- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT04122742
Diagnosi di RSTS: identificazione dei profili di acetilazione come marcatori epigenetici per la valutazione della causalità delle varianti CREBBP e EP300. (GENEPI)
La sindrome di Rubinstein-Taybi (RSTS) è una rara e grave malattia congenita dello sviluppo caratterizzata da anomalie congenite e disabilità intellettiva con un deficit di memoria a lungo termine. La sfida principale è migliorare l'efficienza intellettuale e della memoria di questi pazienti. CREBBP e EP300 sono i due geni noti per causare RSTS. Entrambi i paraloghi svolgono un ruolo importante nel rimodellamento della cromatina e codificano per coattivatori trascrizionali che interagiscono con molte proteine.
Lo scopo di questo studio pilota è quello di caratterizzare i profili di acetilazione dell'istone al fine di identificare specifici marcatori di acetilazione durante la differenziazione neuronale normale e patologica dei neuroni corticali e piramidali in RSTS.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
- Procedura: biopsia cutanea per la coltura primaria di fibroblasti e un campione di sangue da 15 ml (3 campioni senza nome da 5 ml) in ciascuno dei 4 pazienti SRT inclusi.
- Altro: Generazione di cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) da fibroblasti ottenuti mediante biopsia cutanea
- Altro: Profili di acetilazione dell'istone di cellule di pazienti SRT con mutazioni CREBBP
- Altro: Coinvolgimento funzionale delle alterazioni epigenetiche identificate
- Biologico: Coltura della linea linfoblastoide dal campione di sangue
Descrizione dettagliata
CREBBP e EP300 sono i due geni paralog associati al determinismo RSTS e codificano rispettivamente per CBP e p300. Queste proteine sono coattivatori trascrizionali che possiedono un dominio catalitico della lisina acetil transferasi (KAT) coinvolto nell'acetilazione dei residui di lisina degli istoni ma anche di altre proteine. CBP e p300 promuovono la trascrizione creando un ambiente cromatinico favorevole all'espressione genica e collegando tra loro diversi fattori di trascrizione. Orchestrano così la regolazione del meccanismo di trascrizione, dal promotore basale agli esaltatori dei geni bersaglio.
RSTS è considerato un modello genetico di anomalia dello sviluppo neurologico con una componente epigenetica.
L'acetilazione dell'istone è una delle principali modificazioni post-traduzionali (PTM) di queste proteine che forniscono la formazione e il controllo della struttura della cromatina. Quando si differenziano le cellule embrionali, questa modifica gioca un ruolo chiave nell'attivazione trascrizionale.
I modelli murini di RSTS hanno stabilito il collegamento tra la modulazione dell'acetilazione dell'istone e la formazione della memoria mostrando il loro ruolo chiave nella plasticità neuronale. Tuttavia non esistono dati sull'acetilazione degli istoni nei neuroni dei pazienti affetti da RSTS. Inoltre, nell'uomo, le vie molecolari interessate da queste alterazioni durante il neurosviluppo non sono specificate, specialmente nei neuroni piramidali che sono i precursori dei neuroni ippocampali coinvolti nella codifica e nell'immagazzinamento della memoria.
In RSTS una perdita della funzione CBP si traduce in un deficit nell'attività KAT, che è responsabile dell'alterazione dell'acetilazione dell'istone, portando a cambiamenti inappropriati nella struttura della cromatina. La conseguenza di una mutazione è il risultato di una deregolazione dell'attività dei geni coinvolti nello sviluppo. Non sono attualmente disponibili studi a livello neuronale sul legame funzionale tra acetilazione dell'istone e geni deregolati nell'RSTS.
In questo progetto, i ricercatori identificheranno i geni bersaglio la cui regolazione epigenetica è mediata dall'acetilazione dell'istone. In particolare, lo studio si concentrerà sulla dinamica della cromatina durante il differenziamento neuronale normale e patologico dei neuroni corticali e piramidali. Gli investigatori determineranno tra i marcatori istonici CBP-dipendenti, quelli che sono modificati nelle cellule dei pazienti con RSTS e i loci che controllano. Parallelamente, i ricercatori definiranno i geni la cui espressione neuronale è alterata nei pazienti con RSTS.
L'integrazione di tutti questi dati ci permetterà di specificare quali geni sono deregolati durante il differenziamento neuronale come conseguenza della perdita della funzione della lisina acetiltransferasi CBP.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Julien VAN-GILS
- Numero di telefono: +33 5 57 82 03 53
- Email: julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
Luoghi di studio
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Talence, Francia, 33400
- Reclutamento
- Centre hospitalier universitaire de Bordeaux
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Contatto:
- Julien VAN-GILS
- Numero di telefono: +33 5 57 82 03 53
- Email: julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Paziente con diagnosi clinica e molecolare di RSTS
- Pazienti portatori delle varianti CREBBP o EP300
- Pazienti di età superiore a 2 anni
- Pazienti affiliati o beneficiari di un regime di previdenza sociale.
- Consenso libero, informato e firmato dai genitori o titolare della patria potestà per i pazienti minorenni
- Consenso libero, informato e firmato dal rappresentante dei pazienti per i principali pazienti sotto tutela
- Consenso libero, informato e firmato dal paziente per i pazienti maggiori
Criteri di esclusione:
Pazienti che hanno:
- una storia di allergia a qualsiasi prodotto o dispositivo che possa essere utilizzato prima, durante e dopo la biopsia;
- malattia cutanea delle aree in cui deve essere eseguita la biopsia
- ha subito un trattamento fisico (radioterapia, ...) sull'area da sottoporre a biopsia, negli ultimi 6 mesi
- disturbi ereditari o acquisiti dell'emostasi
Pazienti in trattamento:
- suscettibili di agire sull'emostasi (anticoagulanti, antiaggreganti piastrinici, ...) nel mese precedente l'inclusione e durante lo studio
- dall'inibitore dell'istone deacetilasi (sodio valproato) che potrebbe interferire con l'interpretazione dei risultati.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Solo caso
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Pazienti con RSTS
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Eseguito con punch di 3 mm di diametro in anestesia locale.
La procedura può essere eseguita in uno studio di consultazione rispettando una rigorosa asepsi.
produzione indotta di cellule staminali pluripotenti (iPSC) di pazienti con mutazione CREBBP e differenziazione in neuroni corticali e neuroni piramidali
Studio dell'acetiloma mediante cromatografia liquida accoppiata con spettrometria di massa tandem (LC-MS/MS) Validazione di target di acetilazione specifici mediante ChIP-Sequencing
Analisi del trascrittoma con RNA-Seq Generazione di cloni iPSC isogenici mediante correzione delle mutazioni CREBBP in pazienti SRT mediante CrispR-Cas9.
Realizzazione di un ficoll Coltura di linfoblasti e conservazione Istituzione della linea linfoblastoide e conservazione
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificazione di uno specifico profilo di acetilazione di RSTS
Lasso di tempo: Visita di inclusione
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Dal campione di biopsia cutanea raccolto alla visita di inclusione:
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Visita di inclusione
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificazione di diversi geni bersaglio tra pazienti SRT e controlli
Lasso di tempo: Visita di inclusione
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I pazienti SRT saranno confrontati con 4 colture cellulari di controllo di volontari sani appaiati per età e sesso già disponibili
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Visita di inclusione
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Evidenza di un livello di espressione significativamente diverso per geni target comuni per pazienti e controlli con RSTS
Lasso di tempo: Visita di inclusione
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Visita di inclusione
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Stimato)
Completamento dello studio (Stimato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Malattie del sistema nervoso
- Manifestazioni neurologiche
- Manifestazioni neurocomportamentali
- Anomalie congenite
- Malattie genetiche, congenite
- Malattie muscoloscheletriche
- Malattie ossee
- Disabilità intellettuale
- Anomalie craniofacciali
- Anomalie muscoloscheletriche
- Anomalie multiple
- Disturbi cromosomici
- Malattie ossee, dello sviluppo
- Disostosi
- Sindrome di Rubinstein-Taybi
Altri numeri di identificazione dello studio
- CHUBX 2019/19
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