Diagnose af RSTS: Identifikation af acetyleringsprofilerne som epigenetiske markører til vurdering af kausalitet af CREBBP- og EP300-varianter. (GENEPI)

CREBBP og EP300 er de to paraloggener forbundet med RSTS-determinisme og koder for henholdsvis CBP og p300. Disse proteiner er transkriptionelle coaktivatorer, der besidder et katalytisk lysinacetyltransferase (KAT) domæne involveret i acetyleringen af ​​lysinrester af histoner, men også andre proteiner. CBP og p300 fremmer transkription ved at skabe et kromatinmiljø, der er gunstigt for genekspression og ved at forbinde forskellige transkriptionsfaktorer til hinanden. De orkestrerer således reguleringen af ​​transkriptionsmaskineriet, fra den basale promotor til forstærkerne af målgenerne.

RSTS betragtes som en genetisk model af neuroudviklingsmæssig anomali med en epigenetisk komponent.

Histonacetylering er en af ​​de største post-translationelle modifikationer (PTM'er) af disse proteiner, der sørger for dannelse og kontrol af kromatinstruktur. Når man differentierer embryonale celler, spiller denne modifikation en nøglerolle i transkriptionel aktivering.

Musemodellerne af RSTS har skabt forbindelsen mellem moduleringen af ​​histonacetylering og dannelsen af ​​hukommelse ved at vise deres nøglerolle i neuronal plasticitet. Der eksisterer imidlertid ingen data om acetylering af histoner i neuronerne hos RSTS-patienter. Desuden er de molekylære veje, der påvirkes af disse ændringer under neuroudvikling, hos mennesker ikke specificeret, især i de pyramidale neuroner, som er forløbere for hippocampale neuroner, der er involveret i kodning og lagring af hukommelse.

I RSTS resulterer et tab af CBP-funktion i et underskud i KAT-aktivitet, som er ansvarlig for at ændre histonacetylering, hvilket fører til uhensigtsmæssige ændringer i kromatinstrukturen. Konsekvensen af ​​en mutation er et resultat af en deregulering af aktiviteten af ​​gener involveret i udviklingen. Ingen neuronalt niveau undersøgelser er i øjeblikket tilgængelige på den funktionelle sammenhæng mellem histonacetylering og deregulerede gener i RSTS.

I dette projekt vil efterforskere identificere målgener, hvis epigenetiske regulering er medieret af histonacetylering. Mere specifikt vil undersøgelsen fokusere på kromatin-dynamik under normal og patologisk neuronal differentiering af kortikale og pyramidale neuroner. Efterforskere vil blandt de CBP-afhængige histonmarkører bestemme dem, der er modificeret i RSTS-patientceller, og de loci, de kontrollerer. Parallelt hermed vil efterforskere definere gener, hvis neuronale udtryk er ændret i RSTS-patienter.

Integrationen af ​​alle disse data vil give os mulighed for at specificere, hvilke gener der dereguleres under neuronal differentiering som en konsekvens af CBP lysin acetyltransferase funktionstab.