- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT06625203
Neintervenční, mezinárodní, multicentrická klinická výzkumná studie k vybudování největší sbírky multimodálních dat (včetně klinických dat, zobrazovacích dat a dat Omics) v onkologii (MOSAIC)
Multi Omics a prostorový atlas v rakovině
Rakovina patří mezi hlavní příčiny nemocnosti a úmrtnosti související s nemocemi. Hlavní výzvou v léčbě rakoviny je vývoj biologických, personalizovaných léčebných strategií. Nedávné pokroky v technologiích umělé inteligence (AI) a sekvenování nové generace (NGS) přinesly další vhled do biologie onemocnění a léčebných cest, a tak identifikovaly nové, přesné terapeutické možnosti založené na medicíně.
Biologické mechanismy vedoucí k rozvoji a progresi rakoviny vycházejí ze složitých a plastických sítí dysregulovaných buněčných programů zahrnujících mnoho signálních drah a efektorových molekul. Rakovinné buňky mění své okolní prostředí prostřednictvím interakcí buňka-buňka s nenádorovými buňkami nebo sekrecí cytokinů, chemokinů a dalších faktorů. Toto přeprogramování nádorového mikroprostředí (TME) je rozhodující pro progresi rakoviny, invazi a metastázy. Navíc přibývá studií, které ukazují, že jak typy vrozených, tak adaptivních imunitních buněk přispívají k tumorigenezi a rezistenci na léčbu, pokud jsou přítomny v TME. Pochopení přeslechů mezi rakovinnými buňkami a okolním TME poskytne informace o mechanismech citlivosti a odolnosti vůči léčbě, včetně imunoterapie (IO) a cílených terapií.
Prostorově rozlišená Omics je nově vznikající obor, který charakterizuje buněčné typy genovými/proteinovými expresemi v jejich prostorovém kontextu v organizaci tkání. Nedávné vysoce profilové studie prostorové transkriptomiky odhalily specifické buněčné identity, které definují okolní TME.
Studie MOSAIC, společná iniciativa napříč průmyslem a špičkovými onkologickými nemocnicemi, navrhuje jít nad rámec současných projektů molekulárního profilování rakoviny tím, že kombinuje generování a analýzu různých datových modalit (3 základní povinné modality: klinická data, hematoxylin a eosin (H&E) mikroskopické obraz, prostorová transkriptomika až 3 modality dat s vysokou prioritou v závislosti na technické proveditelnosti a velikosti vzorku: hromadné sekvenování ribonukleových kyselin (RNAseq), hromadné sekvenování celého exomu (WES), jednobuněčná transkriptomika a potenciálně další volitelné datové modality a následné zpracování; experimenty, jako je jednobuněčná omika, imunohistochemie a prostorová proteomika nebo jiné molekulární profilování proteinů a molekul) na minimálně 2 000 vzorcích nádorů v různých indikacích rakoviny. To vytvoří široká molekulární a buněčná profilová data nádoru a jeho mikroprostředí od pacientů s rakovinou, integrovaná s klinickými daty, v bezprecedentním měřítku a rozlišení.
Do této studie budou zařazeni pacienti s diagnostikovanou jednou z vhodných indikací rakoviny, pro které je v jejich místním patologickém archivu nebo v archivech jejich přidružených center k dispozici vzorek tumoru zalitého v parafínu (FFPE) z již provedené biopsie a/nebo chirurgické resekce.
Očekává se, že studie MOSAIC bude mít silný dopad na pacienty, pokud jde o objevování nových cílených terapeutických léků, identifikaci podskupin pacientů vyžadujících buď specifickou léčbu nebo širší klinickou péči a identifikaci nových mechanismů odpovědi na léčbu a rezistence.
Přehled studie
Postavení
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Hubert Chaperon
- Telefonní číslo: +33 6 45 63 71 12
- E-mail: hubert.chaperon@owkin.com
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Ginevra Ferrarini
- E-mail: ginevra.ferrarini@owkin.com
Studijní místa
-
-
-
Paris, Francie
- Nábor
- Gustave Roussy
-
Kontakt:
- Ingrid-Judith Garberis, MD PhD
- Telefonní číslo: +33 1 42 1 32 58
- E-mail: ingrid-judith.garberis@gustaveroussy.fr
-
Kontakt:
- Prof. Cécile Badoual
- E-mail: Cecile.BADOUAL@gustaveroussy.fr
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Prof. Fabrice André
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Dr. Alexandra Leary
-
-
-
-
-
Berlin, Německo
- Nábor
- Charité - Universitätsmedizin Berlin
-
Kontakt:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
- Telefonní číslo: +49 30 450 564621
- E-mail: ulrich.keilholz@charite.de
-
Kontakt:
- Dr. rer. nat. Jenny Kollek
- E-mail: jenny.kollek@charite.de
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
-
Erlangen, Německo
- Nábor
- Universiy Hospital Erlangen & FAU Erlangen-Nürnberg
-
Kontakt:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
- Telefonní číslo: +49 9131 85 43584
- E-mail: markus.eckstein@uk-erlangen.de
-
Kontakt:
- PD Dr. med. Ramona Erber
- E-mail: ramona.erber@uk-erlangen.de
-
Vrchní vyšetřovatel:
- PD Dr. med. Ramona Erber
-
Vrchní vyšetřovatel:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
-
-
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, Spojené státy, 15238
- Nábor
- University of Pittsburgh
-
Kontakt:
- Devin Dressman, Ph.D.
- Telefonní číslo: 412-647-8258
- E-mail: rowlesbm@upmc.edu
-
Kontakt:
- Aaron Smith, Ph.D.
- E-mail: smithag7@upmc.edu
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Devin Dressman, Ph.D.
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Dr. Adrian Lee
-
-
-
-
-
Lausanne, Švýcarsko
- Nábor
- Centre Hospitalier Universitaire Vaudois
-
Kontakt:
- Roberto Coletti, Ph.D.
- Telefonní číslo: +41 79 556 9271
- E-mail: roberto.colotti@chuv.ch
-
Kontakt:
- Katy Billot
- E-mail: katy.billot@chuv.ch
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Dr. Raphael Gottardo
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Dr. Krisztian Homicsko
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria zahrnutí:
- Pacient byl v době odběru/souhlasu starší 18 let.
- Dostupnost informovaného souhlasu pacienta nebo formuláře bez námitek k provedení průzkumného výzkumu, který odpovídá alespoň jednomu z cílů MOSAIC (pokud není uděleno povolení místní institucionální kontrolní radou / nezávislou etickou komisí (IRB/IEC) pro použití vzorků ve studii podle místních předpisů a zákonů).
- Mít potvrzenou diagnózu na základě mezinárodních kritérií pro příslušný typ nádoru.
- Potvrzená dostupnost tkáně fixovaná ve formalínu a zalité v parafínu (FFPE) pro generování alespoň 3 základních datových modalit a přednostně všech datových modalit MOSAIC.
- Potvrzená dostupnost souvisejících klinických údajů.
Kvalifikace parafinového tkáňového bloku splňující všechny následující požadavky:
- Očekávaný typ nádoru
- Pro solidní nádory (všechny indikace rakoviny kromě difuzního velkobuněčného B lymfomu (DLBCL)): Obsah nádorových buněk v rozmezí od 40 % do 80 % na řezu hematoxylinem a eosinem (H&E) v rámci specifikované oblasti, jak je diktováno laboratorním protokolem specifickým pro danou oblast. použitá technika
- Pro DLBCL minimálně 80 % vysoce kvalitního komponentu na H&E sekci ve specifikované oblasti, jak je diktováno laboratorním protokolem specifickým pro používanou techniku.
- Kdykoli je to možné, tloušťka zbývající tkáně musí být větší než 125 mikrometrů (orientační rozsah)
- Vzorek nádoru musí být <10 let
Kromě toho bude mít každá podskupina v rámci každé indikace rakoviny specifická kritéria pro zařazení (např. stadium onemocnění; místo odběru vzorků; přijatá léčba…).
Kritéria vyloučení:
1. Vzorky bez zachované tkáňové architektury, jako jsou cytologie a cytobloky.
Navíc každá podskupina v rámci každé indikace rakoviny může mít specifická vylučovací kritéria (např. histologický podtyp; anamnéza imunosuprese; atd…).
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Pacienti s diagnostikovanou jednou z vhodných rakovin a mající alespoň jeden archivovaný vzorek FFPE
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Primárním koncovým bodem budou geny nebo proteiny, které vykazují vlastnosti kompatibilní s cílením léčiv a/nebo novými biomarkery a které jsou specifické pro danou populaci pacientů v rámci jedné nebo více indikací rakoviny.
Časové okno: Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
K dosažení tohoto cíle bude použita nekontrolovaná analýza dat a měření výsledků, jako je prognóza během léčby, reakce na specifické terapie. Odpověď na terapii bude posouzena na základě údajů týkajících se léčby a její účinnosti shromážděných prostřednictvím elektronického formuláře pro hlášení případu. U každého pacienta na začátku a během období sledování MOSAIC to pomohou vyhodnotit následující údaje: všechny různé způsoby léčby rakoviny (chirurgické operace,…) a jejich výsledky; souběžná léčba (název léku, …); stav rakoviny, tj. úplná nebo částečná odpověď nebo progrese, měřená v různých časových bodech specifických pro každý typ nádoru. Vzhledem k tomu, že studie bude využívat vzorky nádorů odebrané z velké části před < 10 lety, informace o přežití nemusí být na konci studie k dispozici pro všechny pacienty, zejména u pomalu se vyvíjejících typů nádorů. Z tohoto důvodu budeme používat prognostické markery a skóre specifické pro typ nádoru jako zástupné ukazatele prognózy, kdykoli jsou dostupné a nutné. |
Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Biologické mechanismy a/nebo cesty spojené s výsledky léčby pacienta, nezávisle na terapeutickém potenciálu
Časové okno: Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
|
Nová klasifikace podskupin pacientů v rámci každé indikace rakoviny na základě jedné nebo více datových modalit, které představují homogenní biologii
Časové okno: Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
|
Nové biomarkery, které mohou být: jeden gen/protein nebo signatura; histologický nebo prostorový rys; kombinovaný biomarker, ideálně přenositelný do rutinního klinického použití, který předpovídá prognózu nebo jiné klinicky použitelné informace.
Časové okno: Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
Od data diagnózy rakoviny do data úmrtí, data ztráty sledování, data odvolání souhlasu nebo data ukončení studie (prosinec 2028), podle toho, co nastane dříve, hodnoceno do 16 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Studijní židle: Dr. Vassili Soumelis, OWKIN
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Hanahan D, Coussens LM. Accessories to the crime: functions of cells recruited to the tumor microenvironment. Cancer Cell. 2012 Mar 20;21(3):309-22. doi: 10.1016/j.ccr.2012.02.022.
- Wu Y, Yang S, Ma J, Chen Z, Song G, Rao D, Cheng Y, Huang S, Liu Y, Jiang S, Liu J, Huang X, Wang X, Qiu S, Xu J, Xi R, Bai F, Zhou J, Fan J, Zhang X, Gao Q. Spatiotemporal Immune Landscape of Colorectal Cancer Liver Metastasis at Single-Cell Level. Cancer Discov. 2022 Jan;12(1):134-153. doi: 10.1158/2159-8290.CD-21-0316. Epub 2021 Aug 20.
- Rao A, Barkley D, Franca GS, Yanai I. Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics. Nature. 2021 Aug;596(7871):211-220. doi: 10.1038/s41586-021-03634-9. Epub 2021 Aug 11.
- Meylan M, Petitprez F, Becht E, Bougouin A, Pupier G, Calvez A, Giglioli I, Verkarre V, Lacroix G, Verneau J, Sun CM, Laurent-Puig P, Vano YA, Elaidi R, Mejean A, Sanchez-Salas R, Barret E, Cathelineau X, Oudard S, Reynaud CA, de Reynies A, Sautes-Fridman C, Fridman WH. Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer. Immunity. 2022 Mar 8;55(3):527-541.e5. doi: 10.1016/j.immuni.2022.02.001. Epub 2022 Feb 28.
- Gonzalez H, Hagerling C, Werb Z. Roles of the immune system in cancer: from tumor initiation to metastatic progression. Genes Dev. 2018 Oct 1;32(19-20):1267-1284. doi: 10.1101/gad.314617.118.
- Hegde PS, Chen DS. Top 10 Challenges in Cancer Immunotherapy. Immunity. 2020 Jan 14;52(1):17-35. doi: 10.1016/j.immuni.2019.12.011.
- Cable DM, Murray E, Zou LS, Goeva A, Macosko EZ, Chen F, Irizarry RA. Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics. Nat Biotechnol. 2022 Apr;40(4):517-526. doi: 10.1038/s41587-021-00830-w. Epub 2021 Feb 18.
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 23.00242.000244
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Pseudonymizovaná, předem zpracovaná a minimalizovaná data patřící podskupině zesnulých pacientů budou zpřístupněna výzkumníkům v Evropském archivu genomu (EGA). Tento projekt se nazývá MOSAIC-Window.
Navíc po deseti letech výzkumné studie MOSAIC budou shromážděná a vygenerovaná data v rámci MOSAIC anonymizována v souladu s platnými zákony a předpisy a veřejná verze dat MOSAIC bude uvolněna pro výzkumné účely. O podmínkách a způsobech anonymizace rozhodne specializovaná komise studie.
Časový rámec sdílení IPD
Kritéria přístupu pro sdílení IPD
Před nahráním dat do EGA společnost Owkin zajistí, aby všechny osobní údaje vložené do datových sad byly pseudonymizovány a šifrovány jak při přenosu, tak v klidu. Společnost Owkin je odpovědná za získání a prokázání existence informovaného souhlasu subjektů údajů nebo jakéhokoli jiného vhodného právního základu pro zpracování osobních údajů, za získání příslušných etických nebo jiných souhlasů se shromažďováním údajů a za dodržování platných zákonů o ochraně údajů.
Výzkumníci z institucí mimo konsorcium MOSAIC budou moci požádat o přístup k těmto datům a specifikovat výzkumné otázky, na které chtějí odpovědět. Výbor pro přístup k datům (DAC) vyhodnotí žádost výzkumníka a rozhodne, zda udělí přístup k datové sadě MOSAIC-Window či nikoli. Pokud bude žádost úspěšná, bude výzkumník souhlasit s podmínkami stanovenými DAC (např. Creative Common License, žádná zpětná identifikace pacientů atd.) a poté bude moci stáhnout data pro analýzu.
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .