Evaluering af DNA-methyleringsmønster i sunde, sarkopeniske, overvægtige og sarkopeniske overvægtige ældre kvinder: en tværsnitsundersøgelse
30. september 2024 opdateret af: Ellen Cristini de Freitas, University of Sao Paulo
INTRODUKTION: Sarkopenisk fedme (SO), en funktionel og klinisk tilstand, er karakteriseret ved sameksistensen af fedme, præget af overskydende fedtmasse og sarkopeni, karakteriseret ved nedsat styrke og muskelmasse.
SO er forbundet med en større risiko for sundhedsrelaterede uønskede kliniske resultater end ældre voksne med fedme og sarkopeni alene.
Aldring er ledsaget af adskillige epigenetiske ændringer.
Disse aldringsassocierede epigenetiske ændringer omfatter DNA-methylering, histonmodifikation, kromatin-ombygning, ikke-kodende RNA (ncRNA)-regulering og RNA-modifikation.
DNA-methylering forekommer ved cytosiner i CpG-dinukleotider i genomet og undergår ændringer med alderen i forskellige menneskelige væv.
Desuden kan mange gener hypermethyleres eller hypomethyleres på CpG-øer med ældningsprocessen.
Snart kan en bred udforskning af kandidatgener give indsigt i patogenesen af sarkopenisk fedme.
Derfor fremmer forståelsen af, hvordan aldring, specifikt sarkopeni, fedme og sarkopenisk fedme, reguleres af epigenetiske faktorer, udviklingen af nye behandlingsterapier.
Målet vil således være at evaluere den epigenetiske indflydelse på sarkopenisk fedme hos ældre kvinder.
METODER: Denne tværsnitsundersøgelse vil omfatte 32 ældre kvinder, der vil blive klassificeret som raske, med sarkopeni, fedme og sarkopenisk fedme, der bor i byen Ribeirão Preto - SP.
De ældre voksne vil udføre total og regional kropsscanning ved hjælp af iDXA, antropometrisk vurdering, funktionelle kapacitetstests, perifer blodopsamling til analyse af biokemiske markører og epigenetik.
Til statistisk analyse vil blive brugt t-test, ANOVA, lineære regressionsmodeller og Pearson-korrelation.
Analyser af det komplette methylom vil blive udført ved hjælp af bioinformatiske værktøjer, herunder specifik software.
FORVENTEDE RESULTATER: Det forventes, at der vil være forskelle i mønstrene for methylering og genekspression i de analyserede sygdomme.
Derudover forventes det at klarlægge, hvordan epigenetiske ændringer opstår gennem hele denne proces.
Studieoversigt
Status
Aktiv, ikke rekrutterende
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Prøvestørrelsen blev beregnet a priori under hensyntagen til DNA-methylering som det primære resultat, på en eksplorativ basis.
Analyserne blev udført ved hjælp af R-software (https://www.r-project.org).
Til beregningen blev der brugt en effektstørrelse på 0,65, alfa 0,05 og statistisk styrke på 0,80.
Der vil således i alt indgå 32 deltagere i undersøgelsen (n = 8 i hver gruppe).
Graden af methylering vil blive bestemt ved at måle mængden af markør inkorporeret for hver probe.
Billedintensiteterne vil blive ekstraheret ved hjælp af Illumina Genome Studio 2011.1,
Methyleringsmodul 1.9.0 software.
Methyleringsscoren vil blive repræsenteret som en betaværdi (β) i henhold til fluorescensintensitetsforholdet.
Beta-værdier kan antage enhver værdi mellem 0 (umethyleret) og 1 (fuldstændig methyleret).
Efterfølgende vil billedintensiteterne blive udtrukket fra rådataene (IDATS) ved hjælp af Champ-pakken til R (Statistical Computing, VIE, Østrig).
Alle genomomfattende methyleringsdata vil blive analyseret ved t-test (inden for grupper), efterfulgt af Benjamini Hochberg-testen.
Pathway berigelse analyse vil blive udført ved hjælp af WEBGestalt og Reactome.
Normaliteten af datafordelingen vil blive verificeret af Shapiro Wilk-testen, og beskrivende statistik vil bestå af middelværdier og standardafvigelsesværdier.
ANOVA vil blive brugt til at sammenligne grupper.
Pearson-korrelationer vil blive brugt til at vurdere korrelationen af DNA-methyleringsmønstre med fænotypiske variable.
Lineære regressionsmodeller vil blive anvendt til at analysere forudsigelsen af methyleringsmønster og udvalgte variabler.
Den multinomielle logistiske regressionsmodel vil blive brugt i grupperne for association med telomerlængde justeret for BMI, alder, ALST).
Statistisk signifikans vil blive sat til 5 %, og alle analyser vil blive udført ved hjælp af softwaren Statistical Package for Social Sciences (SPSS version 17.0 Inc.
Chicago, IL).
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
32
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiesteder
-
-
Sao Paulo
-
Ribeirao Preto, Sao Paulo, Brasilien
- University of São Paulo, School of Physical Education and Sports of Ribeirão Preto
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Ja
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Deltagerne vil blive rekrutteret gennem sociale medier og på webstedet for USP School of Physical Education and Sports (EEFERP/USP).
Interesserede deltagere skal registrere sig online, og forskeren vil derefter kontakte dem telefonisk for at aftale et interview.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- kropsmasse < 120 kg;
- stillesiddende (ikke udøver fysisk træning i mindst 3 måneder);
- ikke bruger vitamin- eller mineraltilskud, angstdæmpende medicin, hypoglykæmiske midler med aktivitet på cytochrom P450 (CYP450) enzymer;
- klassificeret inden for kriterierne for sarkopenisk fedme, sarkopeni og fedme.
Ekskluderingskriterier:
- alkoholikere;
- rygere;
- infektionssygdomme;
- koronare sygdomme;
- kroniske nyresygdomme og
- præsentere en score ≤ 13 for den kognitive undersøgelse i Mini-Mental State Examination (MMSE).
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Sunde ældre kvinder
Ældre kvinder, der ikke har sarkopeni, fedme eller sarkopenisk fedme.
|
Ingen (observationsundersøgelse)
|
|
Ældre kvinder med sarkopeni
Ældre kvinder med sarkopeni, dvs lav håndgrebsstyrke og lavt muskelmasseindeks.
|
Ingen (observationsundersøgelse)
|
|
Ældre kvinder med overvægt
|
Ingen (observationsundersøgelse)
|
|
Ældre kvinder med sarkopenisk fedme
Ældre kvinder med sarkopenisk fedme, det vil sige lav håndgrebsstyrke, lavt muskelmasseindeks og højt kropsmasseindeks.
|
Ingen (observationsundersøgelse)
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Undersøg om sundhedstilstanden (sund, sarkopenisk, overvægtig eller med sarkopenisk fedme) fremmer ændringer i DNA-methylering
Tidsramme: 1 dag
|
Til dette formål vil der blive taget blodprøver om morgenen efter 12 timers faste i EDTA-rør af erfarne sygeplejersker.
5 ml blod vil blive indsamlet til analyse af biokemiske markører og genetiske markører (DNA-methylering og genekspression).
DNA-ekstraktion fra perifert blod vil blive udført med AllPrepDNA/RNA/miRNA Universal-sættet (Qiagen), i henhold til instruktionerne, ved at bruge 200 µL af det ekstraherede materiale.
Kvaliteten af det ekstraherede DNA vil blive vurderet med Greends DNA Quantification Reagent (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).
Efter ekstraktion vil prøverne blive opbevaret i en fryser ved -80°C til analyse.
DNA vil blive bisulfit-konverteret ved hjælp af EZ DNA Methylation-Gold Conversion Kit (Zymo Research, CA, USA) i henhold til instruktionerne, med omdannelse af umethyleret cytosin til uracil.
Array-baseret specifik DNA-methyleringsanalyse vil blive udført ved hjælp af Infinium Human Methylation 850K (EPIC) Beadchip-teknologi.
|
1 dag
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Korreler de epigenetiske variabler fundet med biokemiske markører, kropssammensætning og fysisk ydeevne.
Tidsramme: 1 dag
|
For at gøre dette vil følgende vurderinger blive udført: Seks minutters gangtest: Den samlede tilbagelagte distance (meter) på 6 minutter vil blive målt. Underarmsfleksionstest: scoren opnås ved det samlede antal bøjninger udført korrekt i løbet af 30 sekunder. Håndgrebsstyrkemåling: Håndgrebsstyrketesten i kg udføres ved hjælp af et hånddynamometer: Scoren opnås ved det samlede antal komplette henrettelser i løbet af 30 sekunder. Kropssammensætning vil blive udført ved total og regional kropsscanning ved hjælp af iDXA. Eksamen vil give målinger i gram af total og regional krop (højre og venstre underekstremiteter, krop, højre og venstre øvre lemmer og hoved) af: fedtmasse (g); procentdel af totalt og regionalt fedt (% G); knoglemineralindhold; appendikulært magert blødt væv vil blive bestemt ved at summere det magre bløde væv i de nedre og øvre lemmer på højre og venstre side. |
1 dag
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
21. februar 2024
Primær færdiggørelse (Faktiske)
5. september 2024
Studieafslutning (Anslået)
5. oktober 2024
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
23. september 2024
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
25. september 2024
Først opslået (Faktiske)
1. oktober 2024
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
2. oktober 2024
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
30. september 2024
Sidst verificeret
1. september 2024
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 73189623.6.0000.5659
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .