진단 응급 상황에서 "신속한" 고처리량 게놈 시퀀싱 분석의 진단적 가치에 관한 연구 (FASTGEN)

희귀 질환(2,000명 중 1명 미만에 영향을 미침)은 주요 공중 보건 문제입니다. 약 8,000개의 희귀 질병이 있으며 프랑스에는 300만 명이 넘는 사람들이 앓고 있습니다. 이러한 질병의 대부분은 어린이에게서 진단되며 5세 이전 사망의 10%를 차지합니다. 이러한 질병의 최대 80%는 유전적 기원으로 여겨집니다. 개인의 전체 게놈을 연구할 수 있는 차세대 고처리량 시퀀싱(HTS) 기술은 최근 몇 년 동안 희귀 질환 연구를 위한 선택 도구로 등장했습니다. 우리 팀은 소아 환자, 발달 이상 및 지적 장애의 심각한 질병 진단에서 엑솜 시퀀싱(ES: 전체 게놈 크기의 1%를 나타내는 모든 코딩 영역(엑손))의 가치를 프랑스에서 처음으로 입증했습니다.

ES는 유전 질환의 진단에서 상당한 발전을 나타내지만 명백한 임상 진단이 없고 정상적인 CGH-배열을 가진 환자의 경우 약 30%에서만 기여하는 결과를 제공합니다. 전체 게놈(GS)을 시퀀싱하면 점 변이, CNV 및 구조적 변이를 동시에 식별하여 예상 진단률이 50~60%로 유전 질환의 원인 연구 능력을 향상시킬 수 있습니다. 일부 국제 팀은 이미 희귀 질환 진단에 GS를 구현했지만 신생아기의 응급 상황에서 트리오 GS를 사용했다고 보고한 팀은 두 팀뿐이며 1차 진단용으로 낮은 수율(각각 31% 및 42%)을 보였습니다. 따라서 진단, 조기 발견 또는 신생아 소생술 또는 소아 신경학적 고통과 같이 빠르게 진화하는 응급 상황에서 GS의 배치를 고려하기 전에 이러한 예비 결과를 다른 연구와 비교하는 것이 필수적입니다.