Ocena wzorca metylacji DNA u zdrowych, sarkopenicznych, otyłych i sarkopenicznych starszych kobiet: badanie przekrojowe
30 września 2024 zaktualizowane przez: Ellen Cristini de Freitas, University of Sao Paulo
WSTĘP: Otyłość sarkopeniczna (SO), stan funkcjonalny i kliniczny, charakteryzuje się współistnieniem otyłości, charakteryzującej się nadmierną masą tłuszczową i sarkopenią, charakteryzującą się zmniejszoną siłą i masą mięśniową.
SO wiąże się z większym ryzykiem wystąpienia niekorzystnych skutków klinicznych związanych ze zdrowiem niż osoby starsze z samą otyłością i sarkopenią.
Starzeniu się towarzyszą liczne zmiany epigenetyczne.
Te zmiany epigenetyczne związane ze starzeniem obejmują metylację DNA, modyfikację histonów, przebudowę chromatyny, regulację niekodującego RNA (ncRNA) i modyfikację RNA.
Metylacja DNA zachodzi w cytozynach w dinukleotydach CpG w genomie i wraz z wiekiem ulega zmianom w różnych tkankach ludzkich.
Co więcej, wiele genów może ulegać hipermetylacji lub hipometylacji na wyspach CpG wraz z procesem starzenia.
Wkrótce szeroka eksploracja genów kandydujących może dostarczyć wglądu w patogenezę otyłości sarkopenicznej.
Dlatego zrozumienie, w jaki sposób starzenie się, w szczególności sarkopenia, otyłość i otyłość sarkopeniczna, są regulowane przez czynniki epigenetyczne, sprzyja opracowaniu nowych terapii terapeutycznych.
Zatem celem będzie ocena wpływu epigenetycznego na otyłość sarkopeniczną u starszych kobiet.
METODY: Badaniem przekrojowym zostaną objęte 32 starsze kobiety, które zostaną zaklasyfikowane jako zdrowe, z sarkopenią, otyłością i otyłością sarkopeniczną, mieszkające w mieście Ribeirão Preto – SP.
Osoby starsze wykonają całkowite i regionalne skanowanie ciała przy użyciu iDXA, ocenę antropometryczną, testy wydolności funkcjonalnej, pobranie krwi obwodowej do analizy markerów biochemicznych i epigenetyki.
Do analizy statystycznej wykorzystany zostanie test t, ANOVA, modele regresji liniowej i korelacja Pearsona.
Analizy całego metylomu zostaną przeprowadzone przy użyciu narzędzi bioinformatycznych, w tym specjalnego oprogramowania.
OCZEKIWANE WYNIKI: Oczekuje się, że w analizowanych chorobach wystąpią różnice we wzorcach metylacji i ekspresji genów.
Ponadto oczekuje się wyjaśnienia, w jaki sposób w całym procesie zachodzą zmiany epigenetyczne.
Przegląd badań
Status
Aktywny, nie rekrutujący
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Wielkość próbki obliczono a priori, biorąc pod uwagę metylację DNA jako główny wynik, na zasadzie eksploracyjnej.
Analizy przeprowadzono przy użyciu oprogramowania R (https://www.r-project.org).
Do obliczeń zastosowano wielkość efektu 0,65, alfa 0,05 i moc statystyczną 0,80.
Tym samym do badania zostanie włączonych ogółem 32 uczestników (n = 8 w każdej grupie).
Stopień metylacji zostanie określony poprzez pomiar ilości markera włączonego do każdej sondy.
Intensywność obrazu zostanie wyodrębniona przy użyciu Illumina Genome Studio 2011.1,
Oprogramowanie modułu metylacyjnego 1.9.0.
Wynik metylacji będzie reprezentowany jako wartość beta (β) zgodnie ze stosunkiem intensywności fluorescencji.
Wartości beta mogą przyjmować dowolną wartość od 0 (niemetylowany) do 1 (całkowicie metylowany).
Następnie intensywność obrazu zostanie wyodrębniona z surowych danych (IDATS) przy użyciu pakietu Champ dla R (Statistical Computing, VIE, Austria).
Wszystkie dane dotyczące metylacji całego genomu zostaną przeanalizowane za pomocą testu t (w obrębie grup), a następnie testu Benjaminiego Hochberga.
Analiza wzbogacenia ścieżki zostanie przeprowadzona przy użyciu WEBGestalt i Reactome.
Normalność rozkładu danych zostanie zweryfikowana za pomocą testu Shapiro Wilka, a statystyka opisowa będzie składać się z wartości średniej i odchylenia standardowego.
Do porównania grup zostanie użyta analiza ANOVA.
Korelacje Pearsona zostaną wykorzystane do oceny korelacji wzorców metylacji DNA ze zmiennymi fenotypowymi.
Do analizy przewidywania wzorca metylacji i wybranych zmiennych zostaną zastosowane modele regresji liniowej.
W grupach zastosowany zostanie wielomianowy model regresji logistycznej w celu powiązania z długością telomerów skorygowaną o BMI, wiek, ALST).
Istotność statystyczna zostanie ustalona na 5%, a wszystkie analizy zostaną przeprowadzone przy użyciu oprogramowania Statistical Package for Social Sciences (SPSS wersja 17.0 Inc.
Chicago, Illinois).
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Szacowany)
32
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
Sao Paulo
-
Ribeirao Preto, Sao Paulo, Brazylia
- University of São Paulo, School of Physical Education and Sports of Ribeirão Preto
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Rekrutacja uczestników będzie odbywać się za pośrednictwem mediów społecznościowych i strony internetowej Szkoły Wychowania Fizycznego i Sportu USP (EEFERP/USP).
Zainteresowani uczestnicy muszą zarejestrować się online, a badacz skontaktuje się z nimi telefonicznie w celu umówienia rozmowy kwalifikacyjnej.
Opis
Kryteria włączenia:
- masa ciała < 120 kg;
- siedzący tryb życia (nieuprawiający wysiłku fizycznego przez co najmniej 3 miesiące);
- niestosowanie suplementów witaminowych i mineralnych, leków przeciwlękowych, leków hipoglikemizujących działających na enzymy cytochromu P450 (CYP450);
- sklasyfikowane w ramach kryteriów otyłości sarkopenicznej, sarkopenii i otyłości.
Kryteria wykluczenia:
- alkoholicy;
- palacze;
- choroby zakaźne;
- choroby wieńcowe;
- przewlekłe choroby nerek i
- przedstawienie wyniku ≤ 13 z badania poznawczego w Mini-Mental State Examination (MMSE).
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Zdrowe starsze kobiety
Starsze kobiety, które nie mają sarkopenii, otyłości ani otyłości sarkopenicznej.
|
Brak (badanie obserwacyjne)
|
|
Starsze kobiety z sarkopenią
Starsze kobiety z sarkopenią, czyli niską siłą uścisku dłoni i niskim wskaźnikiem masy mięśniowej.
|
Brak (badanie obserwacyjne)
|
|
Starsze kobiety z otyłością
|
Brak (badanie obserwacyjne)
|
|
Starsze kobiety z otyłością sarkopeniczną
Starsze kobiety z otyłością sarkopeniczną, czyli niską siłą chwytu dłoni, niskim wskaźnikiem masy mięśniowej i wysokim wskaźnikiem masy ciała.
|
Brak (badanie obserwacyjne)
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Zbadaj, czy stan zdrowia (zdrowy, sarkopeniczny, otyły lub z otyłością sarkopeniczną) sprzyja zmianom w metylacji DNA
Ramy czasowe: 1 dzień
|
W tym celu próbki krwi będą pobierane rano po 12 godzinach postu w probówkach z EDTA przez doświadczone pielęgniarki.
Pobrane zostanie 5 ml krwi do analizy markerów biochemicznych i genetycznych (metylacja DNA i ekspresja genów).
Ekstrakcja DNA z krwi obwodowej zostanie przeprowadzona przy użyciu zestawu AllPrepDNA/RNA/miRNA Universal kit (Qiagen), zgodnie z instrukcją, przy użyciu 200 µl wyekstrahowanego materiału.
Jakość wyekstrahowanego DNA zostanie oceniona za pomocą odczynnika Greends DNA Quantification Reagent (Invitrogen, Carlsbad, Kalifornia, USA).
Po ekstrakcji próbki będą przechowywane w zamrażarce w temperaturze -80°C do analizy.
DNA zostanie poddane konwersji wodorosiarczynem przy użyciu zestawu EZ DNA Methylation-Gold Conversion Kit (Zymo Research, Kalifornia, USA) zgodnie z instrukcją, z konwersją niemetylowanej cytozyny do uracylu.
Specyficzna analiza metylacji DNA oparta na macierzy zostanie przeprowadzona przy użyciu technologii Beadchip Infinium Human Methylation 850K (EPIC).
|
1 dzień
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Powiąż znalezione zmienne epigenetyczne z markerami biochemicznymi, składem ciała i sprawnością fizyczną.
Ramy czasowe: 1 dzień
|
W tym celu zostaną wykonane następujące oceny: Sześciominutowy test marszu: zostanie zmierzony całkowity dystans (w metrach) przebyty w ciągu 6 minut. Test zgięcia przedramienia: wynik uzyskuje się na podstawie całkowitej liczby prawidłowo wykonanych zgięć w ciągu 30 sekund. Pomiar siły uścisku dłoni: badanie siły uścisku dłoni w kg zostanie przeprowadzone przy użyciu dynamometru ręcznego: Wynik zostanie uzyskany na podstawie całkowitej liczby pełnych powtórzeń w ciągu 30 sekund. Skład ciała zostanie przeprowadzony poprzez całkowite i regionalne skanowanie ciała przy użyciu iDXA. Podczas badania zostaną zmierzone w gramach ciała całkowitego i regionalnego (prawa i lewa kończyna dolna, tułów, prawa i lewa kończyna górna oraz głowa): masa tłuszczowa (g); procent tłuszczu całkowitego i regionalnego (% G); zawartość minerałów w kościach; beztłuszczową tkankę miękką wyrostka robaczkowego określa się poprzez zsumowanie beztłuszczowej tkanki miękkiej kończyn dolnych i górnych po prawej i lewej stronie. |
1 dzień
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
21 lutego 2024
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
5 września 2024
Ukończenie studiów (Szacowany)
5 października 2024
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
23 września 2024
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
25 września 2024
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
1 października 2024
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
2 października 2024
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
30 września 2024
Ostatnia weryfikacja
1 września 2024
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 73189623.6.0000.5659
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .