Integreret molekylær og klinisk profilering for at optimere resultatforudsigelse i miltmarginal zone lymfom

Undersøgelsen har til formål at udvikle og validere en integreret klinisk-molekylær model til en nøjagtig overlevelsesprognose i nydiagnosticeret SMZL.

Allerede eksisterende og kodet tumorbiologisk materiale og sundhedsrelaterede personoplysninger vil blive indsamlet med tilbagevirkende kraft. Mutationsanalyse vil blive udført ved målrettet dyb næste generations sekventering af tumorgenomisk DNA. Deletion af 7q vil blive vurderet af FISH på kerner isoleret fra tumorvæv. Immunoglobulingen-omlejring og mutationsstatus vil blive analyseret på tumorgenomisk DNA ved PCR og Sanger-sekventering. Methyleringsstatus for målgener vil blive vurderet ved methyleringsspecifik PCR på tumorgenomisk DNA.

Den justerede sammenhæng mellem eksponeringsvariabler og OS vil blive estimeret ved Cox-regression. Denne tilgang vil give de kovariater, der er uafhængigt forbundet med OS, som vil blive brugt i udviklingen af ​​en hierarkisk molekylær model til at forudsige OS. Den hierarkiske rækkefølge af relevans ved forudsigelse af OS blandt kovariater vil blive etableret ved rekursiv partitioneringsanalyse. En sammenlægningsalgoritme vil blive brugt til at flette terminalknuder, der viser homogent OS. Modellens diskriminationsevne vil blive vurderet ved at beregne c-indekset. Relativ overlevelsesanalyse vil blive brugt til at give et mål for den overdødelighed, som patientens undergrupper oplever, stratificeret i henhold til de udviklede hierarkiske molekylære modeller, uanset om overdødeligheden direkte eller indirekte kan henføres til sygdommen. Modellen udviklet i træningssættet vil blive testet i valideringssættene, og modelpræstationen (c-indeks) i valideringssættet vil blive sammenlignet med den i træningssættet.