肝硬化患者肝细胞癌的研究 (CIRCE ProSpec)

该项目基于一项病例对照研究，包括伴有（200 例）和未伴有（400 例对照）肝细胞癌的肝硬化患者。 蛋白质组学或光谱学研究中样本量的确定必须适应高维环境。 蛋白质组学分析将由第戎的临床创新蛋白质组学平台进行。 蛋白质组学研究将使用两种方法：一种基于比较质谱分析 (MALDI-TOF) 后获得的蛋白质组光谱图的全局方法。 本研究相对于以往研究的特殊性在于：用于纯化亚蛋白质组的程序（将应用五种自动化方法，包括耗尽分馏和纯化），通过引入质量控制对生成的数据进行鉴定，大量样本包括在研究中。 第二种方法 BIA-MS（生物分子相互作用分析质谱法）是一种靶向方法，可以捕获、量化和表征蛋白质。

质量控制允许量化各种可变性来源并验证生物可变性高于技术可变性。 所有样品都将使用相同的方案进行处理和分析，100 个样品将用于验证前 500 个样品分析后开发的标记和统计模型。 红外光谱分析将由兰斯大学的 MéDIAN 团队，CNRS UMR 6237 进行。 特征选择参考谱后的前300个样本，通过模式识别的多元统计过程、神经元网络、支持向量机和基于案例分类或机器学习的方法、遗传算法或进化规划的方法。 第二组样本 (300) 的分析将验证开发的不同数学分类方法。

在全球研究中，研究人员将阐明蛋白质组学、光谱学和代谢/营养数据之间的关系。 这些关系的描述将在更一般的范围内使用规范分析和多块分析。 这些方法的目标是探索在同一组个体上观察到的几组定量变量之间可能存在的关系。