がん患者のゲノムプロファイリング
この研究の目的は、がんの特定の遺伝子が異常であるかどうかを判断することです。 遺伝子が異常な場合、これは突然変異と呼ばれます。 がん細胞のほとんどの変異は遺伝ではなく(親から受け継がれます)、がん自体の出生後に発生します。 ほとんどのがんには多くの変異があります。 これらの変異には、がん細胞の生存に重要なものもあれば、そうでないものもあります。 この研究の目標は、以前の手術または生検からの残りの腫瘍組織を使用して、特定の変異について癌をテストすることです。 参加者はまた、頬の血液 (バッカルスワブとも呼ばれます) のチューブ、または比較のために正常な遺伝子を含む唾液サンプルを提供するよう求められます。
この調査のパート B の目的は次のとおりです。
腫瘍の遺伝的変化が、実験的ながん治療に反応する可能性にどのように影響するかを理解します。 がんの標的治療に反応して、腫瘍内の遺伝子が時間とともにどのように変化するかを理解します。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
介入・治療
介入・治療
研究の種類
研究の種類
入学 (推定)
入学
連絡先と場所
研究連絡先
研究連絡先
- 名前:David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Zsofia Stadler, MD
- 電話番号:646-888-4039
研究場所
-
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Connecticut
-
Bridgeport、Connecticut、アメリカ、06606
- まだ募集していません
- St. Vincent (Data Collection Only)
-
コンタクト:
- Christopher Iannuzzi, MD
- 電話番号:203-576-6000
-
Hartford、Connecticut、アメリカ、06102
- まだ募集していません
- Hartford Healthcare Cancer Institute @ Hartford Hospital
-
コンタクト:
- Andrew Salner, MD
- 電話番号:860-972-2803
-
Norwalk、Connecticut、アメリカ、06850
- 募集
- Norwalk Hospital
-
コンタクト:
- Linda Vahdat, MD
- 電話番号:203-845-4811
-
-
Florida
-
Miami、Florida、アメリカ、33143
- 募集
- Baptist Alliance MCI
-
コンタクト:
- John Diaz, MD
- 電話番号:786-596-2000
-
-
New Jersey
-
Basking Ridge、New Jersey、アメリカ、07920
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Basking Ridge
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
Middletown、New Jersey、アメリカ、07748
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Monmouth
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
Montvale、New Jersey、アメリカ、07645
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Bergen
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
-
New York
-
Brooklyn、New York、アメリカ、11203
- 募集
- Kings County Hopsital Center
-
コンタクト:
- Jason Gonsky, MD
- 電話番号:718-245-2847
-
Commack、New York、アメリカ、11725
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Cancer Commack
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
Harrison、New York、アメリカ、10604
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Westchester
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
Jamaica、New York、アメリカ、11432
- 募集
- Queens Cancer Center of Queens Hospital
-
コンタクト:
- Debra Ferman, MD
- 電話番号:718-579-6021
-
New York、New York、アメリカ、10065
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Cancer Center
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
コンタクト:
- Zsofia Stadler, MD
- 電話番号:646-888-4039
-
主任研究者:
- David Solit, MD
-
New York、New York、アメリカ、10029
- 募集
- Metropolitan Hospital Center
-
コンタクト:
- Anitha Srinivasan, MD
- 電話番号:212-423-6262
-
New York、New York、アメリカ、10035
- 募集
- Ralph Lauren Center for Cancer Care and Prevention
-
コンタクト:
- Lewis P. Kampel, MD
- 電話番号:646-422-4474
-
Richmond Hill、New York、アメリカ、11418
- 募集
- Medisys Health Network (Data Collection Only)
-
コンタクト:
- Rosa Nouvini, MD
- 電話番号:718-206-6000
-
The Bronx、New York、アメリカ、10451
- 募集
- NYC Health & Hospitals /Lincoln Medical Center
-
コンタクト:
- Monica Reddy Muppidi, MD
- 電話番号:718-579-4977
-
主任研究者:
- Monica Reddy Muppidi, MD
-
Uniondale、New York、アメリカ、11553
- 募集
- Memorial Sloan Kettering Nassau
-
コンタクト:
- David Solit, MD
- 電話番号:646-888-2641
-
-
Pennsylvania
-
Allentown、Pennsylvania、アメリカ、18103
- 募集
- Lehigh Valley Health Network
-
コンタクト:
- Suresh Nair, MD
- 電話番号:610-402-7880
-
-
参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
固形がんまたは血液がんの患者で、治療プロトコルの潜在的な候補者である可能性があり、考慮される患者は、この研究のパートAに採用されます。 治療臨床試験への登録は、このプロトコルへの登録に左右されません。
パート B: 研究コレクション コホート 潜在的に適切な患者は、参加している各疾病管理チームの担当医によって特定されます。
説明
包含基準:
パート A:
- がんの病歴のある患者、またはがんの病歴が記録されていない患者で、がんの診断を確認または除外するために外科的処置、生検、またはリキッドバイオプシー(無細胞DNA検査など)を受けている。
パート B:
- 患者は、MSKCC IRB # 12-245 のパート A に正常に登録されている必要があります。MSKCC IRB # 12-245 の主任/副主任研究者から得られた、患者の同意に対する事前の書面による承認。
パート C:
- 患者は、MSK または CHERPn/アライアンス/アフィリエイト サイトで継続的なケアを受けているか、以前に MSK の医師に相談したことがある必要があります。
- -患者は、この研究のパートAに首尾よく同意している必要があります。
パート D:
- がんの既往歴がない患者は、家族歴、分子がんマーカーによりがん発症のリスクが高く、がんリスクの増加、または以前/進行中の環境曝露またはライフスタイル要因に関連する遺伝子のキャリア状態を知っています。
除外基準:
すべての部品:
- -インフォームドコンセントを提供したくない、または提供できない。
パート C および D:
- 同種骨髄/幹細胞移植を受けた患者。
- 急性または慢性の骨髄性腫瘍、組織球性腫瘍、またはその他の骨髄増殖性疾患 (例: MDS, MPN, MDS/MPN) 生殖細胞系 DNA の供給源としての血液または唾液の使用を排除します。 たとえば、血液悪性腫瘍の患者で、循環疾患負荷が高い (フローサイトメトリーまたは CBC 差からの WBC が 10% を超えると定義)。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:見込みのある
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
介入・治療介入・治療 |
|---|---|
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固形腫瘍のある患者
-患者は固形がんまたは血液がんに罹患している必要があります。
の治療のために。
-患者はMSKCCで腫瘍の病理学的確認を受けており、次のいずれかを持っている必要があります。 / 血液がんの場合の骨髄採取) このプロトコルの文脈外、または 3) 外部施設で入手可能なアーカイブ組織。
原発部位からのプロスペクティブ ジェノタイピング組織標本では、組織の入手可能性と質に基づいて転移または再発が使用されます。
|
パート A は、腫瘍の分子プロファイリングです。
パート A との関連で、新たな腫瘍生検は行われません。患者が手術または腫瘍生検を受ける場合、この処置の残りの組織 (または追加のコア) を分子プロファイリングに使用できます。
臨床アッセイ:この検査は、CLIA 認定の Molecular Diagnostics Service ラボで実施されます。
Research Assay(s): このプロトコルは、研究用の「次世代」プロファイリング技術の使用を試験的に使用するためのプラットフォームとしても使用されます。
全エクソーム シーケンス、全ゲノム シーケンス RNA シーケンス 無細胞腫瘍 DNA/RNA シーケンス、プロテオミクスなど。
直交アッセイを使用してこれらのアッセイで得られた結果を確認するために、Sanger、Sequenom、MiSeq、または IMPACT テストなどの追加のシーケンスを、CLIA または非 CLIA 設定のいずれかで利用することができます。研究は、最小限のリスク収集と研究生検の対象となります。
パート C: 臨床生殖細胞系分析体細胞配列と比較するために一致する正常な末梢血サンプルを提供した参加者には、MSK-IMPACT パネルで遺伝子の有害なまたは有害な可能性のある変異の存在についてその生殖細胞系 DNA サンプルを分析する機会が提供されます。遺伝的感受性に関連していることが知られているもの、または二次分析を受ける必要がある遺伝子のコンセンサス リスト (「ACMG リスト」など) に含まれているもの。 パート D: がんリスクが高い個人の生殖細胞系プロファイリング |
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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「実行可能な」発癌性変異の頻度
時間枠:1年
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「実行可能な」変異は、1) FDA が別のがん適応症での使用を承認した薬剤に対する感受性または耐性を予測することが示されている変異、または 2) 前臨床モデルにおいて、治験中のクラスに対する感受性または耐性を予測する変異として定義されます。薬物。
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1年
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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CLIA環境で行われた分子プロファイリングの結果が患者の治療に与える影響を判断すること。
時間枠:1年
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バイオインフォマティクス コアは、WES や WGS などの次世代シーケンス技術によって生成されたデータの解釈を支援します。
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1年
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メカニズムを調べる
時間枠:1年
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標的療法に対する根底にある反応と耐性(de-novoおよび後天性)。
これを達成するために使用される研究アッセイは、臨床環境と利用可能な組織によって異なり、Sanger、Sequenom、MiSeq、エクソンキャプチャー(IMPACT)、全エクソーム、および全ゲノムシーケンシングが含まれる場合があります。
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1年
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腫瘍形成の遺伝的メカニズムを探る
時間枠:2
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全エクソーム配列決定、全ゲノム配列決定、または RNA 配列決定などのさらに包括的な研究プロファイリング技術を使用することにより、高度に多重化された次世代シーケンシング (すなわち、IMPACT テスト) で特定可能な原因となるゲノム変化のない標本のサブセットで
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2
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協力者と研究者
捜査官
捜査官
- 主任研究者:David Solit, MD、Memorial Sloan Kettering Cancer Center
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Seldon CS, Meiyappan K, Hoffman H, Guo JA, Goel N, Hwang WL, Nguyen PL, Mahal BA, Alshalalfa M. Genomic alterations predictive of poor clinical outcomes in pan-cancer. Oncotarget. 2022 Sep 28;13:1069-1077. doi: 10.18632/oncotarget.28276. eCollection 2022.
- Rosenzweig J, Pillai PM, Prockop S, Benayed R, Eidenschink Brodersen L, Najfeld V, Loken MR, Zhang Y, Shukla N. Acute myeloid leukemia with an MN1-ETV6 fusion in a young child with Down syndrome. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2022 Apr 28;8(3):a006167. doi: 10.1101/mcs.a006167. Print 2022 Apr.
- Lin AL, Tabar V, Young RJ, Cohen M, Cuaron J, Yang TJ, Rosenblum M, Rudneva VA, Geer EB, Bodei L. Synergism of Checkpoint Inhibitors and Peptide Receptor Radionuclide Therapy in the Treatment of Pituitary Carcinoma. J Endocr Soc. 2021 Aug 7;5(10):bvab133. doi: 10.1210/jendso/bvab133. eCollection 2021 Oct 1.
- Fiala EM, Jayakumaran G, Mauguen A, Kennedy JA, Bouvier N, Kemel Y, Fleischut MH, Maio A, Salo-Mullen EE, Sheehan M, Arnold AG, Latham A, Carlo MI, Cadoo K, Murkherjee S, Slotkin EK, Trippett T, Glade Bender J, Meyers PA, Wexler L, Dela Cruz FS, Cheung NK, Basu E, Kentsis A, Ortiz M, Francis JH, Dunkel IJ, Khakoo Y, Gilheeney S, Farouk Sait S, Forlenza CJ, Sulis M, Karajannis M, Modak S, Gerstle JT, Heaton TE, Roberts S, Yang C, Jairam S, Vijai J, Topka S, Friedman DN, Stadler ZK, Robson M, Berger MF, Schultz N, Ladanyi M, O'Reilly RJ, Abramson DH, Ceyhan-Birsoy O, Zhang L, Mandelker D, Shukla NN, Kung AL, Offit K, Zehir A, Walsh MF. Prospective pan-cancer germline testing using MSK-IMPACT informs clinical translation in 751 patients with pediatric solid tumors. Nat Cancer. 2021 Mar;2:357-365. doi: 10.1038/s43018-021-00172-1. Epub 2021 Feb 15.
- Stadler ZK, Maio A, Chakravarty D, Kemel Y, Sheehan M, Salo-Mullen E, Tkachuk K, Fong CJ, Nguyen B, Erakky A, Cadoo K, Liu Y, Carlo MI, Latham A, Zhang H, Kundra R, Smith S, Galle J, Aghajanian C, Abu-Rustum N, Varghese A, O'Reilly EM, Morris M, Abida W, Walsh M, Drilon A, Jayakumaran G, Zehir A, Ladanyi M, Ceyhan-Birsoy O, Solit DB, Schultz N, Berger MF, Mandelker D, Diaz LA Jr, Offit K, Robson ME. Therapeutic Implications of Germline Testing in Patients With Advanced Cancers. J Clin Oncol. 2021 Aug 20;39(24):2698-2709. doi: 10.1200/JCO.20.03661. Epub 2021 Jun 16.
- Diolaiti D, Dela Cruz FS, Gundem G, Bouvier N, Boulad M, Zhang Y, Chou AJ, Dunkel IJ, Sanghvi R, Shah M, Geiger H, Rahman S, Felice V, Wrzeszczynski KO, Darnell RB, Antonescu CR, French CA, Papaemmanuil E, Kung AL, Shukla N. A recurrent novel MGA-NUTM1 fusion identifies a new subtype of high-grade spindle cell sarcoma. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003194. doi: 10.1101/mcs.a003194. Print 2018 Dec.
- Forlenza CJ, Zhang Y, Yao J, Benayed R, Steinherz P, Ramaswamy K, Kessel R, Roshal M, Shukla N. A case of KMT2A-SEPT9 fusion-associated acute megakaryoblastic leukemia. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6):a003426. doi: 10.1101/mcs.a003426. Print 2018 Dec.
- Boucai L, Falcone J, Ukena J, Coombs CC, Zehir A, Ptashkin R, Berger MF, Levine RL, Fagin JA. Radioactive Iodine-Related Clonal Hematopoiesis in Thyroid Cancer Is Common and Associated With Decreased Survival. J Clin Endocrinol Metab. 2018 Nov 1;103(11):4216-4223. doi: 10.1210/jc.2018-00803.
- Schram AM, Reales D, Galle J, Cambria R, Durany R, Feldman D, Sherman E, Rosenberg J, D'Andrea G, Baxi S, Janjigian Y, Tap W, Dickler M, Baselga J, Taylor BS, Chakravarty D, Gao J, Schultz N, Solit DB, Berger MF, Hyman DM. Oncologist use and perception of large panel next-generation tumor sequencing. Ann Oncol. 2017 Sep 1;28(9):2298-2304. doi: 10.1093/annonc/mdx294.
- Mandelker D, Zhang L, Kemel Y, Stadler ZK, Joseph V, Zehir A, Pradhan N, Arnold A, Walsh MF, Li Y, Balakrishnan AR, Syed A, Prasad M, Nafa K, Carlo MI, Cadoo KA, Sheehan M, Fleischut MH, Salo-Mullen E, Trottier M, Lipkin SM, Lincoln A, Mukherjee S, Ravichandran V, Cambria R, Galle J, Abida W, Arcila ME, Benayed R, Shah R, Yu K, Bajorin DF, Coleman JA, Leach SD, Lowery MA, Garcia-Aguilar J, Kantoff PW, Sawyers CL, Dickler MN, Saltz L, Motzer RJ, O'Reilly EM, Scher HI, Baselga J, Klimstra DS, Solit DB, Hyman DM, Berger MF, Ladanyi M, Robson ME, Offit K. Mutation Detection in Patients With Advanced Cancer by Universal Sequencing of Cancer-Related Genes in Tumor and Normal DNA vs Guideline-Based Germline Testing. JAMA. 2017 Sep 5;318(9):825-835. doi: 10.1001/jama.2017.11137.
- Borio M, Sheehan M, Katabi N, Sacca RE, Maio A, Kemel Y, Khurram A, Mandelker D, Birsoy O, Solit D, Carlo MI, Liu Y, Abbass M, Banaszak L, Kesserwan C, Murciano-Goroff YR, Latham A, Offit K, Wong RJ, Ghossein R, Boucai L, Tuttle M, Stadler ZK. Prevalence of Germline Pathogenic RET Variants in a Pan-Cancer Patient Population. JCO Precis Oncol. 2026 May;10(5):e2500737. doi: 10.1200/PO-25-00737. Epub 2026 May 22.
- Gelfer R, Gulla A, Kalvin HL, Song Y, Harding J, Abou-Alfa GK, O'Reilly EM, Park W, Chandwani R, Wei A, Kingham P, Drebin J, Balachandran V, D'Angelica M, Soares K, Gonen M, Jarnagin WR. KRAS Variants Are Associated With Survival Outcomes and Genomic Alterations in Biliary Tract Cancers. JCO Precis Oncol. 2024 Dec;8:e2400263. doi: 10.1200/PO.24.00263. Epub 2024 Dec 6.
- Mondaca S, Walch H, Sepulveda S, Schultz N, Munoz G, Yaqubie A, Macanas P, Pareja C, Garcia P, Chatila W, Nervi B, Li B, Harding JJ, Viviani P, Roa JC, Abou-Alfa GK. Clinical and Genomic Characterization of ERBB2-Altered Gallbladder Cancer: Exploring Differences Between an American and a Chilean Cohort. JCO Glob Oncol. 2024 Oct;10:e2400090. doi: 10.1200/GO.24.00090. Epub 2024 Oct 10.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
研究開始
一次修了 (推定)
一次修了
研究の完了 (推定)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
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