trup, pravá a levá horní končetina a hlava): tukové hmoty (g); procento celkového a regionálního tuku (% G); minerální obsah kostí; appendicular štíhlá měkká tkáň bude určena součtem libové měkké tkáně dolních a horních končetin na pravé a levé straně. |
1 den
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
21. února 2024
Primární dokončení (Aktuální)
5. září 2024
Dokončení studie (Odhadovaný)
5. října 2024
Termíny zápisu do studia
První předloženo
23. září 2024
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
25. září 2024
První zveřejněno (Aktuální)
1. října 2024
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
2. října 2024
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
30. září 2024
Naposledy ověřeno
1. září 2024
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 73189623.6.0000.5659
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .