肝硬変患者における肝細胞癌の研究 (CIRCE ProSpec)

このプロジェクトは、肝細胞癌を有する肝硬変患者 (200 例) と肝細胞癌を有さない肝硬変患者 (対照 400 例) を含む症例対照研究に基づいています。 プロテオミクスまたは分光学的研究におけるサンプルサイズの決定は、高次元設定に適応させる必要があります。 プロテオミクス解析は、ディジョンの Clinical Innovation Proteomic Platform によって実施されます。 プロテオミクス研究では 2 つのアプローチが使用されます。 以前の研究に関するこの研究の特殊性は次のとおりです。サブプロテオームを精製するために使用される手順 (枯渇分画と精製を含む 5 つの自動化された方法が適用されます)、品質管理の導入による生成されたデータの認定、多数研究に含まれるサンプルの。 2 番目のアプローチである BIA-MS (生体分子相互作用分析質量分析法) は、ターゲットを絞ったアプローチであり、タンパク質の捕捉、定量化、および特徴付けを可能にします。

品質管理により、さまざまな変動源を定量化し、生物学的変動が技術的変動よりも高いことを検証できます。 すべてのサンプルは同じプロトコルで処理および分析されます。100 サンプルを使用してマーカーを検証し、最初の 500 サンプルの分析後に統計モデルを作成します。 赤外線分光分析は、ランス大学の CNRS UMR 6237 である MéDIAN チームによって実施されます。 特徴選択参照スペクトル後の最初の 300 サンプルは、パターン認識の多変量統計プロセス、ニューラル ネットワーク、サポート ベクター マシン、ケースベースの分類または機械学習の方法、遺伝的アルゴリズム、または進化的プログラミングの方法。 サンプルの 2 番目のセット (300) の分析は、開発されたさまざまな数学的分類方法を検証します。

グローバル研究では、研究者はプロテオミクス、分光、代謝/栄養データ間の関係を解明します。 これらの関係の説明では、より一般的な範囲で正規分析とマルチブロック分析を使用します。 これらの方法の目的は、同じ個人セットで観測された量的変数のいくつかのグループ間に存在する可能性のある関係を調査することです。