診断上の緊急事態における「迅速な」ハイスループットのゲノム配列解析の診断的価値の研究 (FASTGEN)

希少疾患（罹患率は 2,000 人に 1 人未満）は、公衆衛生上の主要な問題です。 フランスには約 8,000 の希少疾患があり、300 万人以上が罹患しています。 これらの病気のほとんどは小児で診断され、5 歳未満の死亡の 10% はこれらの病気によって引き起こされます。これらの病気の最大 80% は遺伝的起源であると考えられています。 個人のゲノム全体の研究を可能にする新世代のハイスループットシークエンシング（HTS）技術が、希少疾患の研究に最適なツールとして近年登場しました。 私たちのチームは、小児患者の重篤な疾患、発達異常、知的障害の診断におけるエクソームシーケンス（ES: 全ゲノムサイズの1%に相当する全コード領域（エクソン））の価値をフランスで初めて実証しました。

ES は遺伝性疾患の診断における大きな進歩を表していますが、明確な臨床診断がなく、CGH 配列が正常な患者の症例の約 30% にのみ貢献する結果が得られます。 全ゲノム (GS) の配列決定は、点変異、CNV、および構造変異の同時同定により、遺伝病の原因を研究する能力の向上を約束し、50 ～ 60% の診断率が期待されます。 一部の国際チームはすでに希少疾患の診断に GS を導入していますが、新生児期の緊急事態でのトリオ GS の使用を報告しているのは 2 つのチームだけであり、第一選択の診断用途の歩留まりは低くなります (それぞれ 31 および 42%)。 したがって、診断、早期発見、または新生児蘇生や小児神経学的苦痛などの急速に進行する緊急事態への GS の導入を検討する前に、これらの予備的な結果を他の研究と比較することが不可欠です。