Un estudio de investigación clínica multicéntrico, internacional y no intervencionista para crear la mayor colección de datos multimodales (incluidos datos clínicos, datos de imágenes y datos ómicos) en oncología (MOSAIC)
Multiómicas y atlas espacial en cáncer
El cáncer se encuentra entre las principales causas de morbilidad y mortalidad relacionadas con enfermedades. Un desafío importante en el tratamiento del cáncer es el desarrollo de estrategias de tratamiento personalizadas basadas en la biología. Los avances recientes en inteligencia artificial (IA) y tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) han arrojado más conocimientos sobre la biología de las enfermedades y las vías de tratamiento, identificando así nuevas oportunidades terapéuticas basadas en la medicina de precisión.
Los mecanismos biológicos que conducen al desarrollo y progresión del cáncer surgen de redes complejas y plásticas de programas celulares desregulados que involucran muchas vías de señalización y moléculas efectoras. Las células cancerosas alteran su entorno circundante mediante interacciones célula-célula con células no tumorales o mediante la secreción de citocinas, quimiocinas y otros factores. Esta reprogramación del microambiente tumoral (TME) es fundamental para la progresión, invasión y metástasis del cáncer. Además, cada vez hay más estudios que muestran que tanto los tipos de células inmunitarias innatas como las adaptativas contribuyen a la tumorigénesis y la resistencia al tratamiento cuando están presentes en el TME. Comprender la interacción entre las células cancerosas y el TME circundante informará sobre los mecanismos de sensibilidad y resistencia al tratamiento, incluida la inmunoterapia (IO) y las terapias dirigidas.
La ómica resuelta espacialmente es un campo emergente que caracteriza tipos de células mediante expresiones de genes/proteínas dentro de su contexto espacial en la organización del tejido. Estudios recientes de transcriptómica espacial de alto perfil han descubierto identidades celulares específicas que definen el TME circundante.
El estudio MOSAIC, una iniciativa de colaboración entre la industria y los principales hospitales de oncología, propone ir mucho más allá de los proyectos actuales de perfiles moleculares del cáncer al combinar la generación y el análisis de múltiples modalidades de datos (3 modalidades obligatorias esenciales: datos clínicos, hematoxilina y eosina (H&E) microscópica imagen, transcriptómica espacial hasta 3 modalidades de datos de alta prioridad según la viabilidad técnica y el tamaño de la muestra: secuenciación masiva de ácido ribonucleico (RNAseq), secuenciación masiva del exoma completo (WES), transcriptómica unicelular y potencialmente otras modalidades de datos opcionales; experimentos como ómica unicelular, inmunohistoquímica y proteómica espacial u otros perfiles moleculares de proteínas y moléculas) en un mínimo de 2.000 muestras de tumores en diferentes indicaciones de cáncer. Esto generará amplios datos de perfiles moleculares y celulares del tumor y su microambiente de pacientes con cáncer, integrados con datos clínicos, a una escala y resolución sin precedentes.
Este estudio inscribirá a pacientes diagnosticados con una de las indicaciones de cáncer elegibles y para los cuales una muestra de tumor fijada con formalina e incluida en parafina (FFPE) de una biopsia y/o resección quirúrgica ya realizada está disponible en su archivo de patología local o en los archivos de sus centros afiliados.
Se espera que el estudio MOSAIC tenga un fuerte impacto para los pacientes en términos de descubrimiento de nuevos fármacos terapéuticos dirigidos, identificación de subgrupos de pacientes que requieren tratamiento específico o atención clínica más amplia e identificación de nuevos mecanismos de resistencia y respuesta al tratamiento.
Descripción general del estudio
Estado
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Hubert Chaperon
- Número de teléfono: +33 6 45 63 71 12
- Correo electrónico: hubert.chaperon@owkin.com
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Ginevra Ferrarini
- Correo electrónico: ginevra.ferrarini@owkin.com
Ubicaciones de estudio
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Berlin, Alemania
- Reclutamiento
- Charité - Universitätsmedizin Berlin
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Contacto:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
- Número de teléfono: +49 30 450 564621
- Correo electrónico: ulrich.keilholz@charite.de
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Contacto:
- Dr. rer. nat. Jenny Kollek
- Correo electrónico: jenny.kollek@charite.de
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Investigador principal:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
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Erlangen, Alemania
- Reclutamiento
- Universiy Hospital Erlangen & FAU Erlangen-Nürnberg
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Contacto:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
- Número de teléfono: +49 9131 85 43584
- Correo electrónico: markus.eckstein@uk-erlangen.de
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Contacto:
- PD Dr. med. Ramona Erber
- Correo electrónico: ramona.erber@uk-erlangen.de
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Investigador principal:
- PD Dr. med. Ramona Erber
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Investigador principal:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
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Pennsylvania
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Pittsburgh, Pennsylvania, Estados Unidos, 15238
- Reclutamiento
- University of Pittsburgh
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Contacto:
- Devin Dressman, Ph.D.
- Número de teléfono: 412-647-8258
- Correo electrónico: rowlesbm@upmc.edu
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Contacto:
- Aaron Smith, Ph.D.
- Correo electrónico: smithag7@upmc.edu
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Investigador principal:
- Devin Dressman, Ph.D.
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Investigador principal:
- Dr. Adrian Lee
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Paris, Francia
- Reclutamiento
- Gustave Roussy
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Contacto:
- Ingrid-Judith Garberis, MD PhD
- Número de teléfono: +33 1 42 1 32 58
- Correo electrónico: ingrid-judith.garberis@gustaveroussy.fr
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Contacto:
- Prof. Cécile Badoual
- Correo electrónico: Cecile.BADOUAL@gustaveroussy.fr
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Investigador principal:
- Prof. Fabrice André
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Sub-Investigador:
- Dr. Alexandra Leary
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Lausanne, Suiza
- Reclutamiento
- Centre Hospitalier Universitaire Vaudois
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Contacto:
- Roberto Coletti, Ph.D.
- Número de teléfono: +41 79 556 9271
- Correo electrónico: roberto.colotti@chuv.ch
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Contacto:
- Katy Billot
- Correo electrónico: katy.billot@chuv.ch
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Investigador principal:
- Dr. Raphael Gottardo
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Sub-Investigador:
- Dr. Krisztian Homicsko
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Que el paciente era mayor de 18 años en el momento de la toma/consentimiento de la muestra.
- Disponibilidad de consentimiento informado del paciente o formulario de no oposición para realizar una investigación exploratoria que coincida con al menos uno de los objetivos de MOSAIC (a menos que la Junta de Revisión Institucional/Comité de Ética Independiente (IRB/IEC) local otorgue autorización para el uso de muestras en el estudio). de acuerdo con las regulaciones y leyes locales).
- Tener un diagnóstico confirmado basado en criterios internacionales para el tipo de tumor relevante.
- Disponibilidad confirmada de tejido fijado con formalina e incluido en parafina (FFPE) para generar al menos las 3 modalidades de datos principales y, preferentemente, todas las modalidades de datos MOSAIC.
- Disponibilidad confirmada de datos clínicos asociados.
Calificación del bloque de tejido de parafina que cumple con todo lo siguiente:
- Ser del tipo de tumor esperado.
- Para tumores sólidos (todas las indicaciones de cáncer, excepto el linfoma difuso de células B grandes (DLBCL)): contenido de células tumorales que oscila entre el 40 % y el 80 % en una sección de hematoxilina y eosina (H&E) dentro de un área específica según lo dictado por el protocolo de laboratorio específico para el técnica utilizada
- Para DLBCL, un mínimo del 80 % de componente de alta calidad en una sección H&E dentro de un área específica según lo dictado por el protocolo de laboratorio específico para la técnica utilizada.
- Siempre que sea posible, el espesor del tejido restante debe ser superior a 125 micrómetros (rango indicativo)
- La muestra del tumor debe tener <10 años.
Además, cada subcohorte dentro de cada indicación de cáncer tendrá criterios de inclusión específicos (p. ej., estadio de la enfermedad; lugar de muestreo; tratamiento recibido…).
Criterios de exclusión:
1. Muestras sin arquitectura tisular preservada, como citologías y citobloqueos.
Además, cada subcohorte dentro de cada indicación de cáncer puede tener criterios de exclusión específicos (p. ej. subtipo histológico; antecedentes de inmunosupresión; etc…).
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
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Pacientes diagnosticados con uno de los cánceres elegibles y que tengan al menos una muestra FFPE archivada
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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El criterio de valoración principal serán genes o proteínas que presenten características compatibles con la dirección de fármacos y/o nuevos biomarcadores, y que sean específicos de una población de pacientes determinada dentro de una o más indicaciones de cáncer.
Periodo de tiempo: Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Para lograr esto, se utilizarán análisis de datos no supervisados y medidas de resultados, como el pronóstico bajo tratamiento y la respuesta a terapias específicas. La respuesta a la terapia se evaluará en función de los datos relacionados con el tratamiento y su eficacia recopilados a través de un formulario electrónico de informe de caso. Para cada paciente al inicio del estudio y durante todo el período de seguimiento de MOSAIC, los siguientes datos ayudarán a evaluarlo: todos los diferentes tratamientos contra el cáncer (cirugía,...) y sus resultados; el tratamiento concurrente (nombre del medicamento,…); el estado del cáncer, es decir, respuesta o progresión completa o parcial, medida en varios momentos específicos de cada tipo de tumor. Debido a que el estudio utilizará muestras de tumores recolectadas en gran medida hace menos de 10 años, es posible que la información de supervivencia no esté disponible para todos los pacientes al final del estudio, especialmente en tipos de tumores de evolución lenta. Por este motivo, utilizaremos puntuaciones y marcadores de pronóstico específicos del tipo de tumor como sustitutos del pronóstico siempre que estén disponibles y sean necesarios. |
Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Periodo de tiempo |
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Mecanismos biológicos y/o vías asociadas a los resultados del paciente en tratamiento, independientemente del potencial terapéutico.
Periodo de tiempo: Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Clasificación novedosa de subgrupos de pacientes dentro de cada indicación de cáncer, basada en una o más modalidades de datos, que representan una biología homogénea
Periodo de tiempo: Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Nuevos biomarcadores que pueden ser: un único gen/proteína o una firma; una característica histológica o espacial; un biomarcador combinado, idealmente transferible al uso clínico de rutina, y que predice el pronóstico u otra información clínicamente procesable.
Periodo de tiempo: Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Desde la fecha del diagnóstico de cáncer hasta la fecha de muerte, fecha de pérdida de seguimiento, fecha de retirada del consentimiento o fecha de finalización del estudio (diciembre de 2028), lo que ocurra primero, evaluado hasta 16 años
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Silla de estudio: Dr. Vassili Soumelis, OWKIN
Publicaciones y enlaces útiles
Publicaciones Generales
- Hanahan D, Coussens LM. Accessories to the crime: functions of cells recruited to the tumor microenvironment. Cancer Cell. 2012 Mar 20;21(3):309-22. doi: 10.1016/j.ccr.2012.02.022.
- Wu Y, Yang S, Ma J, Chen Z, Song G, Rao D, Cheng Y, Huang S, Liu Y, Jiang S, Liu J, Huang X, Wang X, Qiu S, Xu J, Xi R, Bai F, Zhou J, Fan J, Zhang X, Gao Q. Spatiotemporal Immune Landscape of Colorectal Cancer Liver Metastasis at Single-Cell Level. Cancer Discov. 2022 Jan;12(1):134-153. doi: 10.1158/2159-8290.CD-21-0316. Epub 2021 Aug 20.
- Rao A, Barkley D, Franca GS, Yanai I. Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics. Nature. 2021 Aug;596(7871):211-220. doi: 10.1038/s41586-021-03634-9. Epub 2021 Aug 11.
- Meylan M, Petitprez F, Becht E, Bougouin A, Pupier G, Calvez A, Giglioli I, Verkarre V, Lacroix G, Verneau J, Sun CM, Laurent-Puig P, Vano YA, Elaidi R, Mejean A, Sanchez-Salas R, Barret E, Cathelineau X, Oudard S, Reynaud CA, de Reynies A, Sautes-Fridman C, Fridman WH. Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer. Immunity. 2022 Mar 8;55(3):527-541.e5. doi: 10.1016/j.immuni.2022.02.001. Epub 2022 Feb 28.
- Gonzalez H, Hagerling C, Werb Z. Roles of the immune system in cancer: from tumor initiation to metastatic progression. Genes Dev. 2018 Oct 1;32(19-20):1267-1284. doi: 10.1101/gad.314617.118.
- Hegde PS, Chen DS. Top 10 Challenges in Cancer Immunotherapy. Immunity. 2020 Jan 14;52(1):17-35. doi: 10.1016/j.immuni.2019.12.011.
- Cable DM, Murray E, Zou LS, Goeva A, Macosko EZ, Chen F, Irizarry RA. Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics. Nat Biotechnol. 2022 Apr;40(4):517-526. doi: 10.1038/s41587-021-00830-w. Epub 2021 Feb 18.
Enlaces Útiles
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
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Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
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Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 23.00242.000244
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
Descripción del plan IPD
Los datos seudonimizados, preprocesados y minimizados pertenecientes a un subconjunto de pacientes fallecidos se pondrán a disposición de los investigadores en el Archivo Europeo Genoma-Fenoma (EGA). Este proyecto se llama MOSAIC-Window.
Además, después de los diez años del estudio de investigación MOSAIC, los datos recopilados y generados dentro de MOSAIC se anonimizarán de conformidad con las leyes y regulaciones aplicables, y se publicará una versión pública de los datos de MOSAIC para fines de investigación. Un comité específico del estudio decidirá las condiciones y modalidades de la anonimización.
Marco de tiempo para compartir IPD
Criterios de acceso compartido de IPD
Antes de cargar los datos en EGA, Owkin se asegura de que todos los datos personales incorporados en los conjuntos de datos estén seudonimizados y cifrados tanto en tránsito como en reposo. Owkin es responsable de obtener y demostrar la existencia del consentimiento informado de los interesados o cualquier otra base legal adecuada para procesar datos personales, obtener aprobaciones éticas o de otro tipo apropiadas para recopilar los datos y cumplir con las leyes de protección de datos aplicables.
Los investigadores de instituciones ajenas al Consorcio MOSAIC podrán solicitar acceso a estos datos, especificando las preguntas de investigación que quieran responder. Un Comité de Acceso a Datos (DAC) evaluará la solicitud del investigador y decidirá si otorga acceso al conjunto de datos de MOSAIC-Window o no. Si la solicitud tiene éxito, el investigador aceptará los términos y condiciones definidos por el DAC (p. ej. licencia creative common, sin reidentificación de pacientes, etc.) y luego podrá descargar los datos para su análisis.
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .