Diagnóstico de RSTS: identificación de los perfiles de acetilación como marcadores epigenéticos para evaluar la causalidad de las variantes CREBBP y EP300. (GENEPI)
El síndrome de Rubinstein-Taybi (RSTS) es un trastorno congénito del desarrollo raro y grave caracterizado por anomalías congénitas y discapacidad intelectual con un déficit de memoria a largo plazo. El principal reto es mejorar la eficiencia intelectual y de memoria de estos pacientes. CREBBP y EP300 son los dos genes que se sabe que causan RSTS. Ambos parálogos juegan un papel importante en la remodelación de la cromatina y codifican coactivadores transcripcionales que interactúan con muchas proteínas.
El objetivo de este estudio piloto es caracterizar los perfiles de acetilación de histonas para identificar marcadores de acetilación específicos durante la diferenciación neuronal normal y patológica de neuronas corticales y piramidales en RSTS.
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Intervención / Tratamiento
- Procedimiento: biopsia de piel para el cultivo primario de fibroblastos y una muestra de sangre de 15 ml (3 muestras sin nombre de 5 ml) en cada uno de los 4 pacientes SRT incluidos.
- Otro: Generación de Células Madre Pluripotentes Inducidas (iPSC) a partir de fibroblastos obtenidos por biopsia de piel
- Otro: Perfiles de acetilación de histonas de células de pacientes SRT con mutaciones CREBBP
- Otro: Afectación funcional de las alteraciones epigenéticas identificadas
- Biológico: Cultivo de línea linfoblastoide a partir de muestra de sangre
Descripción detallada
CREBBP y EP300 son los dos genes parálogos asociados con el determinismo RSTS y codifican para CBP y p300, respectivamente. Estas proteínas son coactivadores transcripcionales que poseen un dominio catalítico de lisina acetil transferasa (KAT) implicado en la acetilación de residuos de lisina de histonas pero también de otras proteínas. CBP y p300 promueven la transcripción al crear un ambiente de cromatina que es favorable para la expresión génica y al vincular diferentes factores de transcripción entre sí. Así orquestan la regulación de la maquinaria de transcripción, desde el promotor basal hasta los potenciadores de los genes diana.
RSTS se considera un modelo genético de anomalía del neurodesarrollo con un componente epigenético.
La acetilación de histonas es una de las principales modificaciones postraduccionales (PTM) de estas proteínas que permiten la formación y el control de la estructura de la cromatina. Al diferenciar células embrionarias, esta modificación juega un papel clave en la activación transcripcional.
Los modelos de ratón de RSTS han establecido el vínculo entre la modulación de la acetilación de histonas y la formación de la memoria al mostrar su papel clave en la plasticidad neuronal. Sin embargo, no existen datos sobre la acetilación de histonas en las neuronas de pacientes RSTS. Además, en humanos, las vías moleculares afectadas por estas alteraciones durante el neurodesarrollo no están especificadas, especialmente en las neuronas piramidales, que son las precursoras de las neuronas del hipocampo involucradas en la codificación y almacenamiento de la memoria.
En RSTS, una pérdida de la función CBP da como resultado un déficit en la actividad KAT, que es responsable de alterar la acetilación de histonas, lo que lleva a cambios inapropiados en la estructura de la cromatina. La consecuencia de una mutación es el resultado de una desregulación de la actividad de los genes implicados en el desarrollo. Actualmente no hay estudios a nivel neuronal disponibles sobre el vínculo funcional entre la acetilación de histonas y los genes desregulados en el RSTS.
En este proyecto, los investigadores identificarán genes diana cuya regulación epigenética está mediada por la acetilación de histonas. Más específicamente, el estudio se centrará en la dinámica de la cromatina durante la diferenciación neuronal normal y patológica de las neuronas corticales y piramidales. Los investigadores determinarán entre los marcadores de histonas dependientes de CBP, aquellos que se modifican en las células de pacientes RSTS y los loci que controlan. Paralelamente, los investigadores definirán genes cuya expresión neuronal está alterada en pacientes con RSTS.
La integración de todos estos datos nos permitirá especificar qué genes están desregulados durante la diferenciación neuronal como consecuencia de la pérdida de función de la lisina acetiltransferasa CBP.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Julien VAN-GILS
- Número de teléfono: +33 5 57 82 03 53
- Correo electrónico: julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
Ubicaciones de estudio
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Talence, Francia, 33400
- Reclutamiento
- Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux
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Contacto:
- Julien VAN-GILS
- Número de teléfono: +33 5 57 82 03 53
- Correo electrónico: julien.van-gils@chu-bordeaux.fr
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Paciente con diagnóstico clínico y molecular de RSTS
- Pacientes que llevan las variantes CREBBP o EP300
- Pacientes mayores de 2 años
- Pacientes afiliados o beneficiarios de un régimen de seguridad social.
- Consentimiento libre, informado y firmado de los padres o del titular de la patria potestad para pacientes menores de edad
- Consentimiento libre, informado y firmado por el representante del paciente para los pacientes mayores bajo tutela
- Consentimiento libre, informado y firmado por el paciente para pacientes mayores
Criterio de exclusión:
Pacientes que tienen:
- antecedentes de alergia a cualquier producto o dispositivo que pueda usarse antes, durante y después de la biopsia;
- enfermedad cutánea de las zonas donde se va a realizar la biopsia
- se sometió a tratamiento físico (radioterapia,...) en la zona a biopsiar, durante los últimos 6 meses
- trastornos hereditarios o adquiridos de la hemostasia
Pacientes en tratamiento:
- susceptibles de actuar sobre la hemostasia (anticoagulantes, antiagregantes plaquetarios,...) en el mes anterior a la inclusión y durante el estudio
- por el inhibidor de la histona desacetilasa (valproato de sodio) que probablemente interfiera con la interpretación de los resultados.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Solo caso
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Pacientes con RSTS
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Se realiza con un punch de 3 mm de diámetro bajo anestesia local.
El procedimiento se puede realizar en un consultorio respetando una estricta asepsia.
producción inducida de células madre pluripotentes (iPSC) de pacientes con mutación CREBBP y diferenciación en neuronas corticales y neuronas piramidales
Estudio de acetiloma por cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS) Validación de dianas específicas de acetilación por ChIP-Sequencing
Análisis de transcriptoma con RNA-Seq Generación de clones iPSC isogénicos mediante corrección de mutaciones CREBBP en pacientes SRT por CrispR-Cas9.
Logro de un ficoll Cultivo de linfoblastos y conservación Establecimiento de línea linfoblastoide y conservación
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Identificación de un perfil de acetilación específico de RSTS
Periodo de tiempo: Visita de inclusión
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De la muestra de biopsia de piel recolectada en la visita de inclusión:
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Visita de inclusión
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Identificación de diferentes genes diana entre pacientes SRT y controles.
Periodo de tiempo: Visita de inclusión
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Los pacientes de SRT se compararán con 4 cultivos celulares de control de voluntarios sanos emparejados por edad y sexo ya disponibles
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Visita de inclusión
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Evidencia de un nivel de expresión significativamente diferente para genes diana comunes para pacientes y controles RSTS
Periodo de tiempo: Visita de inclusión
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Visita de inclusión
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
- Enfermedades del Sistema Nervioso
- Manifestaciones neurológicas
- Manifestaciones neuroconductuales
- Anomalías congénitas
- Enfermedades Genéticas Congénitas
- Enfermedades musculoesqueléticas
- Enfermedades óseas
- Discapacidad intelectual
- Anomalías craneofaciales
- Anomalías musculoesqueléticas
- Anomalías Múltiples
- Trastornos cromosómicos
- Enfermedades óseas del desarrollo
- Disostosis
- Síndrome de Rubinstein-Taybi
Otros números de identificación del estudio
- CHUBX 2019/19
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Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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