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Aperfeiçoamento em DIAgnóstico e Estudos de Correlação Fenótipo-genótipo em Pacientes com MIOPATIA com Suspeita de TITinopatia (DIAMYOTIT)

23 de fevereiro de 2024 atualizado por: University Hospital, Montpellier
Devido ao uso generalizado de NGS, o TTN está emergindo como um dos principais genes causadores de distúrbios neuromusculares, com alta heterogeneidade clínica. Os mecanismos subjacentes à variabilidade fenotípica e ao modo de herança (recessivo ou dominante) das titinopatias são pouco compreendidos. Envolvem as funções estruturais primordiais da titina na formação e estabilidade do sarcômero, bem como suas interações com outras proteínas. Identificamos por NGS, em pacientes com miopatia esquelética (com ou sem cardiomiopatia), várias variantes de TTN potencialmente causadoras da doença. Os objetivos específicos do presente projeto são a implementação de estudos funcionais (transcritos, análises de proteínas, estudos de interação proteína-proteína in vitro) para avaliar o efeito de variantes TTN nos transcritos e na proteína para realizar estudos de correlação fenótipo-genótipo. Participamos da "rede titina" nacional e dos esforços internacionais para o entendimento das bases moleculares das titinopatias. A caracterização genômica abre caminho para o desenvolvimento de modelos celulares de titinopatia, derivados de biópsias de pacientes. Este também é um primeiro passo obrigatório para a concepção de novas abordagens terapêuticas.

Visão geral do estudo

Descrição detalhada

As titinopatias são miopatias esqueléticas e cardíacas hereditárias devido à alteração da titina, uma proteína elástica gigante do sarcômero. Devido ao uso generalizado de sequenciamento de próxima geração (NGS), o gene titina (TTN) está emergindo como um dos principais genes causadores de distúrbios neuromusculares (DNMs), com alta heterogeneidade clínica e alélica. Os mecanismos subjacentes à variabilidade fenotípica e ao modo de herança recessivo ou dominante das titinopatias são pouco compreendidos. Envolvem as funções estruturais primordiais da titina na formação e estabilidade do sarcômero, bem como suas interações com outras proteínas. Os efeitos das variantes no TTN são variáveis, silenciosos, recessivos ou dominantes, e as ferramentas de bioinformática não são realmente eficientes para a interpretação de seu impacto funcional, tornando-os extremamente difíceis de interpretar. Além disso, as variantes TTN são muito frequentes na população em geral. Devido ao enorme tamanho (3700kD) e complexidade da titina, as análises das consequências das variantes TTN em transcritos e proteínas não são realizadas comumente. Existem poucas equipes na comunidade internacional, mas nenhuma equipe na França, que propõe análises de Western-blot (WB) na titina como teste diagnóstico. Além disso, este teste permite confirmar o diagnóstico apenas para titinopatias recessivas por mutações truncadas, que são situações raras (

Este projeto vem de nossos resultados de diagnóstico NGS e será a continuação de um projeto financiado pela AFM em andamento (aplicação 19958). Identificamos por NGS, em pacientes com miopatia esquelética (com ou sem cardiomiopatia), várias variantes de TTN potencialmente causadoras de doença. Graças ao projeto financiado pela AFM, analisamos as consequências de algumas variantes do TTN no splicing e atualmente estamos implementando condições experimentais para realizar o titin WB. Além disso, observamos que a maioria das variantes não truncadas em TTN suspeitas de serem patogênicas estão localizadas em domínios de titina interagindo com a cadeia pesada de miosina (MHC). Na hipótese de que possam ter efeitos deletérios na estabilidade das interações entre titina e MHC no sarcômero, planejamos implementar testes funcionais para avaliar suas consequências nas interações titina-miosina.

Os objetivos específicos do presente projeto serão a implementação de estudos funcionais para avaliar o efeito das variantes TTN nos transcritos e na proteína, a fim de melhorar a abordagem diagnóstica e realizar estudos de correlação com os modos de herança e os fenótipos. O aspecto inovador do projeto é a combinação de várias abordagens moleculares e bioquímicas no RNA (avaliação dos efeitos na transcrição e/ou splicing em transcritos de titina no músculo esquelético de pacientes), proteína (avaliação dos efeitos de todas as variantes de TTN na quantidade de titina e tamanho, por análises de WB em biópsias musculares) e interações proteína-proteína (avaliação do impacto patogênico de variantes TTN localizadas em domínios de interação titina-MHC em interações com MHC), que implementaremos com base em tecnologias relatadas em projetos de pesquisa acadêmica . A força do nosso projeto também se baseia na nossa robusta rede com neurologistas, neuropediatras, patologistas e outros especialistas em biologia, dentro da organização em um centro de referência inter-regional de DNMs e em uma rede nacional de titinopatias, e a implicação no projeto de um neurologista (Dr. Morales) através de sua tese de doutorado, para realizar estudos de correlações fenótipo-genótipo.

Estudos funcionais das variantes identificadas no gene TTN devem ter forte impacto no diagnóstico dos pacientes, o que é importante para seu manejo e aconselhamento genético familiar. Os testes implementados estarão disponíveis para a rede francesa de titinopatias. Isso deve resolver o diagnóstico de um grande número de pacientes sem diagnóstico claro e especificar a frequência do envolvimento de titinopatias nas miopatias. A melhoria do diagnóstico das titinopatias terá altos impactos socioeconômicos porque reduzirá o custo devido a testes diagnósticos iterativos.

Os estudos de correlação fenótipo-genótipo permitirão ampliar o espectro mutacional e clínico das titinopatias e participar do esforço internacional de compreensão das bases moleculares das titinopatias, primeiro passo obrigatório para a definição de abordagens terapêuticas. Além disso, a confirmação genética abre caminho para o desenvolvimento de modelos celulares de titinopatia, derivados de tecidos de pacientes. Esses modelos servirão de base para estudos proteômicos e outros estudos funcionais para decifrar os mecanismos das titinopatias e apontar vias metabólicas que possam ser alvo de terapêutica farmacológica.

Por estas razões, a presente aplicação constituirá um desenvolvimento importante, original e inovador para contribuir para o diagnóstico e para o conhecimento das bases moleculares das titinopatias.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Estimado)

50

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

Estude backup de contato

Locais de estudo

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Filho
  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

pacientes com suspeita de titinopatia

Descrição

Critério de inclusão:

  • Paciente acompanhado por neurologista ou neurologista pediátrico.
  • Criança ou adulto com miopatia congênita ou progressiva, proximal ou distal
  • Identificação por análise NGS de variante(s) no(s) gene(s) TTN potencialmente patogênico(s)
  • Biópsia muscular realizada anteriormente
  • Coleta da não oposição do paciente (ou de um de seus representantes legais, se menor) em participar do presente estudo e para a coleta do material biológico (músculo) necessário
  • Doente inscrito ou a beneficiar de um regime de segurança social

Critério de exclusão:

  • Ausência de amostragem muscular

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Modelos de observação: Caso-somente
  • Perspectivas de Tempo: Prospectivo

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Pacientes com miopatia com suspeita de titinopatia
Pacientes com miopatia em que uma ou mais variantes potencialmente patogênicas de TTN foram previamente identificadas (casos índices e casos relacionados afetados). Biópsia muscular realizada anteriormente
Análise de Western-blot de uma proteína gigante, com anticorpos específicos direcionados contra C-ter e N-Ter da proteína
Análises de várias proteínas em interação por testes específicos de Western-blot e in-vitro.
amostras previamente utilizadas para western blotting serão submetidas à análise por espectrometria de massa
analisar a expressão gênica muscular em pacientes com titinopatias em nossa coorte por RNAseq

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Medição da quantidade relativa de proteína titina
Prazo: inscrição
Avaliado por Western blot: normal ou não, caracterização de anomalias se houver
inscrição
Medição do tamanho relativo da proteína titina
Prazo: inscrição
Avaliado por Western blot: normal ou não, caracterização de anomalias se houver
inscrição

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Medição das consequências em proteínas que interagem
Prazo: durante 2 anos
Avaliação por Western Blot: normal ou não
durante 2 anos
Medição das consequências de variantes TTN em transcrições de titina
Prazo: 2 anos
Avaliação por estudos de RT-PCR de biópsias musculares
2 anos
Estudos de correlação fenótipo-genótipo
Prazo: 2,5 anos
Correlação de dados clinicobiológicos
2,5 anos
Análise das bases moleculares dos diferentes modos de herança da doença
Prazo: 2,5 anos
Análises integradas dos dados biológicos completos e correlação com os dados familiares
2,5 anos
Medição do nível de interações por estudos in vitro
Prazo: durante 2 anos
Avaliação por Western Blot: normal ou não
durante 2 anos
Avalie os efeitos das variantes do TTN na quantidade e composição dos peptídeos de titina no músculo esquelético do paciente
Prazo: durante 2 anos
Por espectrometria de massa
durante 2 anos
Avalie o impacto das variantes do TTN na expressão e splicing da titina no músculo esquelético do paciente
Prazo: durante 2 anos
usando o protocolo de seleção de cauda poli-A para mRNAs
durante 2 anos
Avalie o impacto das variantes TTN nos níveis de expressão gênica muscular por meio da análise de expressão de dados de RNAseq
Prazo: durante 2 anos
A análise de expressão pode ser realizada usando o software R e o software DESeq2.
durante 2 anos
Avalie os efeitos das variantes TTN nos parceiros de proteínas musculares.
Prazo: durante 2 anos
A análise proteômica quantitativa, a espectrometria de massa, nos permitirá avaliar a quantidade de proteínas musculares, o perfil proteico geral, nos músculos dos pacientes
durante 2 anos

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

5 de dezembro de 2019

Conclusão Primária (Estimado)

5 de dezembro de 2024

Conclusão do estudo (Estimado)

5 de maio de 2025

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

20 de junho de 2019

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

24 de junho de 2019

Primeira postagem (Real)

26 de junho de 2019

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimado)

28 de fevereiro de 2024

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

23 de fevereiro de 2024

Última verificação

1 de fevereiro de 2024

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Palavras-chave

Outros números de identificação do estudo

  • RECHMPL18_0077
  • 2018-A02287-48 (Outro identificador: ANSM)

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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