全ゲノム配列の連続N-of-1計算実現可能性研究 (B2026N1)
全ゲノム配列の決定論的生物エネルギーシミュレーションによる自動仮説生成:連続N-of-1計算可能性研究
これは、単一の成人参加者から以前に収集された全ゲノムシーケンシング(WGS)データを使用して、決定論的生体エネルギーシミュレーションモデルの実現可能性を評価する、観察的・計算的N-of-1研究です。 この研究には臨床的介入、治療、または前向きの試料収集は含まれません。 すべての分析は、安全な計算環境内で既存のゲノムデータに対して行われます。
この研究の目的は、物理ベースの代謝モデルが個々のゲノム制約を統合して、代謝経路に関する個別化された仮説駆動型の洞察を生成できるかどうかを判断することです。 この研究は、臨床結果ではなく、モデルの実現可能性と計算性能に焦点を当てています。 薬物、食事、または行動介入は実施または評価されません。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
詳細な説明
このプロトコル(B-2026-N1)は、Bioactify LLCおよびWhat Ifs Tech Inc.が実施する継続的観察型N-of-1計算実現可能性研究について記載しています。 本研究では、単一の成人参加者から商業的に取得された30x全ゲノムシーケンシング(WGS)の二次データを使用します。 研究目的で新たなデータは収集されず、臨床的介入は行われません。
主目的は、静的ゲノム制約をフラックスバランス分析(FBA)および動的生理学的モデリングを組み込んだ決定論的シミュレーションエンジンに統合する実現可能性を評価することです。 この計算フレームワークは、個々の遺伝的変異が代謝経路の挙動にどのように影響するかを探るために設計されています。 すべての分析は、既存データを使用した分離されたクラウド環境内で行われます。
本研究は観察的かつ探索的なものです。 いかなる治療、食事、薬剤、またはデバイスの安全性、有効性、臨床的有用性を評価するものではありません。 この研究は、個別化計算モデリングと仮説生成に関する方法論的知見を生み出すことを目的としています。
本研究は、既存データの二次利用のみを含み、人間の被験者との相互作用や介入がないため、45 CFR 46.104(d)(4)に基づきPearl IRBから免除研究決定を受けました(プロトコルID:2026-0119)。
研究の種類
研究の種類
入学 (実際)
入学
連絡先と場所
研究場所
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New York
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Wappingers Falls、New York、アメリカ、12590
- Bioactify LLC
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
成人女性参加者、45歳
- 事前に収集された30x全ゲノムシーケンシング(WGS)データを保有している
- 計算分析に必要な自己申告による表現型および生活習慣情報を提供可能である
- 自主的な観察研究であるN-of-1研究に参加する意思がある
除外基準:
- なし
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
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単一参加者
このコホートには、以前に収集された全ゲノムシーケンス(WGS)データが計算分析に使用される単一の成人参加者が含まれます。
介入、治療、または臨床的手順は実施されません。
すべての分析は観察的であり、二次データのみに基づいています。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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決定論的インシリコ代謝フラックスシミュレーションの実現可能性
時間枠:3か月
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二次的30x全ゲノムシーケンシング(WGS)データが、フラックスバランス分析(FBA)と動的生理学的モデリングを組み込んだ決定論的計算フレームワークによって、正常に取り込まれ処理できるかどうかを評価します。
実現可能性は、システム障害、データ破損、計算不安定性なしにシミュレーションを実行できる能力によって定義されます。
この結果は計算性能のみを評価し、臨床的エンドポイントは評価しません。
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3か月
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ヤコビアン感度アトラスの生成
時間枠:3ヶ月
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シミュレーションエンジンが、静的ゲノム入力のみに基づいて潜在的な酵素または輸送制約を特定する微分可能な感度アトラスを正常に生成できるかどうかを評価します。
この結果は、臨床的または診断的解釈ではなく、アルゴリズム出力の品質と計算安定性を評価します。
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3ヶ月
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協力者と研究者
捜査官
捜査官
- 主任研究者:Esther Cashbaugh、Bioactify LLC
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (推定)
一次修了
研究の完了 (推定)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- B-2026-N1
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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