Estudo do valor diagnóstico da análise "rápida" de sequenciamento de genoma de alto rendimento em situações de emergência diagnóstica (FASTGEN)

As doenças raras (que afetam menos de uma em cada 2.000 pessoas) são um importante problema de saúde pública. Existem cerca de 8.000 doenças raras e afetam mais de 3 milhões de pessoas na França. A maioria dessas doenças é diagnosticada em crianças, sendo elas responsáveis ​​por 10% das mortes antes dos 5 anos de idade. Acredita-se que até 80% dessas doenças sejam de origem genética. As tecnologias de sequenciamento de alta produtividade (HTS) de nova geração, que permitem o estudo de todo o genoma de um indivíduo, surgiram nos últimos anos como uma ferramenta de escolha para o estudo de doenças raras. Nossa equipe foi a primeira na França a demonstrar o valor do sequenciamento do exoma (ES: todas as regiões codificantes (exons), representando 1% do tamanho total do genoma) no diagnóstico de doenças graves em pacientes pediátricos, anomalias de desenvolvimento e deficiência intelectual.

Embora represente um avanço significativo no diagnóstico de doenças genéticas, a ES fornece resultado contributivo em apenas cerca de 30% dos casos em pacientes sem diagnóstico clínico óbvio e com CGH-array normal. O sequenciamento de todo o genoma (GS) promete melhorar a capacidade de estudar as causas de doenças genéticas, com uma taxa de diagnóstico esperada de 50 a 60% por meio da identificação concomitante de variações pontuais, CNVs e variações estruturais. Enquanto algumas equipes internacionais já implementaram o GS no diagnóstico de doenças raras, apenas duas equipes relatam o uso do trio GS em situações de emergência no período neonatal, com baixo rendimento para uso diagnóstico de primeira linha (31 e 42%, respectivamente). Portanto, é essencial que esses resultados preliminares sejam comparados com outros estudos antes de considerar a implantação do GS em diagnóstico, detecção precoce ou situações de emergência de evolução rápida, como reanimação neonatal ou sofrimento neurológico pediátrico.