Profiling molecolare e clinico integrato per ottimizzare la previsione degli esiti nel linfoma splenico della zona marginale

Lo studio mira a sviluppare e validare un modello clinico-molecolare integrato per un'accurata prognosi di sopravvivenza in SMZL di nuova diagnosi.

Il materiale biologico tumorale già esistente e codificato ei dati personali relativi alla salute saranno raccolti retrospettivamente. L'analisi delle mutazioni sarà eseguita mediante sequenziamento mirato di prossima generazione del DNA genomico tumorale. La delezione di 7q sarà valutata mediante FISH su nuclei isolati da tessuti tumorali. Il riarrangiamento genico delle immunoglobuline e lo stato mutazionale saranno analizzati sul DNA genomico tumorale mediante PCR e sequenziamento di Sanger. Lo stato di metilazione dei geni bersaglio sarà valutato mediante PCR metilazione specifica su DNA genomico tumorale.

L'associazione aggiustata tra variabili di esposizione e OS sarà stimata mediante regressione di Cox. Questo approccio fornirà le covariate associate indipendentemente all'OS che saranno utilizzate nello sviluppo di un modello molecolare gerarchico per predire l'OS. L'ordine gerarchico di rilevanza nella predizione dell'OS tra le covariate sarà stabilito dall'analisi ricorsiva del partizionamento. Verrà utilizzato un algoritmo di fusione per unire i nodi terminali che mostrano un sistema operativo omogeneo. La capacità di discriminazione del modello sarà valutata calcolando il c-index. L'analisi della sopravvivenza relativa sarà utilizzata per fornire una misura dell'eccesso di mortalità sperimentata dai sottogruppi di pazienti stratificati secondo i modelli molecolari gerarchici sviluppati, indipendentemente dal fatto che l'eccesso di mortalità sia direttamente o indirettamente attribuibile alla malattia. Il modello sviluppato nel set di addestramento sarà testato nei set di validazione e le prestazioni del modello (c-index) nel set di validazione saranno confrontate con quelle nel set di addestramento.