TITinopathyが疑われるMYOpathy患者における診断および表現型遺伝子型相関研究の改善 (DIAMYOTIT)
調査の概要
詳細な説明
チチノパシーは、サルコメアの巨大な弾性タンパク質であるタイチンの変化による遺伝性の骨格および心臓のミオパシーです。 次世代シーケンシング (NGS) が広く使用されているため、タイチン遺伝子 (TTN) は神経筋障害 (NMD) の主要な原因遺伝子として浮上しており、臨床的および対立遺伝子の異質性が高い。 チチノパシーの表現型の変動性および劣性または優性の遺伝様式の根底にあるメカニズムはよくわかっていません。 それらは、サルコメアの形成と安定性、および他のタンパク質との相互作用に関するタイチンの原始的な構造機能に関与しています。 TTN におけるバリアントの影響は、可変、サイレント、劣性、または優性であり、バイオインフォマティクス ツールは、それらの機能的影響を解釈するのに実際には効率的ではないため、解釈が非常に困難です。 さらに、TTNバリアントは一般集団で非常に頻繁に発生します。 タイチンの巨大なサイズ (3700kD) と複雑さのために、転写産物とタンパク質に対する TTN バリアントの結果の分析は一般的に行われていません。 国際社会には、診断テストとしてタイチンのウェスタンブロット (WB) 分析を提案するチームはほとんどありませんが、フランスにはチームがありません。 さらに、この検査では、まれな状況である切断型変異による劣性チチノパチーの診断のみを確認できます (
このプロジェクトは、当社の NGS 診断結果に基づいており、進行中の AFM 資金提供プロジェクト (アプリケーション 19958) の継続となります。 NGS によって、骨格性ミオパシー (心筋症の有無にかかわらず) の患者で、TTN バリアントを引き起こす可能性のあるいくつかの疾患を特定しました。 AFM が資金提供したプロジェクトのおかげで、いくつかの TTN バリアントがスプライシングに及ぼす影響を分析し、現在、タイチン WB を実行するための実験条件を実装しています。 さらに、病原性が疑われる TTN のほとんどの非切断変異体は、ミオシン重鎖 (MHC) と相互作用するタイチン ドメインに位置することを観察しました。 それらがサルコメアにおけるタイチンと MHC 間の相互作用の安定性に有害な影響を与える可能性があるという仮説では、タイチン-ミオシン相互作用におけるそれらの結果を評価する機能テストを実施する予定です。
現在のプロジェクトの具体的な目的は、診断アプローチを改善し、遺伝様式と表現型との相関研究を行うために、転写産物とタンパク質に対するTTNバリアントの影響を評価する機能研究を実施することです。 このプロジェクトの革新的な側面は、RNA (患者の骨格筋におけるタイチン転写産物の転写および/またはスプライシングに対する影響の評価)、タンパク質 (タイチン量に対するすべての TTN バリアントの影響の評価) に対するいくつかの分子的および生化学的アプローチの組み合わせです。およびサイズ、筋肉生検のWB分析による)およびタンパク質間相互作用(MHCとの相互作用に対するタイチン-MHC相互作用ドメインにあるTTNバリアントの病原性影響の評価)、学術研究プロジェクトで報告された技術に基づいて実装します. 私たちのプロジェクトの強みは、神経内科医、神経小児科医、病理学者、その他の生物学的専門家との強力なネットワーク、NMDs の地域間参照センターおよびチチノパシーの全国ネットワーク内の組織内にもあります。神経学者 (Dr Morales) の博士論文を通じて、表現型と遺伝子型の相関研究を実施しました。
TTN 遺伝子で同定されたバリアントの機能研究は、患者の診断に強い影響を与えるはずであり、それはその管理と家族の遺伝カウンセリングにとって重要です。 実装されたテストは、フランスのチチノパシー ネットワークで利用できるようになります。 これは、明確な診断のない多数の患者の診断を解決し、ミオパシーにおけるチチノパチーの関与の頻度を特定するはずです。 チチノパシーの診断の改善は、反復的な診断テストによるコストを削減するため、社会経済的な影響が大きくなります。
表現型と遺伝子型の相関研究により、チチノパシーの変異と臨床スペクトルを拡大し、チチノパシーの分子基盤を理解するための国際的な取り組みに参加することができます。これは、治療アプローチを考案するための必須の最初のステップです。 さらに、遺伝子の確認により、患者の組織に由来するチタン症の細胞モデルを開発する道が開かれます。 これらのモデルは、チチノパフィのメカニズムを解読し、薬理学的治療の標的となる可能性のある代謝経路を指摘するためのプロテオミクスおよびその他の機能研究の基礎となります。
これらの理由から、本出願は、チチノパシーの診断および分子基盤の知識に貢献するための、主要で独創的かつ革新的な開発を構成する。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Mireille COSSEE, MCU PH
- 電話番号:04 11 75 98 63
- メール:mireille.cossee@inserm.fr
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Fanny CARDON
- メール:fanny-cardon@chu-montpellier.fr
研究場所
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-
-
Montpellier、フランス、34090
- 募集
- CHU Montpellier
-
コンタクト:
- mireille COSSEE
- メール:Mireille Cossee <mireille.cossee@inserm.fr>
-
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 神経科医または小児神経科医が患者を追跡します。
- 先天性または進行性、近位または遠位ミオパシーの小児または成人
- 病原性の可能性がある TTN 遺伝子のバリアントの NGS 分析による同定
- 以前に行われた筋生検
- -患者の収集(または未成年の場合は彼の法定代理人の1人)本研究への参加および必要な生物学的材料(筋肉)の収集に対する非反対
- 社会保障制度に加入している、またはその恩恵を受けている患者
除外基準:
- 筋肉サンプリングの欠如
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースのみ
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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チチノパシーが疑われるミオパシーの患者
1つまたは複数の潜在的に病原性のTTNバリアントが以前に特定されているミオパチーの患者(インデックスケースおよび関連ケースが影響を受ける)。
以前に行われた筋生検
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タンパク質のC-terおよびN-Terに対する特異的抗体を用いた巨大タンパク質のウエスタンブロット分析
特定のウエスタンブロットおよびインビトロ試験によるいくつかの相互作用タンパク質の分析。
以前にウェスタンブロッティングに使用されたサンプルは、質量分析分析に供されます。
私たちのコホートにおけるチチノパチー患者の筋肉遺伝子発現をRNAseqによって分析する
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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タイチンタンパク質の相対量の測定
時間枠:入学
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ウェスタンブロットによる評価: 正常かどうか、異常がある場合は特徴付け
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入学
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タイチンタンパク質の相対サイズの測定
時間枠:入学
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ウェスタンブロットによる評価: 正常かどうか、異常がある場合は特徴付け
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入学
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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相互作用するタンパク質への影響の測定
時間枠:2年間
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ウエスタンブロットによる評価:正常か否か
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2年間
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タイチン転写産物に対する TTN バリアントの結果の測定
時間枠:2年
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筋肉生検からのRT-PCR研究による評価
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2年
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表現型-遺伝子型相関研究
時間枠:2.5年
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臨床生物学的データの相関
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2.5年
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疾患の異なる遺伝様式の分子基盤の分析
時間枠:2.5年
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完全な生物学的データと家族データとの相関の統合分析
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2.5年
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インビトロ研究による相互作用レベルの測定
時間枠:2年間
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ウエスタンブロットによる評価:正常か否か
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2年間
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患者の骨格筋におけるタイチンペプチドの量と組成に対するTTN変異体の影響を評価する
時間枠:2年間の間に
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質量分析法による
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2年間の間に
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患者の骨格筋におけるタイチン発現およびスプライシングに対する TTN バリアントの影響を評価する
時間枠:2年間の間に
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mRNA のポリ A テール選択プロトコルを使用する
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2年間の間に
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RNAseq データの発現解析により、筋肉遺伝子発現レベルに対する TTN バリアントの影響を評価します。
時間枠:2年間の間に
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発現解析は、R ソフトウェアおよび DESeq2 ソフトウェアを使用して実行できます。
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2年間の間に
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筋肉タンパク質パートナーに対する TTN バリアントの影響を評価します。
時間枠:2年間の間に
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定量的プロテオミクス分析、質量分析により、患者の筋肉内の筋肉タンパク質の量、全体的なタンパク質プロファイルを評価できるようになります。
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2年間の間に
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- RECHMPL18_0077
- 2018-A02287-48 (その他の識別子:ANSM)
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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