Valutazione del modello di metilazione del DNA in donne anziane sane, sarcopeniche, obese e obese sarcopeniche: uno studio trasversale
30 settembre 2024 aggiornato da: Ellen Cristini de Freitas, University of Sao Paulo
INTRODUZIONE: L'obesità sarcopenica (SO), una condizione funzionale e clinica, è caratterizzata dalla coesistenza di obesità, caratterizzata da eccesso di massa grassa e sarcopenia, caratterizzata da ridotta forza e massa muscolare.
La SO è associata a un rischio maggiore di esiti clinici avversi legati alla salute rispetto agli anziani affetti solo da obesità e sarcopenia.
L’invecchiamento è accompagnato da numerosi cambiamenti epigenetici.
Questi cambiamenti epigenetici associati all’invecchiamento includono la metilazione del DNA, la modificazione degli istoni, il rimodellamento della cromatina, la regolazione dell’RNA non codificante (ncRNA) e la modificazione dell’RNA.
La metilazione del DNA avviene nelle citosine dei dinucleotidi CpG nel genoma e subisce cambiamenti con l'età in vari tessuti umani.
Inoltre, molti geni possono essere ipermetilati o ipometilati sulle isole CpG con il processo di invecchiamento.
Presto, un’ampia esplorazione dei geni candidati potrebbe fornire informazioni sulla patogenesi dell’obesità sarcopenica.
Pertanto, comprendere come l’invecchiamento, in particolare la sarcopenia, l’obesità e l’obesità sarcopenica, sia regolato da fattori epigenetici, favorisce lo sviluppo di nuove terapie terapeutiche.
Pertanto, l'obiettivo sarà quello di valutare l'influenza epigenetica sull'obesità sarcopenica nelle donne anziane.
METODI: Questo studio trasversale includerà 32 donne anziane che saranno classificate come sane, con sarcopenia, obesità e obesità sarcopenica che vivono nella città di Ribeirão Preto - SP.
Gli anziani eseguiranno la scansione corporea totale e regionale utilizzando iDXA, valutazione antropometrica, test di capacità funzionale, raccolta di sangue periferico per l'analisi di marcatori biochimici ed epigenetica.
Per l'analisi statistica verranno utilizzati test t, ANOVA, modelli di regressione lineare e correlazione di Pearson.
Le analisi del metiloma completo verranno eseguite utilizzando strumenti bioinformatici, incluso software specifico.
RISULTATI ATTESI: Si prevede che ci saranno differenze nei modelli di metilazione e di espressione genica nelle malattie analizzate.
Inoltre, si prevede di chiarire come si verificano i cambiamenti epigenetici durante questo processo.
Panoramica dello studio
Stato
Attivo, non reclutante
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
La dimensione del campione è stata calcolata a priori, considerando la metilazione del DNA come risultato primario, su base esplorativa.
Le analisi sono state condotte utilizzando il software R (https://www.r-project.org).
Per il calcolo sono state utilizzate una dimensione dell'effetto di 0,65, un alfa di 0,05 e una potenza statistica di 0,80.
Pertanto, nello studio saranno inclusi un totale di 32 partecipanti (n = 8 in ciascun gruppo).
Il grado di metilazione sarà determinato misurando la quantità di marcatore incorporato per ciascuna sonda.
Le intensità dell'immagine verranno estratte utilizzando Illumina Genome Studio 2011.1,
Software del modulo di metilazione 1.9.0.
Il punteggio di metilazione sarà rappresentato come un valore beta (β) in base al rapporto di intensità di fluorescenza.
I valori beta possono assumere qualsiasi valore compreso tra 0 (non metilato) e 1 (completamente metilato).
Successivamente, le intensità dell'immagine verranno estratte dai dati grezzi (IDATS) utilizzando il pacchetto Champ per R (Statistical Computing, VIE, Austria).
Tutti i dati sulla metilazione dell'intero genoma saranno analizzati mediante t-test (all'interno dei gruppi), seguito dal test Benjamini Hochberg.
L'analisi dell'arricchimento del percorso verrà eseguita utilizzando WEBGestalt e Reactome.
La normalità della distribuzione dei dati sarà verificata mediante il test di Shapiro Wilk e le statistiche descrittive saranno costituite da valori di media e deviazione standard.
ANOVA verrà utilizzato per confrontare i gruppi.
Le correlazioni di Pearson verranno utilizzate per valutare la correlazione dei modelli di metilazione del DNA con le variabili fenotipiche.
Verranno applicati modelli di regressione lineare per analizzare la previsione del modello di metilazione e delle variabili selezionate.
Il modello di regressione logistica multinomiale verrà utilizzato nei gruppi per l'associazione con la lunghezza dei telomeri aggiustata per BMI, età, ALST).
La significatività statistica sarà fissata al 5% e tutte le analisi saranno eseguite utilizzando il software Statistical Package for Social Sciences (SPSS versione 17.0 Inc.
Chicago, IL).
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Stimato)
32
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Luoghi di studio
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Sao Paulo
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Ribeirao Preto, Sao Paulo, Brasile
- University of São Paulo, School of Physical Education and Sports of Ribeirão Preto
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Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Sì
Metodo di campionamento
Campione non probabilistico
Popolazione di studio
I partecipanti verranno reclutati attraverso i social media e sul sito web della USP School of Physical Education and Sports (EEFERP/USP).
I partecipanti interessati devono registrarsi online e il ricercatore li contatterà telefonicamente per fissare un colloquio.
Descrizione
Criteri di inclusione:
- massa corporea < 120 kg;
- sedentario (non pratica attività fisica da almeno 3 mesi);
- non utilizzare integratori vitaminici o minerali, farmaci ansiolitici, agenti ipoglicemizzanti con attività sugli enzimi del citocromo P450 (CYP450);
- classificati secondo i criteri di obesità sarcopenica, sarcopenia e obesità.
Criteri di esclusione:
- alcolisti;
- fumatori;
- malattie infettive;
- malattie coronariche;
- malattie renali croniche e
- presentando un punteggio ≤ 13 per l'esame cognitivo nel Mini-Mental State Examination (MMSE).
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Donne anziane sane
Donne anziane che non soffrono di sarcopenia, obesità o obesità sarcopenica.
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Nessuno (studio osservazionale)
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Donne anziane con sarcopenia
Donne anziane con sarcopenia, cioè bassa forza di presa e basso indice di massa muscolare.
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Nessuno (studio osservazionale)
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Donne anziane con obesità
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Nessuno (studio osservazionale)
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Donne anziane con obesità sarcopenica
Donne anziane con obesità sarcopenica, ovvero con bassa forza di presa, basso indice di massa muscolare e alto indice di massa corporea.
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Nessuno (studio osservazionale)
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Indagare se la condizione di salute (sano, sarcopenico, obeso o con obesità sarcopenica) promuove cambiamenti nella metilazione del DNA
Lasso di tempo: 1 giorno
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A questo scopo, i campioni di sangue verranno raccolti al mattino dopo 12 ore di digiuno in provette EDTA da infermieri esperti.
Verranno raccolti 5 ml di sangue per l'analisi dei marcatori biochimici e genetici (metilazione del DNA ed espressione genica).
L'estrazione del DNA dal sangue periferico verrà eseguita con il kit AllPrepDNA/RNA/miRNA Universal (Qiagen), secondo le istruzioni, utilizzando 200 µL del materiale estratto.
La qualità del DNA estratto sarà valutata con il Greends DNA Quantification Reagent (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).
Dopo l'estrazione, i campioni verranno conservati in un congelatore a -80°C per l'analisi.
Il DNA verrà convertito con bisolfito utilizzando il kit di conversione EZ DNA Methylation-Gold (Zymo Research, CA, USA) secondo le istruzioni, con conversione della citosina non metilata in uracile.
L'analisi specifica della metilazione del DNA basata su array verrà eseguita utilizzando la tecnologia Beadchip Infinium Human Methylation 850K (EPIC).
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1 giorno
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Correlare le variabili epigenetiche riscontrate con marcatori biochimici, composizione corporea e prestazione fisica.
Lasso di tempo: 1 giorno
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Per fare ciò verranno effettuate le seguenti valutazioni: Test del cammino di sei minuti: verrà misurata la distanza totale percorsa (metri) in 6 minuti. Test di flessione dell'avambraccio: il punteggio si ottiene dal numero totale di flessioni eseguite correttamente durante 30 secondi. Misurazione della forza della presa: il test della forza della presa in kg verrà eseguito utilizzando un dinamometro manuale: il punteggio sarà ottenuto dal numero totale di esecuzioni complete durante 30 secondi. La composizione corporea verrà eseguita mediante scansione corporea totale e regionale utilizzando iDXA. L'esame fornirà misurazioni in grammi del corpo totale e regionale (arti inferiori destro e sinistro, tronco, arti superiori destro e sinistro e testa) di: massa grassa (g); percentuale di grasso totale e regionale (% G); contenuto minerale osseo; Il tessuto molle magro appendicolare sarà determinato sommando il tessuto molle magro degli arti inferiori e superiori sui lati destro e sinistro. |
1 giorno
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Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
21 febbraio 2024
Completamento primario (Effettivo)
5 settembre 2024
Completamento dello studio (Stimato)
5 ottobre 2024
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
23 settembre 2024
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
25 settembre 2024
Primo Inserito (Effettivo)
1 ottobre 2024
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
2 ottobre 2024
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
30 settembre 2024
Ultimo verificato
1 settembre 2024
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 73189623.6.0000.5659
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
NO
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
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