固形腫瘍の分子解析 (MAST)
この研究では、原発性および転移性神経芽腫、骨肉腫、網膜芽細胞腫、ユーイング肉腫ファミリーの腫瘍、軟部肉腫、副腎皮質腫瘍、および肝悪性腫瘍の分子的、細胞的、および遺伝的特性を前向きに特徴付けます。 これらの細胞分離株は、遺伝子発現アレイ解析、[SNP] 一塩基多型チップによるゲノム解析、アレイ [CGH] 比較ゲノムハイブリダイゼーションと次世代シーケンシング、および [TEM] 透過型電子顕微鏡解析に使用されます。 さらに、細胞株と同所性異種移植片は、得られた腫瘍標本から作成されます。
TCR の特異性は、末梢血と腫瘍浸潤 CD4+ および CD8+ T 細胞からのペア TCR を比較することによって調べられます。 これらの細胞のメチル化プロファイルを調べ、PD1 阻害前および後の抗腫瘍 T 細胞応答を調査するために、エピジェネティックな研究が行われます。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
詳細な説明
研究の種類
研究の種類
入学 (推定)
入学
連絡先と場所
研究連絡先
研究連絡先
- 名前:Sara M. Federico, MD
- 電話番号:1-866-278-5833
- メール:referralinfo@stjude.org
研究場所
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Tennessee
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Memphis、Tennessee、アメリカ、38105
- 募集
- St. Jude Children's Research Hospital
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コンタクト:
- Sara M. Federico, MD
- 電話番号:866-278-5833
- メール:referralinfo@stjude.org
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主任研究者:
- Sara M. Federico, MD
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- -神経芽細胞腫、骨肉腫、腫瘍のユーイング肉腫ファミリー、または軟部組織肉腫の疑いまたは既知の診断が必要です 最初の診断精査および切除に適した肉眼的疾患の証拠。 標本は、次の時点の一部またはすべてで収集できます: 初期生検、骨髄吸引手順、腫瘍切除、および再発の可能性がある時点。
- 初期の診断精密検査に基づいて網膜芽細胞腫と診断され、除核を必要とする患者は、網膜芽細胞腫に対する積極的な治療または生物学的プロトコルがない場合、登録される可能性があります。
- 患者またはその法定後見人は、必要に応じて、このプロトコルのための組織/骨髄/血液サンプルの最初の収集の除去から 30 日以内に書面によるインフォームド コンセントを提供する必要があります。
- 患者は、セント・ジュード小児研究病院または協力機関で診察を受けています。
- 患者は登録時に25歳以下でなければなりません。
除外基準:
- -患者はB型肝炎、C型肝炎および/またはHIV陽性であることが知られています。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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遺伝子発現プロファイルの分析を実行します。 [RNA] リボ核酸は、新鮮な凍結腫瘍標本から分離され、Affymetrix 遺伝子発現アレイにハイブリダイズされます。
時間枠:5年
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5年
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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増幅や欠失などの大きな染色体変化の分析を実行します。 [DNA] 腫瘍および血液サンプルから分離されたデオキシリボ核酸は、アレイ [CGH] 比較ゲノム ハイブリダイゼーション チップにハイブリダイズします。
時間枠:5年
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5年
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増幅、欠失、およびヘテロ接合性の喪失 (LOH) を含む、ゲノムの局所的な変化の分析を実行します。腫瘍と血液サンプルから分離された DNA は、[SNP] 一塩基多型チップにハイブリダイズします。
時間枠:5年
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5年
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点突然変異の分析を実行します。腫瘍と血液サンプルから分離された DNA は、次世代シーケンシング技術を使用して配列決定され、全ゲノムの配列が決定されます。
時間枠:5年
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5年
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細胞形態の分析を実行します。組織サンプルは、透過型電子顕微鏡に適したバッファーで固定され、[TEM] 透過型電子顕微鏡分析用に処理されます。
時間枠:5年
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5年
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腫瘍のマイクロ RNA を比較します。マイクロ RNA は、上記の遺伝子発現解析から残った総 [RNA] リボ核酸から分離されます。これらのサンプルは、マイクロ [RNA] チップ解析またはディープ シーケンスに使用されます。
時間枠:5年
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5年
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[DNA] デオキシリボ核酸のエピジェネティック修飾を比較します。ゲノム DNA を分離し、DNA メチル化をゲノム全体で分析して、このエピジェネティックなプロセスが腫瘍サンプルで変化しているかどうかを判断します。
時間枠:5年
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5年
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クロマチンのエピジェネティックな修飾を比較します。 [ChIP-seq]クロマチン免疫沈降または[ChIP-chip分析]クロマチン免疫沈降によってタンパク質-DNA複合体を直接プローブするために、細胞を迅速に固定し、クロマチンを調製します。
時間枠:5年
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5年
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タンパク質分析を実行します。腫瘍細胞は、その後の総タンパク質または細胞タンパク質の特定の画分 (すなわち、核、細胞質、膜タンパク質) の分離のために急速に凍結されます。
時間枠:5年
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5年
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神経芽細胞腫、骨肉腫、網膜芽細胞腫、ESFT、軟部肉腫の免疫組織化学および FISH 分析を実行します。組織マイクロ アレイは、この研究で収集されたサンプルから準備されます。
時間枠:5年
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5年
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原発性および転移性腫瘍標本から得られた細胞分離株を使用して、免疫不全マウスで細胞株および同所性異種移植片を確立します。
時間枠:5年
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5年
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細胞増殖、転移、および化学療法に対する感受性の分析を行います。
時間枠:5年
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5年
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新鮮な腫瘍サンプルのフローサイトメトリー解析を利用して、小児固形腫瘍における免疫細胞浸潤の程度とその機能状態を評価します。
時間枠:5年
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5年
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治療後の腫瘍関連マクロファージ (TAMS) を評価して、治療後の微小環境におけるマクロファージの組織修復特性の遺伝子発現パターン、マーカー、および機能的相関を特定します。
時間枠:5年
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5年
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協力者と研究者
協力者
協力者
捜査官
捜査官
- 主任研究者:Sara M. Federico, MD、St. Jude Children's Research Hospital
出版物と役立つリンク
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (推定)
一次修了
研究の完了 (推定)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- MAST
- DOD-W81XWH-14-1-0103(CA130396) (その他の助成金/資金番号:DOD-Department of the Army)
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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