プロジェクト A3sc - 単一細胞レベルでの気道のアトラス (AAAsc)

慢性呼吸器疾患の発生率の増加は、子供を含む世界中の何十万もの人々に影響を与える公衆衛生上の問題です。 大気汚染物質 (汚染物質、アレルゲン) に直接さらされる気道は、周囲の結合組織だけでなく、豊富な免疫環境や微生物叢との複雑な相互作用を発達させるさまざまな細胞を含む複雑な生態系を表しています。 アレルギー疾患などの特定の疾患では、鼻と気管支の気道の間に病態生理学的な連続体が仮定されていますが、鼻と気管支のサンプル間の遺伝子発現に幅広い勾配があることを確認しました。 これが、呼吸ツリー全体の細胞変動を詳細に研究する必要がある理由です。

特定の細胞に特異的に存在する RNA の配列決定、および隣接細胞との比較により、正確な細胞の寄与と細胞間の関係を文書化することができます。 私たちのプロジェクトでは、単一細胞レベルでの遺伝子発現プロファイルの分析 (単一細胞 RNA シーケンス) を可能にする条件下で、ブラッシングおよび/または生検によって気道スワブを安定させるためのプロトコルを確立します。

「単一細胞」の安定化および分析プロトコルの開発は、まず初代呼吸器上皮培養で行われ、次に健康なボランティアから採取された呼吸器標本に拡張されます。 呼吸樹のいくつかのレベルでサンプリングすることにより、気管気管支軸に沿った発現の変動が完全に文書化されます。 最後に、上皮コンパートメントと免疫学的コンパートメントの間の相互作用は、さまざまな生理病理学的状況における単一細胞の遺伝子発現を分析することによって研究されます。