Estudio del valor diagnóstico del análisis de secuenciación del genoma de alto rendimiento "rápido" en situaciones de diagnóstico de emergencia (FASTGEN)

Las enfermedades raras (que afectan a menos de una de cada 2000 personas) son un importante problema de salud pública. Hay unas 8.000 enfermedades raras y afectan a más de 3 millones de personas en Francia. La mayoría de estas enfermedades se diagnostican en niños, y son responsables del 10% de las muertes antes de los 5 años. Se cree que hasta el 80% de estas enfermedades son de origen genético. Las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento (HTS) de nueva generación, que permiten el estudio del genoma completo de un individuo, han surgido en los últimos años como una herramienta de elección para el estudio de enfermedades raras. Nuestro equipo fue el primero en Francia en demostrar el valor de la secuenciación del exoma (ES: todas las regiones codificantes (exones), que representan el 1 % del tamaño total del genoma) en el diagnóstico de enfermedades graves en pacientes pediátricos, anomalías del desarrollo y discapacidad intelectual.

Aunque representa un avance significativo en el diagnóstico de enfermedades genéticas, la EE proporciona un resultado contribuyente en solo alrededor del 30 % de los casos en pacientes sin un diagnóstico clínico evidente y con una matriz de CGH normal. La secuenciación del genoma completo (GS) promete mejorar la capacidad de estudiar las causas de las enfermedades genéticas, con una tasa de diagnóstico esperada del 50 al 60 % a través de la identificación concomitante de variaciones puntuales, CNV y variaciones estructurales. Si bien algunos equipos internacionales ya han implementado GS en el diagnóstico de enfermedades raras, solo dos equipos reportan el uso de trio GS en situaciones de emergencia en el período neonatal, con un rendimiento bajo para uso diagnóstico de primera línea (31 y 42% respectivamente). Por lo tanto, es esencial que estos resultados preliminares se comparen con otros estudios antes de considerar el despliegue de GS en situaciones de diagnóstico, detección temprana o emergencia de rápida evolución, como la reanimación neonatal o el sufrimiento neurológico pediátrico.