希少腎臓病の個別診断プラットフォームの設立 (NIKE)
慢性腎臓病 (CKD) は重大な健康問題であり、発生率と有病率は着実に増加しており、真の「流行病」の脅威が高まっています。 収束した証拠は、希少腎臓疾患における遺伝的病因の有病率が高いことを示唆しており、新しい病気の原因となる遺伝子のリストは常に更新されています。 次世代シーケンス (NGS) 技術の最近の進歩により、希少腎疾患の診断が大幅に改善されました。 それにもかかわらず、NGS は、個別化された方法で臨床情報と遺伝情報を統合するために、遺伝学者、腎臓学者、生物情報学の共同の努力によって適切に分析する必要がある大量の情報を生成します。 さらに、一部の症例では、病原性の特徴を研究して理解し、個別の治療アプローチを提案するための病気の実験モデルの開発に研究者の貢献が不可欠であることが証明されています。 このような革新的で統合された診断パラダイムは、現在世界中のいくつかの施設で利用可能ですが、日常の臨床診療に簡単に導入することはできません。
この研究の目的は、統合診断アルゴリズムを構築し、希少腎臓病に対する最新の個別診断および治療戦略を、トスカーナ地方の 40 歳未満の腎臓病患者すべてに拡張することです。 このアルゴリズムは、参加センターと専門の学際的チーム間の継続的なクロストークに基づいています。 診断と治療の実績は欧州レベルで検証される予定です。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
介入・治療
介入・治療
研究の種類
研究の種類
入学 (推定)
入学
段階
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究場所
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Firenze、イタリア
- Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi
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Firenze、イタリア
- Meyer Children's Hospital IRCCS
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Firenze、イタリア
- USL Toscana Centro
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Pisa、イタリア
- Azienda Ospedaliero Universitaria Pisana
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準:
- 腎臓病の家族歴および/または親の血族関係;
- 腎外の関与(例、感音性難聴)。
- 治療(免疫抑制など)に対する抵抗性。
- 腎不全がない場合の代謝性アシドーシスまたは代謝性アルカローシス。
- 各腎臓における少なくとも 2 つの嚢胞性病変または腎石灰沈着の超音波検出。
- 腎臓と尿路の先天異常(CAKUT)およびKDIGO定義に基づくCKDステージ≧2の超音波検査
- インフォームドコンセントフォーム。
除外基準:
- 年齢 > 40
- 研究への参加を拒否する
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 主な目的:診断
- 割り当て:非ランダム化
- 介入モデル:並列代入
- マスキング:なし(オープンラベル)
アーム数
武器と介入
参加者グループ / アーム参加者グループ / アーム |
介入・治療介入・治療 |
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実験的:病原性変異
ACMGガイドラインおよび臨床表現型に基づくバイオインフォマティクスによる病原性の優先順位付け基準に適合する変異体、および文献ですでに報告されている変異体は、病原性変異として定義されます。
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患者は研究調整センターの遺伝カウンセリングに紹介されます。
これは最終的な遺伝子診断につながります。
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実験的:潜在的に病原性のある変異体
バイオインフォマティクスの優先順位付け基準には適合するが、明らかに臨床表現型と相関しておらず、これまで文献に報告されていないバリアントは、潜在的に病原性バリアントとして定義されます。
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患者とその家族は研究調整センターで徹底的な臨床再評価を受け、遺伝子検査結果(逆表現型検査)に基づいて疑わしい疾患の診断ハンドルを特定します。
臨床的再評価には、追加の臨床検査や機器検査の実施、その他の専門的な相談が含まれる場合があります。
これにより、かなりの割合の症例で最終的な遺伝子診断が行われ、その後、遺伝カウンセリングが受けられることになります。
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実験的:重要性不明の変異体 (VUS)
表現型には適合するが、バイオインフォマティクスの優先順位付け基準には適合しないバリアントは、臨床的意義が不確かなバリアント (VUS) として定義されます。
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研究者らは、臨床表現型の決定における変異体の役割を確立するために、尿由来腎前駆細胞 (u-RPC) による機能評価を実施します。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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遺伝子診断の検証
時間枠:登録(遺伝子検査)から遺伝子検査結果返却日まで(最長6ヶ月)
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研究者らは、患者の再評価(リバースフェノタイピング)や体外機能研究によって最終的な遺伝子診断を決定する際に、潜在的な病原性バリアントおよび臨床的意義が不明瞭なバリアント(VUS)の役割を評価する予定である。 詳細には、ESの結果後、学際的なチームが配列決定の結果を評価し、最終的には患者および/または家族に追加の調査(臨床検査または画像検査、具体的な相談など)を要求して、以下のことを行います。 ES(リバースフェノタイピング)によって示唆される、これまで検出されなかった/見落とされていた遺伝性疾患の兆候。 u-RPC に関する in vitro 機能研究は、患者のサブセットに対して要求されます。 これらの戦略を通じて最終的な診断が得られた患者の数は、ワークフロー全体の診断率 (最終的な遺伝子診断の数 / 研究に登録された患者の数) に寄与します。 |
登録(遺伝子検査)から遺伝子検査結果返却日まで(最長6ヶ月)
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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分子経路の同定
時間枠:登録 (遺伝子検査) から最後の患者の最後の来院まで、推定最大 12 か月
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研究者らは、潜在的に病原性変異を保有する選択された患者において、潜在的な治療標的となる可能性のある分子経路を特定することを目的としている。 この目標を達成するために、研究者らは、診断用腎生検を受けた患者の腎生検断片に対して単一細胞 RNA シーケンスを実行します。 潜在的に病原性変異を保有する個々の細胞の細胞内トランスクリプトームを取得した後、研究者らは、それらのRNA発現プロファイルを、変異していない患者から得られた同じ種類の細胞と比較します。 |
登録 (遺伝子検査) から最後の患者の最後の来院まで、推定最大 12 か月
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希少腎疾患における遺伝子編集の適用可能性を探る
時間枠:登録 (遺伝子検査) から最後の患者の最後の来院まで、推定最大 12 か月
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研究者らは、病原性突然変異を有する患者から得られたu-RPCを通じて、希少腎疾患におけるCRISPR/Cas9遺伝子編集の適用可能性を探求する予定である。 疾患の原因となる変異の救済を達成するために、研究者らは、病原性変異を保有する患者から分離されたu-RPCにおいて、CRISPR/Cas9遺伝子編集アプローチを通じて同定された遺伝的変異の安定した補正を実行する予定である。 |
登録 (遺伝子検査) から最後の患者の最後の来院まで、推定最大 12 か月
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (実際)
一次修了
研究の完了 (推定)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- NIKE
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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