アレルギー性鼻炎に対する統合的オミックスアプローチ (IntegOmics)

鼻粘液と鼻上皮は、アレルゲンに対する最初の防御バリアです。 アレルギー性鼻炎で役割を果たし、アレルゲンへの曝露に対する免疫応答を反映するさまざまなタンパク質が鼻汁に含まれています。 アレルギー性鼻炎患者と健常対照者のプロテオミクスプロファイルの違いは、応答がどのように機能するか、どのタンパク質が免疫反応の増強または上皮の完全性の増強などの防御応答につながるかについての洞察を与えることができます. また、気道上皮が気道免疫応答および炎症の調節において重要な役割を果たしていることも知られています。 遺伝子発現プロファイリングは、複雑な疾患の分析に広く使用されています。 病気の状態と健康な状態、およびベースラインと誘発された状態の気道上皮遺伝子発現プロファイルは、防御反応のメカニズムと炎症プロセスの経過を明らかにすることができます。 さまざまな遺伝子発現の結果としての鼻粘液タンパク質は、アレルゲンと上皮の間のこの複雑なメカニズムおよび相互作用の最終産物の一部として見ることができます。

鼻粘液タンパク質には異なる起源と産生部位があり、遺伝子発現は必ずしも機能的な代謝産物をもたらすとは限りません。 この提案されたプロジェクトの目的は、鼻上皮から鼻粘液中のタンパク質/プロテオミクス レベルまでの遺伝子/ゲノム レベルでのアレルゲンに対する応答を全体的なプロテオミクス アプローチで試み、分析することです。 この分析により、さまざまな遺伝子発現プロファイルがどのようにタンパク質発現をもたらすかについての洞察が得られ、どのタンパク質が上皮に直接由来し、どのタンパク質が血漿滲出の結果であるか、または異なる調節プロセスの根底にあるかがさらに明確になります。

アレルギー性鼻炎患者および健常対照者から、鼻粘液、鼻粘膜、および血清が得られる。 粘液トラップを備えた特殊な吸引装置により、粘膜に触れずに内視鏡下で中鼻道から鼻水を採取します。 鼻粘膜は、局所麻酔下で鼻ブラシを介して得られ、初代培養に入れられます。 血液サンプルから調製された血清。 草または木の花粉アレルギーの患者が含まれ、アレルギー状態は、皮膚プリックテストおよびRAST（Radio-Allergo-Sorbent-test）によって決定されます。 サンプルサイズの目標は、グループあたり15人の患者になります。 サンプルは、花粉シーズンの内外で取得されます。 アレルギー患者は症状スコアに記入し、症状が強いとき（花粉シーズン）と症状がなくなったとき（花粉シーズン外）にサンプルが採取されます。 健康なコントロールの場合、サンプル採取の時点は、アレルギー性鼻炎患者と相関して、同様の花粉曝露があります。 鼻粘液はプロテオミクス分析のための液体クロマトグラフィー タンデム質量分析に送られ、鼻上皮細胞から RNA が分離され、マイクロアレイ分析に送られます。 統合オミクスアプローチにより、遺伝子とタンパク質の発現が相関し、鼻粘液と上皮の間のクロストークが分析されます。 主要な遺伝子または遺伝子クラスターの同定は、アレルギー性鼻炎の新しい治療または診断戦略に役立つ可能性のあるバイオマーカーとしての主要なタンパク質またはタンパク質群のさらなる同定につながります。 統合的オミクスアプローチは、上皮遺伝子発現とそのタンパク質産物に焦点が当てられ、アレルゲン曝露と直接相関することなく非常に豊富に存在するタンパク質を除外するため、潜在的な候補を縮小します。血漿浸出を通して。 さらに、ゲノムおよびプロテオミクス解析により、粘液および上皮のバリアがアレルゲン曝露によってどのように影響を受けるかをより詳細に説明できます。 健康な対照群との比較とシーズンを通しての長期的な変化は、これらの個人がアレルゲン曝露に対してどのように反応し、これが感作の予防にどのようにつながるかをさらに明らかにします.