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RSTS の診断: CREBBP および EP300 バリアントの因果関係を評価するためのエピジェネティック マーカーとしてのアセチル化プロファイルの同定。 (GENEPI)

2024年1月16日 更新者:University Hospital, Bordeaux

Rubinstein-Taybi 症候群 (RSTS) は、先天異常と長期記憶障害を伴う知的障害を特徴とする、まれで重度の先天性発達障害です。 主な課題は、これらの患者の知的および記憶効率を改善することです。 CREBBP と EP300 は、RSTS を引き起こすことが知られている 2 つの遺伝子です。 両方のパラログは、クロマチンのリモデリングで主要な役割を果たし、多くのタンパク質と相互作用する転写コアクチベーターをエンコードします。

このパイロット研究の目的は、RSTS における皮質ニューロンと錐体ニューロンの正常および病理学的ニューロン分化中の特定のアセチル化マーカーを特定するために、ヒストンのアセチル化プロファイルを特徴付けることです。

調査の概要

詳細な説明

CREBBP と EP300 は、RSTS 決定論に関連する 2 つのパラログ遺伝子であり、それぞれ CBP と p300 をコードします。 これらのタンパク質は、ヒストンだけでなく他のタンパク質のリジン残基のアセチル化にも関与する触媒リジンアセチルトランスフェラーゼ (KAT) ドメインを有する転写コアクチベーターです。 CBP と p300 は、遺伝子発現に有利なクロマチン環境を作成し、異なる転写因子を相互にリンクすることにより、転写を促進します。 したがって、それらは、基本プロモーターから標的遺伝子のエンハンサーまで、転写機構の調節を調整します。

RSTS は、エピジェネティックな要素を持つ神経発達異常の遺伝モデルと考えられています。

ヒストンのアセチル化は、クロマチン構造の形成と制御を提供するこれらのタンパク質の主要な翻訳後修飾 (PTM) の 1 つです。 胚細胞を分化させる場合、この修飾は転写活性化において重要な役割を果たします。

RSTS のマウスモデルは、ニューロンの可塑性における重要な役割を示すことにより、ヒストンのアセチル化の調節と記憶の形成との間の関連性を確立しました。 しかし、RSTS 患者のニューロンにおけるヒストンのアセチル化に関するデータはありません。 さらに、ヒトでは、特に記憶の暗号化と保存に関与する海馬ニューロンの前駆体である錐体ニューロンにおいて、神経発達中のこれらの変化によって影響を受ける分子経路が特定されていません。

RSTS では、CBP 機能が失われると、ヒストンのアセチル化の変化に関与する KAT 活性が低下し、クロマチン構造に不適切な変化が生じます。 突然変異の結果は、発生に関与する遺伝子の活動の規制緩和の結果です。 ヒストンのアセチル化と RSTS の調節解除された遺伝子との間の機能的リンクに関するニューロンレベルの研究は現在利用できません。

このプロジェクトでは、研究者は、エピジェネティックな調節がヒストンのアセチル化によって媒介される標的遺伝子を特定します。 より具体的には、この研究は、皮質および錐体ニューロンの正常および病理学的ニューロン分化中のクロマチンダイナミクスに焦点を当てます。 研究者は、CBP 依存性ヒストン マーカー、RSTS 患者細胞で変更されたもの、およびそれらが制御する遺伝子座を決定します。 並行して、研究者は、RSTS 患者で神経細胞の発現が変化する遺伝子を定義します。

これらすべてのデータを統合することで、CBPリジンアセチルトランスフェラーゼ機能喪失の結果として、神経分化中にどの遺伝子が調節解除されるかを特定することができます。

研究の種類

観察的

入学 (推定)

154

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究連絡先

研究場所

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

2年歳以上 (子、大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

CHU de Bordeaux で専門的な相談を受けている RSTS の臨床的および分子的診断を受けた患者

説明

包含基準:

  • -RSTSの臨床的および分子的診断を受けた患者
  • CREBBPまたはEP300バリアントを保有する患者
  • 2歳以上の患者
  • 社会保障制度の加入患者または受益者。
  • 未成年の患者については、両親または親権者による無料の情報に基づく署名付きの同意
  • 後見下にある主な患者については、患者代表者による自由な説明と署名付きの同意
  • 主要な患者の場合、患者による無料の、インフォームドおよび署名付きの同意

除外基準:

以下の患者:

  • 生検の前、最中、後に使用される可能性のある製品またはデバイスに対するアレルギーの病歴;
  • 生検が行われる領域の皮膚疾患
  • 過去 6 か月間に、生検する領域で理学療法(放射線療法など)を受けた
  • 遺伝性または後天性の止血障害

治療中の患者:

  • 含める前の月と研究中に止血(抗凝固剤、血小板抗凝集剤など)に作用する可能性が高い
  • ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤 (バルプロ酸ナトリウム) による結果の解釈を妨げる可能性があります。

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

  • 観測モデル:ケースのみ
  • 時間の展望:見込みのある

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
RSTS患者
局所麻酔下で直径 3 mm のパンチで実行されます。 手順は、厳格な無菌を尊重する相談所で行うことができます。
CREBBP 変異を有する患者の誘導多能性幹細胞 (iPSC) 産生および皮質ニューロンおよび錐体ニューロンへの分化
液体クロマトグラフィーとタンデム質量分析 (LC-MS / MS) を組み合わせたアセチロームの研究 ChIP-Sequencing による特定のアセチル化ターゲットの検証
RNA-Seq によるトランスクリプトーム解析 CrispR-Cas9 による SRT 患者の CREBBP 変異の修正による同質遺伝子型 iPSC クローンの生成。
フィコールの達成 リンパ芽球の培養と保存 リンパ芽球系の樹立と保存

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
RSTS の特定のアセチル化プロファイルの同定
時間枠:インクルージョン訪問

インクルージョン訪問時に収集された皮膚生検サンプルから:

  • プロファイルを定義するために必要なヒストン マークの数に関する仮定はありません
  • ケースに 100% 存在し、コントロールに 100% 存在しない場合、疾患の特定のマークとして保持されます。
  • 特定のプロファイルは、細胞分化の 1 つまたは複数の段階で定義できます。iPSC - 神経前駆細胞 - 皮質および錐体ニューロン
インクルージョン訪問

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
SRT患者と対照の間の異なる標的遺伝子の同定
時間枠:インクルージョン訪問
SRT患者は、すでに利用可能な年齢と性別が一致した健康なボランティアからの4つの対照細胞培養と比較されます
インクルージョン訪問
RSTS 患者とコントロールの共通の標的遺伝子の発現レベルが著しく異なることの証拠
時間枠:インクルージョン訪問
インクルージョン訪問

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2019年10月8日

一次修了 (推定)

2025年10月1日

研究の完了 (推定)

2025年10月1日

試験登録日

最初に提出

2019年10月9日

QC基準を満たした最初の提出物

2019年10月9日

最初の投稿 (実際)

2019年10月10日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2024年1月17日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2024年1月16日

最終確認日

2024年1月1日

詳しくは

本研究に関する用語

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

ルビンスタイン・タイビ症候群の臨床試験

  • Sanford Health
    National Ataxia Foundation; Beyond Batten Disease Foundation; Pitt Hopkins Research Foundation; Cornelia... と他の協力者
    募集
    ミトコンドリア病 | 網膜色素変性症 | 重症筋無力症 | 好酸球性胃腸炎 | 多系統萎縮症 | 平滑筋肉腫 | 白質ジストロフィー | 痔瘻 | 脊髄小脳失調症3型 | フリードライヒ失調症 | ケネディ病 | ライム病 | 血球貪食性リンパ組織球症 | 脊髄小脳失調症1型 | 脊髄小脳性運動失調2型 | 脊髄小脳失調症6型 | ウィリアムズ症候群 | ヒルシュスプルング病 | 糖原病 | 川崎病 | 短腸症候群 | 低ホスファターゼ症 | レーバー先天性黒内障 | 口臭 | アカラシア心臓 | 多発性内分泌腫瘍 | リー症候群 | アジソン病 | 多発性内分泌腫瘍2型 | 強皮症 | 多発性内分泌腫瘍1型 | 多発性内分泌腫瘍2A型 | 多発性内分泌腫瘍2B型 | 非定型溶血性尿毒症症候群 | 胆道閉鎖症 | 痙性運動失調 | WAGR症候群 | アニリディア | 一過性全健忘症 | 馬尾症候群 | レフサム... およびその他の条件
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