Um estudo de pesquisa clínica multicêntrico, internacional e não intervencionista para construir a maior coleção de dados multimodais (incluindo dados clínicos, dados de imagem e dados ômicos) em oncologia (MOSAIC)
Multi Omics e Atlas Espacial no Câncer
O câncer está entre as principais causas de morbidade e mortalidade relacionadas a doenças. Um grande desafio no tratamento do câncer é o desenvolvimento de estratégias de tratamento personalizadas e baseadas na biologia. Avanços recentes nas tecnologias de inteligência artificial (IA) e sequenciamento de próxima geração (NGS) forneceram mais informações sobre a biologia das doenças e as vias de tratamento, identificando assim novas oportunidades terapêuticas baseadas em medicamentos de precisão.
Os mecanismos biológicos que levam ao desenvolvimento e progressão do câncer surgem de redes complexas e plásticas de programas celulares desregulados, envolvendo muitas vias de sinalização e moléculas efetoras. As células cancerosas alteram o ambiente circundante através de interações célula-célula com células não tumorais ou pela secreção de citocinas, quimiocinas e outros fatores. Esta reprogramação do microambiente tumoral (TME) é crítica para a progressão, invasão e metástase do câncer. Além disso, há estudos crescentes que mostram que tanto os tipos de células imunes inatas quanto as adaptativas contribuem para a tumorigênese e a resistência ao tratamento quando presentes no TME. A compreensão do crosstalk entre as células cancerígenas e o TME circundante informará sobre os mecanismos de sensibilidade e resistência ao tratamento, incluindo a imunoterapia (IO) e as terapias direcionadas.
Omics espacialmente resolvidos é um campo emergente que caracteriza os tipos de células por expressões de genes/proteínas dentro de seu contexto espacial na organização do tecido. Estudos recentes de transcriptômica espacial de alto perfil descobriram identidades celulares específicas que definem o TME circundante.
O estudo MOSAIC, uma iniciativa colaborativa entre a indústria e os principais hospitais oncológicos, propõe ir muito além dos projetos atuais de perfil molecular do câncer, combinando a geração e análise de múltiplas modalidades de dados (3 modalidades obrigatórias essenciais: Dados Clínicos, Hematoxilina e Eosina (H&E) microscópica imagem, Transcriptômica espacial até 3 modalidades de dados de alta prioridade dependendo da viabilidade técnica e tamanho da amostra: sequenciamento de ácido ribonucleico em massa (RNAseq), sequenciamento de exoma completo em massa (WES), transcriptômica de célula única e potencialmente outras modalidades de dados opcionais e acompanhamento; realizar experimentos como ômica unicelular, imuno-histoquímica e proteômica espacial ou outro perfil molecular de proteínas e moléculas) em um mínimo de 2.000 amostras de tumor em diferentes indicações de câncer. Isto irá gerar amplos dados de perfil molecular e celular do tumor e do seu microambiente de pacientes com câncer, integrados com dados clínicos, em uma escala e resolução sem precedentes.
Este estudo inscreverá pacientes com diagnóstico de uma das indicações de câncer elegíveis e para os quais uma amostra de tumor fixada em formalina e embebida em parafina (FFPE) de biópsia e/ou ressecção cirúrgica já realizada está disponível em seu arquivo de patologia local ou nos arquivos de seus centros afiliados.
O estudo MOSAIC espera ter um forte impacto para os pacientes em termos de descoberta de novos medicamentos terapêuticos direcionados, identificação de subgrupos de pacientes que requerem tratamento específico ou cuidados clínicos mais amplos e identificação de novos mecanismos de resposta e resistência ao tratamento.
Visão geral do estudo
Status
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Hubert Chaperon
- Número de telefone: +33 6 45 63 71 12
- E-mail: hubert.chaperon@owkin.com
Estude backup de contato
- Nome: Ginevra Ferrarini
- E-mail: ginevra.ferrarini@owkin.com
Locais de estudo
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Berlin, Alemanha
- Recrutamento
- Charité - Universitätsmedizin Berlin
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Contato:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
- Número de telefone: +49 30 450 564621
- E-mail: ulrich.keilholz@charite.de
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Contato:
- Dr. rer. nat. Jenny Kollek
- E-mail: jenny.kollek@charite.de
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Investigador principal:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
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Erlangen, Alemanha
- Recrutamento
- Universiy Hospital Erlangen & FAU Erlangen-Nürnberg
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Contato:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
- Número de telefone: +49 9131 85 43584
- E-mail: markus.eckstein@uk-erlangen.de
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Contato:
- PD Dr. med. Ramona Erber
- E-mail: ramona.erber@uk-erlangen.de
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Investigador principal:
- PD Dr. med. Ramona Erber
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Investigador principal:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
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Pennsylvania
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Pittsburgh, Pennsylvania, Estados Unidos, 15238
- Recrutamento
- University of Pittsburgh
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Contato:
- Devin Dressman, Ph.D.
- Número de telefone: 412-647-8258
- E-mail: rowlesbm@upmc.edu
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Contato:
- Aaron Smith, Ph.D.
- E-mail: smithag7@upmc.edu
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Investigador principal:
- Devin Dressman, Ph.D.
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Investigador principal:
- Dr. Adrian Lee
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Paris, França
- Recrutamento
- Gustave Roussy
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Contato:
- Ingrid-Judith Garberis, MD PhD
- Número de telefone: +33 1 42 1 32 58
- E-mail: ingrid-judith.garberis@gustaveroussy.fr
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Contato:
- Prof. Cécile Badoual
- E-mail: Cecile.BADOUAL@gustaveroussy.fr
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Investigador principal:
- Prof. Fabrice André
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Subinvestigador:
- Dr. Alexandra Leary
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Lausanne, Suíça
- Recrutamento
- Centre Hospitalier Universitaire Vaudois
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Contato:
- Roberto Coletti, Ph.D.
- Número de telefone: +41 79 556 9271
- E-mail: roberto.colotti@chuv.ch
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Contato:
- Katy Billot
- E-mail: katy.billot@chuv.ch
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Investigador principal:
- Dr. Raphael Gottardo
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Subinvestigador:
- Dr. Krisztian Homicsko
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critérios de inclusão:
- Que o paciente tinha mais de 18 anos quando a amostra foi coletada/consentida.
- Disponibilidade de consentimento informado do paciente ou formulário de não oposição para realizar pesquisas exploratórias correspondentes a pelo menos um dos objetivos do MOSAIC (a menos que autorização seja concedida pelo Conselho de Revisão Institucional local/Comitê de Ética Independente (IRB/IEC) para o uso de amostras no estudo de acordo com os regulamentos e leis locais).
- Ter um diagnóstico confirmado com base em critérios internacionais para o tipo de tumor relevante.
- Disponibilidade confirmada de tecido fixado em formalina e embebido em parafina (FFPE) para gerar pelo menos as três modalidades de dados principais e, preferencialmente, todas as modalidades de dados MOSAIC.
- Disponibilidade confirmada de dados clínicos associados.
Qualificação do bloco de tecido de parafina atendendo a todos os seguintes:
- Ser do tipo de tumor esperado
- Para tumores sólidos (todas as indicações de câncer, exceto linfoma difuso de grandes células B (DLBCL)): Conteúdo de células tumorais variando de 40% a 80% em uma seção de hematoxilina e eosina (H&E) dentro de uma área especificada, conforme ditado pelo protocolo de laboratório específico para o técnica utilizada
- Para DLBCL, um mínimo de 80% de componente de alto grau em uma seção de H&E dentro de uma área especificada, conforme ditado pelo protocolo de laboratório específico para a técnica utilizada
- Sempre que possível, a espessura restante do tecido deve ser superior a 125 micrômetros (faixa indicativa)
- A amostra do tumor deve ter <10 anos
Além disso, cada subcoorte dentro de cada indicação de cancro terá critérios de inclusão específicos (por exemplo, estádio da doença; local de amostragem; tratamento recebido…).
Critérios de exclusão:
1. Amostras sem arquitetura tecidual preservada, como citologias e citoblocos.
Além disso, cada subcoorte dentro de cada indicação de cancro pode ter critérios de exclusão específicos (por exemplo, subtipo histológico; história de imunossupressão; etc...).
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
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Pacientes diagnosticados com um dos cânceres elegíveis e com pelo menos uma amostra FFPE arquivada
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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O endpoint primário serão genes ou proteínas que apresentem características compatíveis com o direcionamento de medicamentos e/ou novos biomarcadores, e que sejam específicos para uma determinada população de pacientes dentro de uma ou mais indicações de câncer.
Prazo: Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Análise de dados não supervisionada e medidas de resultados serão usadas para conseguir isso, como prognóstico sob tratamento, resposta a terapias específicas. A resposta à terapia será avaliada com base nos dados relacionados ao tratamento e sua eficácia coletados por meio de Formulário de Relato de Caso eletrônico. Para cada paciente no início do estudo e durante todo o período de acompanhamento MOSAIC, os seguintes dados ajudarão a avaliar isto: todos os diferentes tratamentos contra o cancro (cirurgia,…) e os seus resultados; o tratamento concomitante (nome do medicamento,…); o estado do câncer, isto é, resposta completa ou parcial, ou progressão, medida em vários momentos específicos para cada tipo de tumor. Como o estudo utilizará amostras de tumores coletadas em grande parte há menos de 10 anos, as informações de sobrevivência podem não estar presentes para todos os pacientes até o final do estudo, especialmente em tipos de tumores de evolução lenta. Por esse motivo, usaremos marcadores e escores prognósticos específicos do tipo de tumor como substitutos do prognóstico sempre que disponíveis e necessários. |
Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Prazo |
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Mecanismos e/ou vias biológicas associadas aos resultados dos pacientes em tratamento, independentemente do potencial terapêutico
Prazo: Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Nova classificação de subgrupos de pacientes dentro de cada indicação de câncer, com base em uma ou mais modalidades de dados, representando biologia homogênea
Prazo: Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Novos biomarcadores que podem ser: um único gene/proteína ou uma assinatura; uma característica histológica ou espacial; um biomarcador combinado, idealmente transferível para uso clínico de rotina e que prevê prognóstico ou outras informações clinicamente acionáveis.
Prazo: Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Desde a data do diagnóstico de câncer até a data do óbito, data da perda de acompanhamento, data da retirada do consentimento ou data de término do estudo (dezembro de 2028), o que ocorrer primeiro, avaliado até 16 anos
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Cadeira de estudo: Dr. Vassili Soumelis, OWKIN
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Hanahan D, Coussens LM. Accessories to the crime: functions of cells recruited to the tumor microenvironment. Cancer Cell. 2012 Mar 20;21(3):309-22. doi: 10.1016/j.ccr.2012.02.022.
- Wu Y, Yang S, Ma J, Chen Z, Song G, Rao D, Cheng Y, Huang S, Liu Y, Jiang S, Liu J, Huang X, Wang X, Qiu S, Xu J, Xi R, Bai F, Zhou J, Fan J, Zhang X, Gao Q. Spatiotemporal Immune Landscape of Colorectal Cancer Liver Metastasis at Single-Cell Level. Cancer Discov. 2022 Jan;12(1):134-153. doi: 10.1158/2159-8290.CD-21-0316. Epub 2021 Aug 20.
- Rao A, Barkley D, Franca GS, Yanai I. Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics. Nature. 2021 Aug;596(7871):211-220. doi: 10.1038/s41586-021-03634-9. Epub 2021 Aug 11.
- Meylan M, Petitprez F, Becht E, Bougouin A, Pupier G, Calvez A, Giglioli I, Verkarre V, Lacroix G, Verneau J, Sun CM, Laurent-Puig P, Vano YA, Elaidi R, Mejean A, Sanchez-Salas R, Barret E, Cathelineau X, Oudard S, Reynaud CA, de Reynies A, Sautes-Fridman C, Fridman WH. Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer. Immunity. 2022 Mar 8;55(3):527-541.e5. doi: 10.1016/j.immuni.2022.02.001. Epub 2022 Feb 28.
- Gonzalez H, Hagerling C, Werb Z. Roles of the immune system in cancer: from tumor initiation to metastatic progression. Genes Dev. 2018 Oct 1;32(19-20):1267-1284. doi: 10.1101/gad.314617.118.
- Hegde PS, Chen DS. Top 10 Challenges in Cancer Immunotherapy. Immunity. 2020 Jan 14;52(1):17-35. doi: 10.1016/j.immuni.2019.12.011.
- Cable DM, Murray E, Zou LS, Goeva A, Macosko EZ, Chen F, Irizarry RA. Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics. Nat Biotechnol. 2022 Apr;40(4):517-526. doi: 10.1038/s41587-021-00830-w. Epub 2021 Feb 18.
Links úteis
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 23.00242.000244
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
Dados pseudonimizados, pré-processados e minimizados pertencentes a um subconjunto de pacientes falecidos serão disponibilizados aos pesquisadores no Arquivo Europeu do Genoma-Fenômeno (EGA). Este projeto é denominado MOSAIC-Window.
Além disso, após os dez anos do estudo de pesquisa MOSAIC, os dados coletados e gerados no MOSAIC serão anonimizados em conformidade com as leis e regulamentos aplicáveis, e uma versão pública dos dados do MOSAIC será divulgada para fins de pesquisa. Um comitê dedicado do estudo decidirá sobre as condições e modalidades do anonimato.
Prazo de Compartilhamento de IPD
Critérios de acesso de compartilhamento IPD
Antes de enviar os dados para o EGA, Owkin garante que todos os dados pessoais incorporados nos conjuntos de dados sejam pseudonimizados e criptografados tanto em trânsito quanto em repouso. A Owkin é responsável por obter e demonstrar a existência do consentimento informado dos titulares dos dados ou qualquer outra base legal adequada para o processamento de dados pessoais, obter aprovações éticas ou outras aprovações apropriadas para a coleta de dados e cumprir as leis de proteção de dados aplicáveis.
Investigadores de instituições fora do Consórcio MOSAIC poderão solicitar acesso a estes dados, especificando as questões de investigação que pretendem responder. Um Comitê de Acesso a Dados (DAC) avaliará a inscrição do pesquisador e decidirá se concederá ou não acesso ao conjunto de dados MOSAIC-Window. Se a candidatura for bem-sucedida, o investigador concordará com os termos e condições definidos pela CAD (ex. licença comum criativa, sem reidentificação de pacientes, etc.) e então poderá baixar os dados para análise.
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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