RSTS の診断: CREBBP および EP300 バリアントの因果関係を評価するためのエピジェネティック マーカーとしてのアセチル化プロファイルの同定。 (GENEPI)
Rubinstein-Taybi 症候群 (RSTS) は、先天異常と長期記憶障害を伴う知的障害を特徴とする、まれで重度の先天性発達障害です。 主な課題は、これらの患者の知的および記憶効率を改善することです。 CREBBP と EP300 は、RSTS を引き起こすことが知られている 2 つの遺伝子です。 両方のパラログは、クロマチンのリモデリングで主要な役割を果たし、多くのタンパク質と相互作用する転写コアクチベーターをエンコードします。
このパイロット研究の目的は、RSTS における皮質ニューロンと錐体ニューロンの正常および病理学的ニューロン分化中の特定のアセチル化マーカーを特定するために、ヒストンのアセチル化プロファイルを特徴付けることです。
調査の概要
状態
詳細な説明
CREBBP と EP300 は、RSTS 決定論に関連する 2 つのパラログ遺伝子であり、それぞれ CBP と p300 をコードします。 これらのタンパク質は、ヒストンだけでなく他のタンパク質のリジン残基のアセチル化にも関与する触媒リジンアセチルトランスフェラーゼ (KAT) ドメインを有する転写コアクチベーターです。 CBP と p300 は、遺伝子発現に有利なクロマチン環境を作成し、異なる転写因子を相互にリンクすることにより、転写を促進します。 したがって、それらは、基本プロモーターから標的遺伝子のエンハンサーまで、転写機構の調節を調整します。
RSTS は、エピジェネティックな要素を持つ神経発達異常の遺伝モデルと考えられています。
ヒストンのアセチル化は、クロマチン構造の形成と制御を提供するこれらのタンパク質の主要な翻訳後修飾 (PTM) の 1 つです。 胚細胞を分化させる場合、この修飾は転写活性化において重要な役割を果たします。
RSTS のマウスモデルは、ニューロンの可塑性における重要な役割を示すことにより、ヒストンのアセチル化の調節と記憶の形成との間の関連性を確立しました。 しかし、RSTS 患者のニューロンにおけるヒストンのアセチル化に関するデータはありません。 さらに、ヒトでは、特に記憶の暗号化と保存に関与する海馬ニューロンの前駆体である錐体ニューロンにおいて、神経発達中のこれらの変化によって影響を受ける分子経路が特定されていません。
RSTS では、CBP 機能が失われると、ヒストンのアセチル化の変化に関与する KAT 活性が低下し、クロマチン構造に不適切な変化が生じます。 突然変異の結果は、発生に関与する遺伝子の活動の規制緩和の結果です。 ヒストンのアセチル化と RSTS の調節解除された遺伝子との間の機能的リンクに関するニューロンレベルの研究は現在利用できません。
このプロジェクトでは、研究者は、エピジェネティックな調節がヒストンのアセチル化によって媒介される標的遺伝子を特定します。 より具体的には、この研究は、皮質および錐体ニューロンの正常および病理学的ニューロン分化中のクロマチンダイナミクスに焦点を当てます。 研究者は、CBP 依存性ヒストン マーカー、RSTS 患者細胞で変更されたもの、およびそれらが制御する遺伝子座を決定します。 並行して、研究者は、RSTS 患者で神経細胞の発現が変化する遺伝子を定義します。
これらすべてのデータを統合することで、CBPリジンアセチルトランスフェラーゼ機能喪失の結果として、神経分化中にどの遺伝子が調節解除されるかを特定することができます。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Julien VAN-GILS
- 電話番号:+33 5 57 82 03 53
- メール:julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
研究場所
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-
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Talence、フランス、33400
- 募集
- Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
-
コンタクト:
- Julien VAN-GILS
- 電話番号:+33 5 57 82 03 53
- メール:julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
-
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- -RSTSの臨床的および分子的診断を受けた患者
- CREBBPまたはEP300バリアントを保有する患者
- 2歳以上の患者
- 社会保障制度の加入患者または受益者。
- 未成年の患者については、両親または親権者による無料の情報に基づく署名付きの同意
- 後見下にある主な患者については、患者代表者による自由な説明と署名付きの同意
- 主要な患者の場合、患者による無料の、インフォームドおよび署名付きの同意
除外基準:
以下の患者:
- 生検の前、最中、後に使用される可能性のある製品またはデバイスに対するアレルギーの病歴;
- 生検が行われる領域の皮膚疾患
- 過去 6 か月間に、生検する領域で理学療法(放射線療法など)を受けた
- 遺伝性または後天性の止血障害
治療中の患者:
- 含める前の月と研究中に止血(抗凝固剤、血小板抗凝集剤など)に作用する可能性が高い
- ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤 (バルプロ酸ナトリウム) による結果の解釈を妨げる可能性があります。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースのみ
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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RSTS患者
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局所麻酔下で直径 3 mm のパンチで実行されます。
手順は、厳格な無菌を尊重する相談所で行うことができます。
CREBBP 変異を有する患者の誘導多能性幹細胞 (iPSC) 産生および皮質ニューロンおよび錐体ニューロンへの分化
液体クロマトグラフィーとタンデム質量分析 (LC-MS / MS) を組み合わせたアセチロームの研究 ChIP-Sequencing による特定のアセチル化ターゲットの検証
RNA-Seq によるトランスクリプトーム解析 CrispR-Cas9 による SRT 患者の CREBBP 変異の修正による同質遺伝子型 iPSC クローンの生成。
フィコールの達成 リンパ芽球の培養と保存 リンパ芽球系の樹立と保存
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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RSTS の特定のアセチル化プロファイルの同定
時間枠:インクルージョン訪問
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インクルージョン訪問時に収集された皮膚生検サンプルから:
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インクルージョン訪問
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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SRT患者と対照の間の異なる標的遺伝子の同定
時間枠:インクルージョン訪問
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SRT患者は、すでに利用可能な年齢と性別が一致した健康なボランティアからの4つの対照細胞培養と比較されます
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インクルージョン訪問
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RSTS 患者とコントロールの共通の標的遺伝子の発現レベルが著しく異なることの証拠
時間枠:インクルージョン訪問
|
インクルージョン訪問
|
協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- CHUBX 2019/19
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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