NBIA 遺伝子のテスト: シーケンスバリアントの因果関係を評価するための遺伝的不均一性の分析とミトコンドリアマーカーの検証。 (NBIA MITO)
脳の鉄の蓄積を伴う神経変性 (NBIA) は、遺伝的にも表現型的にも不均一な、まれな神経発達疾患のグループを表します。
診断は脳のMRIに基づいています。 また、遺伝子検査に基づいています。 しかし、異なる臨床症状の間に重複が存在し、分子診断が誤解される可能性があります。
より良い分子診断を得るためには、主に 2 つの目的に取り組む必要があります。一方、機能研究の助けを借りて、バリアントの有害な結果を検証または確認する必要があります。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
介入・治療
介入・治療
詳細な説明
脳の鉄の蓄積を伴う神経変性 (NBIA) は、遺伝的にも表現型的にも不均一な、まれな神経発達疾患のグループを表します。
診断は脳のMRIに基づいています。 大脳基底核、特に淡蒼球と黒質に異常な鉄の沈着が見られます。 また、遺伝子検査に基づいています。 ここで、10 の個別化されたフォームについて説明します。 ただし、異なる臨床症状の間には重複が存在し、分子的診断は、病原性の役割が証明されていない未知の意味のバリアントと呼ばれるバリアントのために誤解される可能性があります。 脳 MRI での鉄沈着物を伴う臨床的に関連する症例の約半分は、分子の有害な変化なしに残っています。
より良い分子診断を得るためには、主に 2 つの目的に取り組む必要があります。このパネルには新しい遺伝子が含まれ、より多くの遺伝子が特定されるにつれて拡大される可能性があります。 一方、機能研究の助けを借りて、バリアントの有害な結果を検証または確認する必要があります。
NBIA の病態生理には、鉄と脂質の代謝、ミトコンドリアの代謝、オートファジーの 4 つの主要な経路が関与しています。
ミトコドリオン内の生化学的メカニズムがこれらの 4 つの経路に関与していることを考慮して、研究者は患者の線維芽細胞から始まる最初のテストを実行し、文献を分析して、NBIA の生物学的マーカーとして適切なパラメーターを定義しました。
2つの異なるグループが研究されます:
- ボルドーの大学病院で現在使用されている遺伝子パネルの配列決定後、変異が見つからなかった NBIA 患者のグループ。 遺伝子検査は、16 の NBIA 遺伝子に適用される別の標的濃縮法を利用して実施されます。
- 識別されたバリアントを伴う 2 つの頻繁な NBIA の患者のグループを分析して、線維芽細胞からの最良のミトコンドリア マーカーを評価します。
研究者らは、神経変性を担当するフランスの希少疾患ネットワークとミトコンドリア病の診断に関与する「CARAMEL」ネットワークの支援を受けて、これらの新しい遺伝的および生化学的戦略を診断手順に移すことを計画しています。
研究の種類
研究の種類
入学 (実際)
入学
連絡先と場所
研究場所
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Talence、フランス
- Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- NBIA C19ORF12、PANK2、PLA2G6、DCAF17、FA2H、WDR45、FTL、CP、および ATP13A2 の遺伝子の病原性変異または遺伝子機能に影響を与える可能性のある変異 (ACMG 基準によるクラス 4 または 5) と診断された患者、およびその線維芽細胞診断手順中の機能分析のためにボルドー大学病院で収集されました
- これら9つの遺伝子のいずれについても決定的な検査を受けておらず、ボルドー大学病院での診断手順中にDNAが収集されたNBIA患者
除外基準:
- -画像(MRIまたはスキャン)のない患者 NBIAの徴候
- フランスの医療保険に加入していない患者
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:回顧
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
介入・治療介入・治療 |
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分子診断を受けずに残っているNBIA患者
分子診断を受けていない NBIA 患者 40 人のグループ
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専用のカスタム キャプチャとミディアム スループット シーケンス プロトコルを使用した、22 の遺伝子 (9 つの既知の遺伝子と 13 の新しい遺伝子) のパネルのシーケンス テスト。
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遺伝子変異が確認されたNBIA患者
遺伝子に変異を有する 2 つの頻繁な NBIA の患者のグループ (すでに CHU 分子診断研究所で研究されています)
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皮膚生検から得られた、培養中の線維芽細胞からのミトコンドリアマーカーの確立。
生化学的なミトコンドリアの変化を示す酵母モデルの確立: 欠失が致命的なパントテネートキナーゼ酵母遺伝子 Cab1 へのミスセンスバリアントの導入、それに続く発酵および呼吸媒体での変異株の増殖。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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専用のカスタム キャプチャとミディアム スループット シーケンス プロトコルを使用した 22 遺伝子パネルのシーケンス テスト。
時間枠:研究完了まで、平均2年
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カバレッジの記録 (設計された領域の%)
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研究完了まで、平均2年
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専用のカスタム キャプチャとミディアム スループット シーケンス プロトコルを使用した 22 遺伝子パネルのシーケンス テスト。
時間枠:研究完了まで、平均4年
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シーケンスの深さの記録 (リード数)
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研究完了まで、平均4年
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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患者の線維芽細胞における生化学的分析を用いた優性型の同定
時間枠:研究完了まで、平均2年
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電位依存性陰イオンチャネル (VDAC) 標識によるミトコンドリアのカウント
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研究完了まで、平均2年
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患者の線維芽細胞における生化学的分析を用いた優性型の同定
時間枠:研究完了まで、平均2年
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鉄欠乏および鉄負荷後の鉄およびフェリチン細胞レベルの測定
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研究完了まで、平均2年
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協力者と研究者
協力者
協力者
捜査官
捜査官
- 主任研究者:Patricia FERGELOT MAURIN、University Hospital, Bordeaux
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (実際)
一次修了
研究の完了 (実際)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- CHUBX 2017/38
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
米国で製造され、米国から輸出された製品。
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