- ICH GCP
- Registro de ensaios clínicos dos EUA
- Ensaio Clínico NCT04122742
Diagnóstico de RSTS: Identificação dos perfis de acetilação como marcadores epigenéticos para avaliar a causalidade de variantes de CREBBP e EP300. (GENEPI)
A síndrome de Rubinstein-Taybi (RSTS) é um distúrbio congênito raro e grave do desenvolvimento, caracterizado por anomalias congênitas e deficiência intelectual com déficit de memória de longo prazo. O principal desafio é melhorar a eficiência intelectual e de memória desses pacientes. CREBBP e EP300 são os dois genes conhecidos por causar RSTS. Ambos os parálogos desempenham um papel importante na remodelação da cromatina e codificam para coativadores transcricionais que interagem com muitas proteínas.
O objetivo deste estudo piloto é caracterizar os perfis de acetilação de histonas para identificar marcadores de acetilação específicos durante a diferenciação neuronal normal e patológica de neurônios corticais e piramidais em RSTS.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
- Procedimento: biópsia de pele para a cultura primária de fibroblastos e uma amostra de sangue de 15 ml (3 amostras não identificadas de 5 ml) em cada um dos 4 pacientes SRT incluídos.
- Outro: Geração de Células-Tronco Pluripotentes Induzidas (iPSC) a partir de fibroblastos obtidos por biópsia de pele
- Outro: Perfis de acetilação de histonas de células de pacientes SRT com mutações CREBBP
- Outro: Envolvimento funcional de alterações epigenéticas identificadas
- Biológico: Cultura de linha linfoblastóide de amostra de sangue
Descrição detalhada
CREBBP e EP300 são os dois genes parálogos associados ao determinismo RSTS e codificam para CBP e p300, respectivamente. Estas proteínas são coativadores transcricionais que possuem um domínio catalítico de lisina acetil transferase (KAT) envolvido na acetilação de resíduos de lisina de histonas, mas também de outras proteínas. CBP e p300 promovem a transcrição criando um ambiente de cromatina que é favorável para a expressão gênica e ligando diferentes fatores de transcrição entre si. Eles, portanto, orquestram a regulação da maquinaria de transcrição, desde o promotor basal até os intensificadores dos genes-alvo.
RSTS é considerado um modelo genético de anomalia do neurodesenvolvimento com um componente epigenético.
A acetilação de histonas é uma das principais modificações pós-traducionais (PTMs) dessas proteínas que fornecem a formação e o controle da estrutura da cromatina. Ao diferenciar as células embrionárias, esta modificação desempenha um papel fundamental na ativação da transcrição.
Os modelos de RSTS em camundongos estabeleceram a ligação entre a modulação da acetilação de histonas e a formação de memória, mostrando seu papel fundamental na plasticidade neuronal. No entanto, não existem dados sobre a acetilação de histonas nos neurônios de pacientes RSTS. Além disso, em humanos, as vias moleculares impactadas por essas alterações durante o neurodesenvolvimento não são especificadas, especialmente nos neurônios piramidais que são os precursores dos neurônios do hipocampo envolvidos na codificação e armazenamento da memória.
Na RSTS, a perda da função CBP resulta em déficit na atividade KAT, que é responsável por alterar a acetilação das histonas, levando a alterações inapropriadas na estrutura da cromatina. A consequência de uma mutação é resultado de uma desregulação da atividade de genes envolvidos no desenvolvimento. Nenhum estudo de nível neuronal está disponível atualmente sobre a ligação funcional entre acetilação de histonas e genes desregulados no RSTS.
Neste projeto, os pesquisadores identificarão genes-alvo cuja regulação epigenética é mediada pela acetilação de histonas. Mais especificamente, o estudo incidirá sobre a dinâmica da cromatina durante a diferenciação neuronal normal e patológica dos neurónios corticais e piramidais. Os investigadores determinarão entre os marcadores de histonas dependentes de CBP, aqueles que são modificados nas células dos pacientes RSTS e os loci que eles controlam. Paralelamente, os investigadores irão definir genes cuja expressão neuronal está alterada em doentes com RSTS.
A integração de todos esses dados nos permitirá especificar quais genes estão desregulados durante a diferenciação neuronal como consequência da perda da função da lisina acetiltransferase do CBP.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Julien VAN-GILS
- Número de telefone: +33 5 57 82 03 53
- E-mail: julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
Locais de estudo
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-
Talence, França, 33400
- Recrutamento
- Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
-
Contato:
- Julien VAN-GILS
- Número de telefone: +33 5 57 82 03 53
- E-mail: julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Paciente com diagnóstico clínico e molecular de RSTS
- Pacientes portadores das variantes CREBBP ou EP300
- Pacientes com mais de 2 anos
- Pacientes filiados ou beneficiários de um regime de segurança social.
- Consentimento livre, informado e assinado pelos pais ou titular da autoridade parental para pacientes menores
- Consentimento livre, informado e assinado pelo representante do paciente dos pacientes maiores sob tutela
- Consentimento livre, informado e assinado pelo paciente para pacientes graves
Critério de exclusão:
Pacientes com:
- histórico de alergia a qualquer produto ou dispositivo que possa ser usado antes, durante e após a biópsia;
- doença cutânea das áreas onde a biópsia será realizada
- realizou tratamento físico (radioterapia, ...) na área a ser biopsiada, nos últimos 6 meses
- distúrbios hereditários ou adquiridos da hemostasia
Pacientes em tratamento:
- susceptíveis de actuar na hemostase (anticoagulantes, antiagregantes plaquetários, ...) no mês anterior à inclusão e durante o estudo
- por inibidor de histona desacetilase (valproato de sódio) susceptível de interferir com a interpretação dos resultados.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Caso-somente
- Perspectivas de Tempo: Prospectivo
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
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Pacientes com RSTS
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Realizada com punch de 3 mm de diâmetro sob anestesia local.
O procedimento pode ser feito em consultório respeitando estrita assepsia.
induziu a produção de células-tronco pluripotentes (iPSC) de pacientes com mutação CREBBP e diferenciação em neurônios corticais e neurônios piramidais
Estudo de acetiloma por cromatografia líquida acoplada com espectrometria de massa tandem (LC-MS/MS) Validação de alvos específicos de acetilação por ChIP-Sequencing
Análise transcriptômica com RNA-Seq Geração de clones iPSC isogênicos por correção de mutações CREBBP em pacientes SRT por CrispR-Cas9.
Obtenção de um ficoll Cultura de linfoblastos e conservação Estabelecimento de linhagem de linfoblastóides e conservação
|
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Identificação de um perfil de acetilação específico de RSTS
Prazo: Visita de inclusão
|
Da amostra de biópsia de pele coletada na visita de inclusão:
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Visita de inclusão
|
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Identificação de diferentes genes-alvo entre pacientes SRT e controles
Prazo: Visita de inclusão
|
Pacientes SRT serão comparados a 4 culturas de células de controle de voluntários saudáveis pareados por idade e sexo já disponíveis
|
Visita de inclusão
|
Evidência de um nível significativamente diferente de expressão para genes-alvo comuns para pacientes com RSTS e controles
Prazo: Visita de inclusão
|
Visita de inclusão
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
- Doenças do Sistema Nervoso
- Manifestações Neurológicas
- Manifestações Neurocomportamentais
- Anomalias congénitas
- Doenças Genéticas, Congênitas
- Doenças musculoesqueléticas
- Doenças ósseas
- Deficiência Intelectual
- Anormalidades Craniofaciais
- Anormalidades musculoesqueléticas
- Anormalidades, Múltiplas
- Distúrbios cromossômicos
- Doenças Ósseas do Desenvolvimento
- Disostoses
- Síndrome de Rubinstein-Taybi
Outros números de identificação do estudo
- CHUBX 2019/19
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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