イタリアにおける新生児エンテロウイルス感染症：エコーウイルス11のウイルス学的特徴、ゲノム解析、および臨床・疫学的知見 (Entero-Neo)

ピコルナウイルス科に属するエンテロウイルス属は、正の極性を持つ一本鎖RNAウイルスで、エンテロウイルス（EV、コクサッキーウイルス、エコーウイルス、ポリオウイルスを含む）A-J種とライノウイルス（RV）A-C種に分類され、200以上の異なる遺伝子型が報告されています。 エンテロウイルスは世界的に広がっており、通常は自己制限的で、乳幼児や小児集団に広く見られる発熱性、胃腸性、および発疹性疾患の一般的な原因です。 しかし、時折、髄膜脳炎、脊髄炎、麻痺、心筋炎、敗血症、重度の呼吸器症候群、急性肝炎などの重篤な疾患を引き起こすことがあります。 呼吸器経路で感染し、温帯地域では夏から初秋にかけて発生することがほとんどです。 エンテロウイルスは、高い変異率（校正活性を持たないRNA依存性RNAポリメラーゼの存在による）と組み換えイベントの高い確率によって決定される急速な進化を特徴とします。 後者、特に型間組み換えは、エンテロウイルスの進化過程において重要な役割を果たし、病原性や流行の可能性が高い株の出現の主要な原因として認識されていますが、関連する遺伝的決定因子は現在まで知られていません。 2022年7月から2023年4月にかけて、フランスで新生児エコーウイルス11（E-11）感染症の9例が報告され、重度の肝不全と神経および心筋の関与があり、うち7例は致命的な結果に終わりました。 これらの報告を受け、世界保健機関（WHO）は警告を発し、イタリア、スペイン、クロアチア、英国でさらなる症例が迅速に特定されました。 EV感染症は体系的な監視の対象ではないため、これらの感染症に関連する実際の疾病負担に関するデータが不足しています。 したがって、EV感染症は過小評価されており、さらに、そのタイピングに関するデータは不足しています（存在しない場合さえあります）。これには、通常、臨床微生物学的診断検査室では日常的に実施されない二次レベルの分析が含まれ、入手が稀で、欧州レベルでも体系的に収集されていません。 このため、一般的なEV感染症、特にE-11の影響や、最も重篤な症例および最も重要な感染経路に関連するリスク要因を推定することが不可能です。 さらに、感染に対する免疫学的および炎症性反応の特性はまだ定義されていません。 これらの要素があれば、特定の症例定義を策定し、迅速な実験室確認と疾患の認識を確保することが可能です。 プロジェクトの提案された目標の範囲内で、以下の活動を通じて、新生児におけるエンテロウイルス感染症の拡散と影響に関する知識を強化し、特にE-11に焦点を当てる：全国的な適用可能性を持つ疫学的およびゲノム監視システムの設計とパイロット実施（概念実証）; ウイルスの病原性特徴の分子特性評価; 重度のEV疾患（E-11を含む）に関連する可能性のある免疫学的マーカーと宿主リスク因子の探索。

特定の目標

1. 新生児ユニットおよび新生児集中治療室におけるスクリーニング活動のプロトコルを実施および検証し、EVによる感染の存在を確認し、特にE-11に注意を払いながら感染の重症型を特定することを目的とします。
2. 特定目標1で実施された活動内で特定されたEV株を特徴づけ、次世代シーケンシング（NGS）アプローチを使用して全ゲノム配列を取得し、可能な組み換え型を特定します。 得られた配列を主要な国際データベースに登録された配列と比較して系統解析を行い、変異株またはゲノム内の特定の変異に遡ることができるゲノムを定義します。