Implementação de Técnicas Inovadoras no Diagnóstico Rotineiro da Leucemia Aguda Infantil: Análise do Genoma e Transcriptoma por Micro-array

As leucemias agudas são um grupo heterogêneo de neoplasias caracterizadas pela proliferação anormal de um clone celular na medula óssea, tendo como origem a linhagem linfocítica ou mieloide. O repertório de mutações que determinam a transformação leucêmica, complexo e variável dependendo do tipo de tumor e progressão da doença, combinado na mesma célula de aberrações cromossômicas balanceadas e desbalanceadas, mutações pontuais e anormalidades epigenéticas.

O projeto aqui apresentado faz parte de uma abordagem abrangente para o diagnóstico de neoplasias hematológicas de crianças. Usando hibridização genômica comparativa em microarray (ou array-CGH) e análise de transcriptoma por microarray, duas técnicas inovadoras para uma análise abrangente do genoma e transcriptoma, oferecem novas perspectivas identificando defeitos moleculares. Essas técnicas fornecem novos elementos na identificação da leucemia aguda no momento do diagnóstico, podendo identificar novos fatores prognósticos para otimizar o cuidado dos pacientes.

Este projeto envolve tanto o Departamento de Genética Médica (Prof. N. LEVY ) para a identificação de anomalias genômicas associadas à leucemia infantil , o Laboratório de Hematologia do Hospital de la Timone ( Prof. Pierre Morange ) para a caracterização fenotípica das células tumorais e o Departamento de Onco-Hematologia Pediátrica (Prof. . Michel Gerard) que fornece diagnóstico, tratamento, monitoramento e medula óssea de crianças com neoplasias hematológicas. O seguinte projeto é focado principalmente na identificação de anormalidades genômicas (deleções e duplicações) e anormalidades na expressão gênica para identificar um perfil genético garantindo uma melhor classificação dentro dos diferentes grupos de risco.

O projeto que propomos está centrado na identificação de anormalidades genômicas , alterando o número de cópias de certas regiões do genoma ou determinando perda de heterozigosidade , e na identificação de alterações no nível de expressão gênica por meio de duas técnicas analíticas , hibridização genômica comparativa em microarray (ou array-CGH) e estudos de expressão com microarrays. Os dados gerados permitirão, para a identificação de “assinaturas moleculares”, a classificação dos pacientes quanto ao prognóstico, variações na resposta ao tratamento e sobrevida.

A originalidade deste projeto reside na utilização destas novas ferramentas no diagnóstico de neoplasias hematológicas em crianças. Este estudo piloto, que será realizado com a Affymetrix comercial, desenvolverá os chips 'processadores', dedicados, enriquecidos com sondas correspondentes a genes envolvidos na leucemogênese, com alto poder discriminatório na identificação dessas assinaturas.

Os dados publicados na literatura especializada a partir do estudo de grandes séries de pacientes mostram que os microarrays fornecem informações importantes para o diagnóstico e conduta terapêutica dos pacientes. É por esta razão que esperamos no final integrar estas análises no diagnóstico de rotina para complementar outras análises (fenotipagem, identificação de genes de fusão e sequenciação) de forma a caracterizar ainda mais as células anormais da leucemia e estabelecer uma “carteira de identidade da leucemia”.