En ikke-interventionel, international, multicenter klinisk forskningsundersøgelse for at opbygge den største samling af multimodale data (inklusive kliniske data, billeddata og Omics-data) inden for onkologi (MOSAIC)
Multi Omics og Spatial Atlas i Kræft
Kræft er blandt de førende årsager til sygdomsrelateret sygelighed og dødelighed. En stor udfordring i kræftbehandling er udviklingen af biologi-informerede, personlige behandlingsstrategier. Nylige fremskridt inden for kunstig intelligens (AI) og næste generations sekventeringsteknologier (NGS) har kastet yderligere indsigt i sygdomsbiologi og behandlingsveje, og dermed identificeret nye, præcise medicin-baserede terapeutiske muligheder.
De biologiske mekanismer, der fører til kræftudvikling og -progression, opstår fra komplekse og plastiske netværk af dysregulerede cellulære programmer, der involverer mange signalveje og effektormolekyler. Kræftceller ændrer deres omgivende miljø via celle-celle-interaktioner med ikke-tumorceller eller ved at udskille cytokiner, kemokiner og andre faktorer. Denne omprogrammering af tumormikromiljøet (TME) er afgørende for cancerprogression, invasion og metastasering. Desuden er der stigende undersøgelser, der viser, at både medfødte og adaptive immuncelletyper bidrager til tumorgenese og behandlingsresistens, når de er til stede i TME. Forståelse af krydstale mellem kræftceller og den omgivende TME vil informere om mekanismer for følsomhed og resistens over for behandling, herunder immunterapi (IO) og målrettede terapier.
Spatally resolved-Omics er et fremvoksende felt, der karakteriserer celletyper ved gen-/proteinudtryk inden for deres rumlige kontekst i vævsorganisationen. Nylige højprofilerede rumlige transkriptomiske undersøgelser har afsløret specifikke celleidentiteter, der definerer den omgivende TME.
MOSAIC-undersøgelsen, et samarbejdsinitiativ på tværs af industrien og de bedste onkologiske hospitaler, foreslår at gå langt ud over nuværende kræftmolekylære profileringsprojekter ved at kombinere generering og analyse af flere datamodaliteter (3 essentielle obligatoriske modaliteter: Kliniske data, hæmatoxylin og eosin (H&E) mikroskopisk image, Spatial transcriptomics op til 3 højprioritetsdatamodaliteter afhængigt af teknisk gennemførlighed og prøvestørrelse: bulk-ribonukleinsyresekventering (RNAseq), bulk-heleksom-sekventering (WES), enkeltcellet transkriptomik og potentielt andre valgfrie datamodaliteter; op-eksperimenter såsom enkeltcellede omics, immunhistokemi og rumlig proteomik eller anden molekylær profilering af proteiner og molekyler) på minimum 2.000 tumorprøver på tværs af forskellige cancerindikationer. Dette vil generere brede molekylære og cellulære profileringsdata for tumoren og dens mikromiljø fra cancerpatienter, integreret med kliniske data, i en hidtil uset skala og opløsning.
Denne undersøgelse vil inkludere patienter diagnosticeret med en af de kvalificerede cancerindikationer, og for hvilke en formalinfikseret paraffinindlejret (FFPE) tumorprøve fra allerede udført biopsi og/eller kirurgisk resektion er tilgængelig i deres lokale patologiarkiv eller deres tilknyttede centres arkiver.
MOSAIC-studiet forventer at have en stærk effekt for patienter i form af nye målrettede terapeutiske lægemidler, identifikation af patientundergrupper, der kræver enten specifik behandling eller bredere klinisk pleje og identifikation af nye behandlingsrespons- og resistensmekanismer.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Hubert Chaperon
- Telefonnummer: +33 6 45 63 71 12
- E-mail: hubert.chaperon@owkin.com
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Ginevra Ferrarini
- E-mail: ginevra.ferrarini@owkin.com
Studiesteder
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, Forenede Stater, 15238
- Rekruttering
- University of Pittsburgh
-
Kontakt:
- Devin Dressman, Ph.D.
- Telefonnummer: 412-647-8258
- E-mail: rowlesbm@upmc.edu
-
Kontakt:
- Aaron Smith, Ph.D.
- E-mail: smithag7@upmc.edu
-
Ledende efterforsker:
- Devin Dressman, Ph.D.
-
Ledende efterforsker:
- Dr. Adrian Lee
-
-
-
-
-
Paris, Frankrig
- Rekruttering
- Gustave Roussy
-
Kontakt:
- Ingrid-Judith Garberis, MD PhD
- Telefonnummer: +33 1 42 1 32 58
- E-mail: ingrid-judith.garberis@gustaveroussy.fr
-
Kontakt:
- Prof. Cécile Badoual
- E-mail: Cecile.BADOUAL@gustaveroussy.fr
-
Ledende efterforsker:
- Prof. Fabrice André
-
Underforsker:
- Dr. Alexandra Leary
-
-
-
-
-
Lausanne, Schweiz
- Rekruttering
- Centre Hospitalier Universitaire Vaudois
-
Kontakt:
- Roberto Coletti, Ph.D.
- Telefonnummer: +41 79 556 9271
- E-mail: roberto.colotti@chuv.ch
-
Kontakt:
- Katy Billot
- E-mail: katy.billot@chuv.ch
-
Ledende efterforsker:
- Dr. Raphael Gottardo
-
Underforsker:
- Dr. Krisztian Homicsko
-
-
-
-
-
Berlin, Tyskland
- Rekruttering
- Charité - Universitätsmedizin Berlin
-
Kontakt:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
- Telefonnummer: +49 30 450 564621
- E-mail: ulrich.keilholz@charite.de
-
Kontakt:
- Dr. rer. nat. Jenny Kollek
- E-mail: jenny.kollek@charite.de
-
Ledende efterforsker:
- Prof.Dr. Ulrich Keilholz
-
Erlangen, Tyskland
- Rekruttering
- Universiy Hospital Erlangen & FAU Erlangen-Nürnberg
-
Kontakt:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
- Telefonnummer: +49 9131 85 43584
- E-mail: markus.eckstein@uk-erlangen.de
-
Kontakt:
- PD Dr. med. Ramona Erber
- E-mail: ramona.erber@uk-erlangen.de
-
Ledende efterforsker:
- PD Dr. med. Ramona Erber
-
Ledende efterforsker:
- PD Dr. med. Markus Eckstein
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- At patienten var over 18 år, da prøven blev taget/samtykkede.
- Tilgængelighed af patientinformeret samtykke eller ikke-oppositionsformular til at udføre eksplorativ forskning, der matcher mindst et af MOSAIC-målene (medmindre autorisation er givet af det lokale Institutional Review Board/Independent Ethics Committee (IRB/IEC) til brug af prøver i undersøgelsen i henhold til lokale regler og lovgivning).
- Få en bekræftet diagnose baseret på internationale kriterier for den relevante tumortype.
- Bekræftet formalinfikseret og paraffinindlejret (FFPE) vævstilgængelighed for at generere mindst de 3 kernedatamodaliteter og fortrinsvis alle MOSAIC-datamodaliteter.
- Bekræftet tilgængelighed af tilknyttede kliniske data.
Kvalifikation af paraffinvævsblokken, der opfylder alle følgende:
- At være af den forventede tumortype
- For solide tumorer (alle cancerindikationer undtagen diffust stort B-celle lymfom (DLBCL)): Tumorcelleindhold i området fra 40 % til 80 % på et hæmatoxylin og eosin (H&E) sektion inden for et specificeret område som dikteret af laboratorieprotokollen, der er specifik for anvendt teknik
- For DLBCL, minimum 80 % af højkvalitetskomponent på en H&E-sektion inden for et specificeret område som dikteret af laboratorieprotokollen, der er specifik for den anvendte teknik
- Hvor det er muligt, skal den resterende vævstykkelse være over 125 mikrometer (vejledende område)
- Tumorprøven skal være <10 år gammel
Derudover vil hver underkohorte inden for hver cancerindikation have specifikke inklusionskriterier (f.eks. sygdomsstadium; prøveudtagningssted; behandling modtaget ...).
Ekskluderingskriterier:
1. Prøver uden en bevaret vævsarkitektur, såsom cytologi og cytoblokke.
Derudover kan hver underkohorte inden for hver cancerindikation have specifikke eksklusionskriterier (f. histologisk undertype; historie med immunsuppression; osv...).
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
|---|
|
Patienter diagnosticeret med en af de kvalificerede kræftformer og har mindst én arkiveret FFPE-prøve
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Det primære endepunkt vil være gener eller proteiner, der præsenterer funktioner, der er kompatible med lægemiddelmålretning og/eller nye biomarkører, og som er specifikke for en given patientpopulation inden for en eller flere cancerindikationer.
Tidsramme: Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
Uovervåget dataanalyse og resultatmål vil blive brugt til at opnå dette, såsom prognose under behandling, respons på specifikke terapier. Responsen på terapien vil blive vurderet baseret på data relateret til behandlingen og dens effektivitet indsamlet via en elektronisk Case Report Form. For hver patient ved baseline og i hele MOSAIC-opfølgningsperioden vil følgende data hjælpe med at vurdere dette: alle de forskellige cancerbehandlinger (kirurgi,...) og deres resultater; den samtidige behandling (lægemiddelnavn, …); kræftens tilstand, dvs. fuldstændig eller delvis respons eller progression, målt på forskellige tidspunkter, der er specifikke for hver tumortype. Fordi undersøgelsen vil bruge tumorprøver indsamlet for stort set <10 år siden, er overlevelsesinformation muligvis ikke til stede for alle patienter ved undersøgelsens afslutning, især i langsomt udviklende tumortyper. Af denne grund vil vi bruge tumortypespecifikke prognostiske markører og scores som surrogater af prognose, når det er tilgængeligt og nødvendigt. |
Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Biologiske mekanismer og/eller veje forbundet med patientresultater under behandling, uafhængigt af terapeutisk potentiale
Tidsramme: Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
|
Ny klassificering af patientundergrupper inden for hver cancerindikation, baseret på en eller flere datamodaliteter, der repræsenterer homogen biologi
Tidsramme: Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
|
Nye biomarkører, der kan være: et enkelt gen/protein eller en signatur; et histologisk eller rumligt træk; en kombineret biomarkør, som ideelt set kan overføres til rutinemæssig klinisk brug, og som forudsiger prognose eller anden klinisk handlingsbar information.
Tidsramme: Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
Fra dato for kræftdiagnose til dødsdato, dato for tab af opfølgning, dato for tilbagetrækning af samtykke eller dato for afslutning af undersøgelsen (dec. 2028), alt efter hvad der indtræffer først, vurderet op til 16 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Studiestol: Dr. Vassili Soumelis, OWKIN
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Hanahan D, Coussens LM. Accessories to the crime: functions of cells recruited to the tumor microenvironment. Cancer Cell. 2012 Mar 20;21(3):309-22. doi: 10.1016/j.ccr.2012.02.022.
- Wu Y, Yang S, Ma J, Chen Z, Song G, Rao D, Cheng Y, Huang S, Liu Y, Jiang S, Liu J, Huang X, Wang X, Qiu S, Xu J, Xi R, Bai F, Zhou J, Fan J, Zhang X, Gao Q. Spatiotemporal Immune Landscape of Colorectal Cancer Liver Metastasis at Single-Cell Level. Cancer Discov. 2022 Jan;12(1):134-153. doi: 10.1158/2159-8290.CD-21-0316. Epub 2021 Aug 20.
- Rao A, Barkley D, Franca GS, Yanai I. Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics. Nature. 2021 Aug;596(7871):211-220. doi: 10.1038/s41586-021-03634-9. Epub 2021 Aug 11.
- Meylan M, Petitprez F, Becht E, Bougouin A, Pupier G, Calvez A, Giglioli I, Verkarre V, Lacroix G, Verneau J, Sun CM, Laurent-Puig P, Vano YA, Elaidi R, Mejean A, Sanchez-Salas R, Barret E, Cathelineau X, Oudard S, Reynaud CA, de Reynies A, Sautes-Fridman C, Fridman WH. Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer. Immunity. 2022 Mar 8;55(3):527-541.e5. doi: 10.1016/j.immuni.2022.02.001. Epub 2022 Feb 28.
- Gonzalez H, Hagerling C, Werb Z. Roles of the immune system in cancer: from tumor initiation to metastatic progression. Genes Dev. 2018 Oct 1;32(19-20):1267-1284. doi: 10.1101/gad.314617.118.
- Hegde PS, Chen DS. Top 10 Challenges in Cancer Immunotherapy. Immunity. 2020 Jan 14;52(1):17-35. doi: 10.1016/j.immuni.2019.12.011.
- Cable DM, Murray E, Zou LS, Goeva A, Macosko EZ, Chen F, Irizarry RA. Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics. Nat Biotechnol. 2022 Apr;40(4):517-526. doi: 10.1038/s41587-021-00830-w. Epub 2021 Feb 18.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 23.00242.000244
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Pseudonymiserede, forbehandlede og minimerede data, der tilhører en undergruppe af afdøde patienter, vil blive gjort tilgængelige for forskere på European Genome-Phenome Archive (EGA). Dette projekt kaldes MOSAIC-Window.
Derudover vil de indsamlede og genererede data i MOSAIC efter de ti år af MOSAIC-forskningsstudiet blive anonymiseret i overensstemmelse med gældende love og regler, og en offentlig version af MOSAIC-dataene vil blive frigivet til forskningsformål. Et dedikeret udvalg for undersøgelsen vil tage stilling til betingelserne og modaliteterne for anonymiseringen.
IPD-delingstidsramme
IPD-delingsadgangskriterier
Før du uploader dataene til EGA, sikrer Owkin, at alle personlige data, der er indlejret i datasættene, er pseudonymiseret og krypteret både under transport og i hvile. Owkin er ansvarlig for at indhente og påvise eksistensen af de registreredes informerede samtykke eller ethvert andet passende juridisk grundlag for behandling af personoplysninger, opnå passende etiske eller andre godkendelser til indsamling af dataene og overholde gældende databeskyttelseslove.
Forskere fra institutioner uden for MOSAIC-konsortiet vil kunne bede om adgang til disse data med angivelse af de forskningsspørgsmål, de ønsker at besvare. En Data Access Committee (DAC) vil vurdere forskerens ansøgning og beslutte, om der skal gives adgang til MOSAIC-Window-datasættet eller ej. Hvis ansøgningen bliver godkendt, accepterer forskeren de vilkår og betingelser, der er defineret af DAC (f.eks. kreativ fælles licens, ingen re-identifikation af patienter osv.) og vil derefter kunne downloade dataene til analyse.
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .