Microbiote Fécal et Métabolites Chez les Patients Atteints de Cancer de la Tête et du Cou Sous (Chimio)Radiothérapie

Le cancer de la tête et du cou représente environ 4 à 5 % de tous les cancers dans le monde et est associé à des résultats de survie relativement médiocres. La plupart des patients présentent une maladie localement avancée et, malgré un traitement multimodal agressif incluant la radiothérapie, une rechute survient chez jusqu'à la moitié des patients dans les deux ans. Les toxicités aiguës de la radiothérapie, en particulier la radiomucite et la radiodermite, surviennent chez plus de 90 % des patients et peuvent entraîner des interruptions de traitement, affectant négativement les résultats.

Des preuves récentes indiquent que le microbiome intestinal (microbiote fécal) et ses métabolites peuvent influencer l'efficacité et la toxicité des traitements anticancéreux. Des études ont démontré des associations entre la composition du microbiote intestinal et la réponse à l'immunothérapie et à la chimiothérapie, et des données précliniques suggèrent que des métabolites bactériens spécifiques, notamment les acides gras à chaîne courte et les métabolites du tryptophane, peuvent affecter la toxicité et la survie liées à la radiothérapie. Des études cliniques émergentes ont également montré des associations entre la diversité du microbiome intestinal de base et la survie ou la réponse à la chimioradiothérapie dans plusieurs types de cancer. Cependant, les données concernant les patients atteints d'un cancer de la tête et du cou restent limitées.

Cette étude clinique prospective vise à évaluer l'association entre la composition du microbiome fécal et certains métabolites bactériens avec la réponse au traitement et la toxicité aiguë chez les patients atteints d'un cancer de la tête et du cou localement avancé subissant une radiothérapie radicale avec ou sans chimiothérapie concomitante à l'Institut d'oncologie de Ljubljana.

Les participants seront traités selon la pratique clinique institutionnelle standard et les directives internationales. Des échantillons biologiques seront collectés à deux moments pendant le traitement : (1) du début de la radiothérapie jusqu'à 7 jours après le début, mais avant l'administration du premier cycle de chimiothérapie (le cas échéant), et (2) pendant les 7 derniers jours de la radiothérapie. À chaque moment, les participants fourniront un échantillon de selles (10-20 ml) collecté à domicile et conservé à 4 °C jusqu'à la livraison à l'hôpital. De plus, un échantillon de sang de 7 ml sera prélevé lors des prélèvements sanguins cliniques de routine. Les échantillons seront traités et conservés à -80 °C.

L'analyse du microbiome sera réalisée par séquençage des régions V3-V4 du gène 16S ARNr. Les gènes bactériens clés impliqués dans la production de butyrate (buk et but) seront quantifiés par PCR. Une métabolomique ciblée par chromatographie liquide-spectrométrie de masse (LC-MS) sera réalisée pour quantifier les acides gras à chaîne courte et les métabolites du tryptophane dans les échantillons de selles et de sérum.

Des données cliniques et démographiques seront collectées pour chaque participant, y compris l'apport alimentaire au cours des 24 heures précédant l'échantillonnage, les paramètres dose-volume de la radiothérapie, la toxicité aiguë et tardive évaluée à l'aide de CTCAE v5.0, et la réponse au traitement évaluée par imagerie TDM ou TEP-TDM 3 mois après la fin de la (chimio)radiothérapie selon les critères RECIST 1.1. Les participants seront suivis pour la survie sans rechute et la survie globale pendant deux ans.

Le critère de jugement principal est la réponse au traitement, définie comme une réponse complète versus une réponse incomplète à l'évaluation d'imagerie à 3 mois. Les critères secondaires incluent la survie globale, la survie sans rechute à deux ans et la toxicité aiguë liée au traitement. Les analyses statistiques incluront l'évaluation de la diversité alpha et bêta, l'analyse PERMANOVA et des modèles de régression logistique pour évaluer les associations entre les caractéristiques du microbiome, les concentrations de métabolites et les résultats cliniques.

L'étude est exploratoire et conçue comme une étude de détection de signaux. Sur la base d'études publiées comparables et de considérations de faisabilité, environ 60 patients seront inclus.