小児急性白血病の日常診断における革新的技術の導入：マイクロアレイによるゲノムとトランスクリプトームの解析

急性白血病は、リンパ球系または骨髄系を起源とする骨髄内の細胞クローンの異常な増殖を特徴とする、不均一な悪性腫瘍群です。 白血病の形質転換を決定する変異のレパートリーは、腫瘍の種類や病気の進行に応じて複雑かつ多様であり、同じ細胞内でバランスの取れた染色体異常とアンバランスな染色体異常、点変異、エピジェネティックな異常が組み合わされています。

ここで紹介するプロジェクトは、小児の血液悪性腫瘍の診断に対する包括的なアプローチの一部です。 マイクロアレイ (またはアレイ CGH) での比較ゲノム ハイブリダイゼーションとマイクロアレイによるトランスクリプトーム解析を使用する、ゲノムとトランスクリプトームの包括的な解析のための 2 つの革新的な技術は、分子欠陥を特定する新しい視点を提供します。 これらの技術は、診断時に急性白血病を特定する際に新しい要素を提供し、患者のケアを最適化するための新しい予後因子を特定する可能性があります。

このプロジェクトには、医療遺伝学部門（教授、教授）の両方が関与しています。 N. LEVY ）は小児白血病に関連するゲノム異常の同定に関して、ラ・ティモーネ病院の血液学研究室（ピエール・モランジュ教授）は腫瘍細胞の表現型の特徴付けに関して、そして腫瘍血液学小児科部門（教授）は。 Michel Gerard ) は、血液悪性腫瘍の小児の診断、治療、モニタリング、および骨髄の提供を行っています。 次のプロジェクトは、主にゲノム異常 (欠失と重複) と遺伝子発現の異常を特定して、さまざまなリスク グループ内でのより適切な分類を保証する遺伝的プロファイルを特定することに焦点を当てています。

私たちが提案するプロジェクトは、ゲノム異常の同定、ゲノムの特定領域のコピー数の変化またはヘテロ接合性の喪失の決定、および比較ゲノムハイブリダイゼーションという 2 つの分析技術を使用した遺伝子発現レベルの変化の同定を中心としています。マイクロアレイ (またはアレイ-CGH) およびマイクロアレイを使用した発現研究について。 生成されたデータは、「分子サイン」の同定、予後、治療反応および生存の変動に応じた患者の分類に使用されます。

このプロジェクトの独創性は、小児の血液悪性腫瘍の診断にこれらの新しいツールを使用することにあります。 このパイロット研究は市販のAffymetrixを使用して実施され、白血病発生に関与する遺伝子に対応する専用の濃縮プローブを「処理」し、これらのサインを識別する際に高い識別力を備えたチップを開発する予定です。

大規模な一連の患者の研究から専門文献に発表されたデータは、マイクロアレイが患者の診断と治療管理に重要な情報を提供することを示しています。 このような理由から、最終的には異常細胞白血病の特徴をさらに明らかにし、「白血病の識別カード」を確立するために、これらの分析を日常的な診断に統合して他の分析（表現型解析、融合遺伝子の同定、配列決定）を補完したいと考えています。