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Diagnóstico de RSTS: Identificação dos perfis de acetilação como marcadores epigenéticos para avaliar a causalidade de variantes de CREBBP e EP300. (GENEPI)

16 de janeiro de 2024 atualizado por: University Hospital, Bordeaux

A síndrome de Rubinstein-Taybi (RSTS) é um distúrbio congênito raro e grave do desenvolvimento, caracterizado por anomalias congênitas e deficiência intelectual com déficit de memória de longo prazo. O principal desafio é melhorar a eficiência intelectual e de memória desses pacientes. CREBBP e EP300 são os dois genes conhecidos por causar RSTS. Ambos os parálogos desempenham um papel importante na remodelação da cromatina e codificam para coativadores transcricionais que interagem com muitas proteínas.

O objetivo deste estudo piloto é caracterizar os perfis de acetilação de histonas para identificar marcadores de acetilação específicos durante a diferenciação neuronal normal e patológica de neurônios corticais e piramidais em RSTS.

Visão geral do estudo

Descrição detalhada

CREBBP e EP300 são os dois genes parálogos associados ao determinismo RSTS e codificam para CBP e p300, respectivamente. Estas proteínas são coativadores transcricionais que possuem um domínio catalítico de lisina acetil transferase (KAT) envolvido na acetilação de resíduos de lisina de histonas, mas também de outras proteínas. CBP e p300 promovem a transcrição criando um ambiente de cromatina que é favorável para a expressão gênica e ligando diferentes fatores de transcrição entre si. Eles, portanto, orquestram a regulação da maquinaria de transcrição, desde o promotor basal até os intensificadores dos genes-alvo.

RSTS é considerado um modelo genético de anomalia do neurodesenvolvimento com um componente epigenético.

A acetilação de histonas é uma das principais modificações pós-traducionais (PTMs) dessas proteínas que fornecem a formação e o controle da estrutura da cromatina. Ao diferenciar as células embrionárias, esta modificação desempenha um papel fundamental na ativação da transcrição.

Os modelos de RSTS em camundongos estabeleceram a ligação entre a modulação da acetilação de histonas e a formação de memória, mostrando seu papel fundamental na plasticidade neuronal. No entanto, não existem dados sobre a acetilação de histonas nos neurônios de pacientes RSTS. Além disso, em humanos, as vias moleculares impactadas por essas alterações durante o neurodesenvolvimento não são especificadas, especialmente nos neurônios piramidais que são os precursores dos neurônios do hipocampo envolvidos na codificação e armazenamento da memória.

Na RSTS, a perda da função CBP resulta em déficit na atividade KAT, que é responsável por alterar a acetilação das histonas, levando a alterações inapropriadas na estrutura da cromatina. A consequência de uma mutação é resultado de uma desregulação da atividade de genes envolvidos no desenvolvimento. Nenhum estudo de nível neuronal está disponível atualmente sobre a ligação funcional entre acetilação de histonas e genes desregulados no RSTS.

Neste projeto, os pesquisadores identificarão genes-alvo cuja regulação epigenética é mediada pela acetilação de histonas. Mais especificamente, o estudo incidirá sobre a dinâmica da cromatina durante a diferenciação neuronal normal e patológica dos neurónios corticais e piramidais. Os investigadores determinarão entre os marcadores de histonas dependentes de CBP, aqueles que são modificados nas células dos pacientes RSTS e os loci que eles controlam. Paralelamente, os investigadores irão definir genes cuja expressão neuronal está alterada em doentes com RSTS.

A integração de todos esses dados nos permitirá especificar quais genes estão desregulados durante a diferenciação neuronal como consequência da perda da função da lisina acetiltransferase do CBP.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Estimado)

154

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

Locais de estudo

      • Talence, França, 33400
        • Recrutamento
        • Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
        • Contato:

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

2 anos e mais velhos (Filho, Adulto, Adulto mais velho)

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

Paciente com diagnóstico clínico e molecular de RSTS em consulta especializada no CHU de Bordeaux

Descrição

Critério de inclusão:

  • Paciente com diagnóstico clínico e molecular de RSTS
  • Pacientes portadores das variantes CREBBP ou EP300
  • Pacientes com mais de 2 anos
  • Pacientes filiados ou beneficiários de um regime de segurança social.
  • Consentimento livre, informado e assinado pelos pais ou titular da autoridade parental para pacientes menores
  • Consentimento livre, informado e assinado pelo representante do paciente dos pacientes maiores sob tutela
  • Consentimento livre, informado e assinado pelo paciente para pacientes graves

Critério de exclusão:

Pacientes com:

  • histórico de alergia a qualquer produto ou dispositivo que possa ser usado antes, durante e após a biópsia;
  • doença cutânea das áreas onde a biópsia será realizada
  • realizou tratamento físico (radioterapia, ...) na área a ser biopsiada, nos últimos 6 meses
  • distúrbios hereditários ou adquiridos da hemostasia

Pacientes em tratamento:

  • susceptíveis de actuar na hemostase (anticoagulantes, antiagregantes plaquetários, ...) no mês anterior à inclusão e durante o estudo
  • por inibidor de histona desacetilase (valproato de sódio) susceptível de interferir com a interpretação dos resultados.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Modelos de observação: Caso-somente
  • Perspectivas de Tempo: Prospectivo

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Pacientes com RSTS
Realizada com punch de 3 mm de diâmetro sob anestesia local. O procedimento pode ser feito em consultório respeitando estrita assepsia.
induziu a produção de células-tronco pluripotentes (iPSC) de pacientes com mutação CREBBP e diferenciação em neurônios corticais e neurônios piramidais
Estudo de acetiloma por cromatografia líquida acoplada com espectrometria de massa tandem (LC-MS/MS) Validação de alvos específicos de acetilação por ChIP-Sequencing
Análise transcriptômica com RNA-Seq Geração de clones iPSC isogênicos por correção de mutações CREBBP em pacientes SRT por CrispR-Cas9.
Obtenção de um ficoll Cultura de linfoblastos e conservação Estabelecimento de linhagem de linfoblastóides e conservação

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Identificação de um perfil de acetilação específico de RSTS
Prazo: Visita de inclusão

Da amostra de biópsia de pele coletada na visita de inclusão:

  • Sem suposições sobre o número de marcas de histonas necessárias para definir o perfil
  • Será retido como marca específica da doença se estiver 100% presente nos casos e 100% ausente nos controles
  • O perfil específico pode ser definido em um ou mais estágios de diferenciação celular: iPSC - progenitor neuronal - neurônios corticais e piramidais
Visita de inclusão

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Identificação de diferentes genes-alvo entre pacientes SRT e controles
Prazo: Visita de inclusão
Pacientes SRT serão comparados a 4 culturas de células de controle de voluntários saudáveis ​​pareados por idade e sexo já disponíveis
Visita de inclusão
Evidência de um nível significativamente diferente de expressão para genes-alvo comuns para pacientes com RSTS e controles
Prazo: Visita de inclusão
Visita de inclusão

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

8 de outubro de 2019

Conclusão Primária (Estimado)

1 de outubro de 2025

Conclusão do estudo (Estimado)

1 de outubro de 2025

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

9 de outubro de 2019

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

9 de outubro de 2019

Primeira postagem (Real)

10 de outubro de 2019

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

17 de janeiro de 2024

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

16 de janeiro de 2024

Última verificação

1 de janeiro de 2024

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

Ensaios clínicos em Síndrome de Rubinstein-Taybi

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