Projekt A3sc – A légutak atlasza egysejtszinten (AAAsc)

A krónikus légúti megbetegedések növekvő előfordulása népegészségügyi probléma, amely emberek százezreit érinti szerte a világon, beleértve a gyermekeket is. Közvetlenül légköri aeroszennyező anyagoknak (szennyezés, allergének) kitéve a légutak egy összetett ökoszisztémát képviselnek, amely különböző sejtekből áll, amelyek komplex kölcsönhatásokat alakítanak ki a környező kötőszövettel, de gazdag immunkörnyezetükkel és a mikrobiótával is. Bár bizonyos betegségekben, például allergiás betegségekben patofiziológiai kontinuum feltételezhető a nazális és a hörgő légutak között, a génexpresszióban széles gradienseket azonosítottunk az orr- és hörgőminták között. Ezért kell részletesen tanulmányozni a sejtes variabilitást a légzőfán keresztül.

Az egy adott sejtben specifikusan jelenlévő RNS-ek szekvenálása és a szomszédos sejtekkel való összehasonlítása lehetővé teszi számunkra, hogy pontosan dokumentáljuk a sejtek hozzájárulását és az intercelluláris kapcsolatokat. Projektünk protokollokat hoz létre a légúti tamponok fogmosással és/vagy biopsziával történő stabilizálására olyan körülmények között, amelyek lehetővé teszik a génexpressziós profilok egysejtszintű elemzését (egysejtes RNS szekvenálás).

Az "egysejtes" stabilizációs és elemzési protokoll kidolgozását először primer légúti hámtenyészeteken hajtják végre, majd kiterjesztik az egészséges önkéntesektől vett légúti mintákra. A légzőfa több szintjén végzett mintavétellel teljes mértékben dokumentálható lesz az expresszió változása a tracheobronchiális tengely mentén. Végül az epiteliális kompartment és az immunológiai kompartment közötti kölcsönhatást egyetlen sejt génexpressziójának elemzésével vizsgáljuk különböző fiziopatológiai összefüggésekben.