고형 종양의 분자 분석 (MAST)
이 연구는 원발성 및 전이성 신경모세포종, 골육종, 망막모세포종, 종양의 유잉 육종 계열, 연조직 육종, 부신피질 종양 및 간 악성종양의 분자, 세포 및 유전적 특성을 전향적으로 특성화할 것입니다. 분리된 세포는 유전자 발현 어레이 분석, [SNP] 단일 염기 다형성 칩에 의한 게놈 분석, 어레이[CGH] 비교 게놈 혼성화 및 차세대 시퀀싱, [TEM] 투과전자현미경 분석에 사용될 예정이다. 추가로 세포주 및 동소 이종 이식편은 획득한 종양 표본에서 생성됩니다.
TCR의 특이성은 말초 혈액 및 종양 침윤 CD4+ 및 CD8+ T 세포로부터 쌍을 이루는 TCR을 비교함으로써 조사될 것이다. 이들 세포의 메틸화 프로필을 살펴보고 PD1 억제 전후 모두에서 항종양 T 세포 반응을 조사하기 위해 후생유전학 연구가 수행될 것입니다.
연구 개요
상태
상태
정황
정황
상세 설명
연구 유형
연구 유형
등록 (추정된)
등록
연락처 및 위치
연구 연락처
연구 연락처
- 이름: Sara M. Federico, MD
- 전화번호: 1-866-278-5833
- 이메일: referralinfo@stjude.org
연구 장소
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Tennessee
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Memphis, Tennessee, 미국, 38105
- 모병
- St. Jude Children's Research Hospital
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연락하다:
- Sara M. Federico, MD
- 전화번호: 866-278-5833
- 이메일: referralinfo@stjude.org
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수석 연구원:
- Sara M. Federico, MD
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참여기준
자격 기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 신경아세포종, 골육종, 종양의 유잉 육종 계열 또는 연조직 육종의 의심되거나 알려진 진단이 있어야 하며, 초기 진단 검사 및 절제가 가능한 총체적인 질병의 증거가 있어야 합니다. 표본은 다음 시점 중 일부 또는 전부에서 수집할 수 있습니다: 초기 생검, 골수 흡인 절차, 종양 절제 및 가능한 재발 시점.
- 망막모세포종에 대한 활성 치료 또는 생물학적 프로토콜이 없는 경우 초기 진단 정밀 검사를 기반으로 망막모세포종 진단을 받고 적출이 필요한 환자를 등록할 수 있습니다.
- 환자 또는 환자의 법적 보호자는 해당하는 경우 이 프로토콜에 대한 조직/골수/혈액 샘플의 첫 번째 수집을 제거한 후 30일 이내에 서면 동의서를 제공해야 합니다.
- 환자는 St. Jude Children's Research Hospital 또는 협력 기관에서 진찰을 받고 있습니다.
- 환자는 등록 당시 25세 이하여야 합니다.
제외 기준:
- 환자는 B형 간염, C형 간염 및/또는 HIV 양성인 것으로 알려져 있습니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
주요 결과 측정
결과 측정 |
기간 |
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유전자 발현 프로필 분석을 수행합니다. [RNA] 리보핵산은 신선한 냉동 종양 표본에서 분리되어 Affymetrix 유전자 발현 어레이에 혼성화됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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2차 결과 측정
2차 결과 측정
결과 측정 |
기간 |
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증폭 및 결실과 같은 대규모 염색체 변형 분석을 수행합니다. 종양 및 혈액 샘플로부터 분리된 [DNA] 데옥시리보핵산은 어레이 [CGH] 비교 게놈 혼성화 칩에 혼성화될 것이다.
기간: 5 년
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5 년
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증폭, 삭제 및 이형 접합체 손실(LOH)을 포함하여 게놈의 초점 변경 분석을 수행합니다. 종양 및 혈액 샘플에서 분리된 DNA는 [SNP] 단일 염기 다형성 칩에 혼성화됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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점 돌연변이 분석을 수행합니다. 종양 및 혈액 샘플에서 분리된 DNA는 전체 게놈의 서열을 결정하기 위해 차세대 시퀀싱 기술을 사용하여 시퀀싱됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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세포 형태 분석을 수행합니다. 조직 샘플은 투과 전자 현미경에 적합한 버퍼에 고정되고 [TEM] 투과 전자 현미경 분석을 위해 처리됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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종양의 마이크로 RNA를 비교합니다. 마이크로 RNA는 위에서 설명한 유전자 발현 분석에서 남은 총 [RNA] 리보 핵산에서 분리됩니다. 이 샘플은 마이크로 [RNA] 칩 분석 또는 딥 시퀀싱에 사용됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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[DNA] 데옥시리보핵산의 후생유전학적 변형을 비교합니다. 게놈 DNA를 분리하고 DNA 메틸화를 게놈 전체에서 분석하여 이 후생유전학적 과정이 종양 샘플에서 변경되는지 여부를 결정합니다.
기간: 5 년
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5 년
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염색질의 후생유전학적 변형을 비교합니다. [ChIP-seq]염색질 면역침전법 또는 [ChIP-칩 분석] 염색질 면역침전법으로 단백질-DNA 복합체를 직접 조사하기 위해 세포를 신속하게 고정하고 염색질을 준비합니다.
기간: 5 년
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5 년
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단백질 분석을 수행합니다. 종양 세포는 전체 단백질 또는 세포 단백질(즉, 핵, 세포질, 막 단백질)의 특정 분획의 후속 분리를 위해 신속하게 동결됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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신경모세포종, 골육종, 망막모세포종, ESFT 및 연조직 육종의 면역조직화학 및 FISH 분석을 수행합니다. 조직 마이크로어레이는 이 연구에서 수집된 샘플에서 준비됩니다.
기간: 5 년
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5 년
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원발성 및 전이성 종양 표본에서 얻은 세포 단리물은 면역약화 마우스에서 세포주 및 동소 이종 이식편을 확립하는 데 사용될 것입니다.
기간: 5 년
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5 년
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세포 성장, 전이 및 화학 요법에 대한 민감도 분석을 수행합니다.
기간: 5 년
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5 년
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신선한 종양 샘플의 유세포 분석을 활용하여 소아 고형 종양에서 면역 세포 침투의 정도와 기능적 상태를 평가합니다.
기간: 5 년
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5 년
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치료 후 미세 환경에서 대식세포의 조직 복구 특성의 유전자 발현 패턴, 마커 및 기능적 상관관계를 찾기 위해 치료 후 종양 관련 대식세포(TAMS)를 평가합니다.
기간: 5 년
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5 년
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공동 작업자 및 조사자
협력자
협력자
수사관
수사관
- 수석 연구원: Sara M. Federico, MD, St. Jude Children's Research Hospital
간행물 및 유용한 링크
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
연구 시작
기본 완료 (추정된)
기본 완료
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연구 완료
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최초 제출
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QC 기준을 충족하는 최초 제출
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마지막 업데이트 게시됨
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
기타 연구 ID 번호
- MAST
- DOD-W81XWH-14-1-0103(CA130396) (기타 보조금/기금 번호: DOD-Department of the Army)
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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