Nestemäinen biopsia paksusuolen syövän varhaisessa havaitsemisessa käyttäen kiertävää RNA:ta (CIRCLE)

Suolistosyöpä on kolmanneksi yleisin pahanlaatuinen kasvain ja toiseksi johtava syöpäkuolleisuuden aiheuttaja maailmanlaajuisesti. Huolimatta seulontakolonoskopian todistetusta hyödystä, sen tunkeilu luonne, korkeat kustannukset ja alhainen noudattamisasema rajoittavat sen käyttöä väestötasolla varhaiseen havaitsemiseen. Nykyiset ei-invasiiviset seulontatyökalut, kuten ulosten piilevä verikoe ja uloste-DNA-testit, tarjoavat rajoitetun herkkyyden, erityisesti varhaisvaiheen tai oikeanpuoleisten suolistosyöpien osalta.

Siksi on kasvava kliininen tarve erittäin herkälle, vähän tunkevalle ja potilastyytyväisyyttä noudattavalle diagnostiikkamenetelmälle, joka voi täydentää olemassa olevia seulontamenetelmiä.

Kiertävät RNA:t (circRNA:t) ovat uudenlainen luokka endogeenisiä ei-koodaavia RNA:ita, joille on ominainen kovalenttisesti suljetut silmukkarakenteet, jotka muodostuvat takaspleissausten kautta. Toisin kuin lineaariset RNA:t, circRNA:t ovat resistenttejä eksonukleaasivälitteiselle hajoamiselle ja erittäin stabiileja kehon nesteissä. Ne osoittavat kudos- ja syöpäspesifisiä ilmentymismalleja, mikä viittaa vahvaan potentiaaliin ei-invasiivisina biomarkkereina.

Nousevat todisteet osoittavat, että soluvapaat circRNA:t (cf-circRNA:t) kiertävät plasmassa tai seerumissa joko vapaasti tai kapseloituna solunulkoisiin rakotuksiin, kuten eksosomeihin. Nämä cf-circRNA:t säilyttävät alkuperäisen kasvaimensa molekyylisignatuurit ja niitä voidaan luotettavasti kvantifioida käyttämällä käänteiskirjoittaja-kvantitatiivista PCR:ää (RT-qPCR) tai seuraavan sukupolven sekvenointiin (NGS) perustuvia alustoja.

CIRCLED-tutkimus (Circular RNA for Colorectal Cancer Detection) on suunniteltu monikeskuksiseksi, tapauskontrolliseksi, observatiiviseksi tutkimukseksi, jonka tavoitteena on (1) tunnistaa diagnostiikkakykyisiä circRNA-ehdokkaita RNA-sekvensoinnista, ja (2) validoida cf-circRNA-diagnostiikkapaneeli, joka pystyy erottamaan suolistosyöpäpotilaat terveistä yksilöistä ja niistä, joilla on hyvänlaatuisia suolistosairauksia.